一部の変数のみの混合効果モデルで出力が欠落しているこんにちは、
私はミミズのさまざまな代謝物に対する金属イオンの影響をモデル化しようとしています-つまり、それは環境汚染の問題です。 私は、ワームごと（個人）ベースで、いくつかの異なる金属イオンといくつかの異なる代謝物の両方の濃度値を持っています。
ワームが多くの異なるサイトから収集され、代謝物の類似性と金属イオン濃度の両方の点でサイト内に明確なクラスターが存在するという事実によって、分析は複雑になります（この2番目は驚くべきことではありません。サイトは汚染されているため、特にサンプリングされました）。
固定効果として「金属」、ランダム効果として「サイト」と「サイトx金属」（「金属」と「代謝物」）を使用して、「モデルに合わせる」メニューを使用して、代謝物への影響を混合効果モデルとしてモデル化しようとしています。 「は連続変数であり、「サイト」はカテゴリです）。
さて、ここに私の質問があります。 一部の代謝物については、JMP出力は私が探しているもの、代謝物濃度に対する金属イオンの影響の有意性検定（「固定効果検定」）を提供しますが、他のいくつかの代謝物については、値を計算せず、 「。」を与える何が起こっているのかについて何か提案はありますか？ 欠測値がないため、サンプルと変数の数は同じです。これは、一部の従属変数に対する回答を提供し、他の変数に対する回答を提供しないというだけです。
ありがとうございました...
分析Re：一部の変数のみの混合効果モデルで出力が欠落しています添付ファイルまたはスクリーンキャプチャとして、データテーブルを共有できますか？
JMPプラットフォームを（写真として）共有することもできますか？ いくつかの効果を混乱させるような方法でモデルを指定した可能性があります。
サイトはランダム効果でブロッキングファクターとして機能していますか？ その解釈は、「サイト内の明確なクラスタリング」の意味ですか？
Re：一部の変数のみの混合効果モデルで出力が欠落しています添付ファイルまたはスクリーンキャプチャとして、データテーブルを共有できますか？
カットダウンバージョンをアップロードします。これは元のファイルと同じですが、ほとんどすべての変数を削除し、2つの比較を表すのに十分なだけ残しています。
（サンプルの2つ、行21と22は分析から除外されていることに注意してください。）
JMPプラットフォームを（写真として）共有することもできますか？ いくつかの効果を混乱させるような方法でモデルを指定した可能性があります。
はい、試してみます。ありがとうございます。これがあなたの意図したことであり、選択した関連オプションのスクリーンショットですか？
私にとって、示されている2つのY変数は、JMPが一方のP値を正常に計算し、もう一方のP値を計算しないという点で、異なる結果をもたらすことに注意してください。
サイトはランダム効果でブロッキングファクターとして機能していますか？ その解釈は、「サイト内の明確なクラスタリング」の意味ですか？
これは設計されたフィールドトライアルではありません。これらは先住民族からのワームであり、私たちが行って掘り起こしました。 （詳細については、サイトを「制御」と「予測」に分類します。この分類をモデル化することにも熱心ですが、現在の質問では、潜在的な汚染物質（金属）の関係をモデル化しようとしています。イオン）サイトごとではなく、ワームごとに。）金属イオンに基づいて分類する場合でも、ワームの代謝物濃度に基づいて分類する場合でも、サイトは互いに非常に異なります。たとえば、PCAなどの多変量アプローチによって明確に視覚化されます。 私は間違いなく、混合効果モデルの使用に精通しているとはまったく考えていません。ここでの私のアプローチは同僚との話し合いに基づいており、正当化されていないことをしようとしていることに驚かないでしょう。 NB彼らのコメントの1つは、ランダム効果の割り当てはカテゴリ変数に対してのみ本当に意味があるというものでしたが、JMPでは連続変数にランダム効果を割り当てることができます。これは良い考えではないと思いますか？
要約すると、PCAおよびPLSモデリングを使用して（サイトに基づいたクロス検証ホールドアウトセットを使用し、JMPとは異なるパッケージを使用して）機能する答えを得ることができます-多分、単変量のある種のリサンプリングアプローチを検討する必要があります分析も??）ですが、単変量の場合にも答えを得ることができるようにしたいと思います。3つの理由があります：
- 多変量解析と一緒に単変量解析を提示できるようにしたいと思います。
- 私が主に多変量解析を提示したとしても、潜在的なバイオマーカーとして重要な変数を引き出し、それらをより詳細に分析できることは非常に便利です。
- 何が起こっているのか理解できるようになりたいです！
どうもありがとう ...
