DOE inclusi gli eventi che si verificano o non si verificano in un determinato momento durante l'esecuzione sperimentaleCome integreresti gli eventi in un DOE? ad esempio, un evento si verifica il giorno 4 o il giorno 5 o non si verifica affatto. E se l'evento si verifica, c'è un intervallo in cui si verifica questo evento (30-100%).(supponiamo che tu possa controllare l'evento in modo che si verifichi o meno e in che misura, altrimenti non lo aggiungeresti al progetto, ma solo registrare se si è verificato e in che misura)
La semplice aggiunta di fattori aggiungerà l'entità dell'evento a ciascun esperimento, anche se l'evento non si verifica. A meno che tu non aggiunga combinazioni non consentite.
Esiste un modo migliore, più efficiente o con più potenza? ad esempio usando le covariate?
Re: DOE compresi gli eventi che si verificano o non si verificano in un determinato momento durante l'esecuzione sperimentale@SamGardner : Grazie, l'esperimento del pollo con gli enzimi rispecchiava il problema, anche se i loro enzimi sono Giorni in cui si verifica uno spostamento di temperatura e Log Dose è la temperatura a cui viene spostato.
Ho creato 3 diverse opzioni di design (in allegato). Sebbene i lavori nidificati, penso che sia più semplice creare un set candidato e utilizzarlo, soprattutto se sono presenti parametri di processo aggiuntivi.
La sfida principale che rende questo complicato è rimuovere i termini del modello che implicherebbero effetti dipendenti lineari dovuti alla configurazione nidificata. Spero di averlo fatto correttamente nei miei esempi qui. Che tu possa prendere questo come punto di partenza e perfezionare le tue esigenze.
Ci sono 3 esempi, tutti hanno 3 fattori di processo aggiuntivi inclusi:
- CD CovariateDays.jmp ... ha un candidato impostato in una struttura simile all'impostazione nidificata Day4 (yes/no), Day5 (yes/no), Temp (37 se entrambi sono 0, altrimenti tra 33 e 35 e no Day4 e Day5 a 1 allo stesso tempo
- CD CovariatesSimple.jmp ... ha un candidato impostato con solo DayNr e Temp
- CD NestedFactors.jmp ... Configurazione nidificata utilizzando Day4, Day5 e Temp
- ScriptDesigns.jsl ... i tre disegni come script
- CovariateDays.jmp e CovariatesSimple.jmp ... Tabelle covariate se vuoi impostare il design da zero.
Re: DOE compresi gli eventi che si verificano o non si verificano in un determinato momento durante l'esecuzione sperimentaleGrazie per tutti i suggerimenti, ne discuterò ulteriormente con il cliente e fornirò un aggiornamento probabilmente entro le prossime due settimane.@SamGardner Darò un'occhiata a questo documento e potrei tornare in caso di domande.
Re: DOE compresi gli eventi che si verificano o non si verificano in un determinato momento durante l'esecuzione sperimentaleC'è un approccio per farlo, descritto in uno dei documenti di Brad Jones: https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/00401706.2018.1562986
Non ho tempo in questo momento per prendere in giro ed esempio, ma se vuoi posso guidarti, ho usato questo approccio in precedenza.
Re: DOE compresi gli eventi che si verificano o non si verificano in un determinato momento durante l'esecuzione sperimentalePerché non trattare il fattore del regime alimentare come categorico? Per l'analisi, è ancora possibile suddividere la %O2 di giorno, supponendo che i dati siano stati raccolti giornalmente.
Re: DOE compresi gli eventi che si verificano o non si verificano in un determinato momento durante l'esecuzione sperimentaleSembra inutilmente complicato. Non credo che sia necessario un vincolo. Solo una colonna di dati per il livello di ossigeno. Finché conosci la quantità presente (0 se assente) per ogni corsa, è solo un altro potenziale fattore. La regressione può gestirlo. Potrebbero non essere dati ottimali per stimare il modello previsto, ma dovrebbero funzionare.
Non conosco un metodo o uno strumento di principio per aumentare le colonne, solo le righe.
Re: DOE compresi gli eventi che si verificano o non si verificano in un determinato momento durante l'esecuzione sperimentaleSembra complicato, @martindemel .
Ho ricevuto domande come questa da persone del settore biofarmaceutico a monte, ad esempio la fermentazione. Parlano di diversi regimi di alimentazione. Non ho mai avuto una buona risposta per loro.
Potrebbe essere gestito come una variabile di input funzionale. Ma potrebbe essere troppo complicato.
Penso che dipenda da quanti regimi alimentari diversi vogliono esplorare. Potrebbe essere più semplice codificarli come diversi livelli di un singolo fattore categorico. Ma ciò dipenderebbe dalle domande a cui stanno cercando di rispondere.
Scusate. Non sono sicuro che questo aiuti molto! Sarò interessato a sapere cosa decidono di fare.
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Re: DOE compresi gli eventi che si verificano o non si verificano in un determinato momento durante l'esecuzione sperimentaleÈ più come iniziare il tuo esperimento che dura diciamo 1 settimana, e potresti aggiungere qualcosa al processo, come aggiungere un po' di ossigeno a una cultura. Potrebbe essere il giorno 4 o il giorno 5 o mai.Quindi è in qualche modo controllato quando o se lo aggiungi, ma non lo è dall'inizio. Quindi rimanendo con l'esempio dell'ossigeno. I primi 3 giorni l'ossigeno sarebbe dello 0% e poi il giorno 4, ad esempio, verrà aggiunto il 40% (del potenziale livello di ossigeno del 100%). In un'altra corsa non c'è affatto ossigeno, e in un'altra corsa il giorno 5, ad esempio il 60%, e così via.
Capisco che suggerisci di dire se non ci sarà un evento (aggiunta di ossigeno), quindi usa una quantità dello 0%. Per fare ciò occorrerebbero per il giorno 3 livelli (0,4,5) e una combinazione non consentita (se giorno == 4 o 5, allora importo == 0 non consentito). E un detto (se giorno == 0, allora importo!=0 non consentito)?
Re: DOE compresi gli eventi che si verificano o non si verificano in un determinato momento durante l'esecuzione sperimentaleMartino,
Stai parlando di utilizzare un fattore non controllato, che viene compilato dopo l'esecuzione?
Puoi usare 0% per il caso di nessun evento?