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DOE, y compris les événements qui se produisent ou non à un certain moment au cours de l'exécution expérimentale

Comment intégreriez-vous des événements dans un DOE ? par exemple un événement se produit le jour 4 ou le jour 5 ou pas du tout. Et si l'événement se produit, il existe une plage dans laquelle cet événement se produit (30 à 100 %).(supposons que vous pouvez contrôler l'événement pour qu'il se produise ou non et dans quelle mesure, sinon vous ne l'ajouteriez pas à la conception, mais enregistrez simplement s'il s'est produit et dans quelle mesure)

Le simple fait d'ajouter des facteurs ajoutera l'étendue de l'événement à chaque expérience, même si l'événement ne se produit pas. Sauf si vous ajoutez des combinaisons non autorisées.

Existe-t-il un meilleur moyen, plus efficace ou avec plus de puissance? par exemple en utilisant des covariables ?

 

Re : DOE, y compris les événements qui se produisent ou non à un certain moment pendant l'exécution expérimentale

@SamGardner : Merci, l'expérience du poulet avec les enzymes reflétait le problème, bien que leurs enzymes soient des jours où un changement de température se produit, et la dose logarithmique est la température à laquelle elle est déplacée.

J'ai créé 3 options de conception différentes (ci-jointes). Bien que l'imbrication fonctionne, je pense qu'il est plus facile de créer un ensemble de candidats et de l'utiliser, surtout s'il existe des paramètres de processus supplémentaires.

Le principal défi qui rend cela compliqué est de supprimer les termes du modèle qui impliqueraient des effets dépendants linéaires en raison de la configuration imbriquée. J'espère que je l'ai fait correctement dans mes exemples ici. Puissiez-vous prendre cela comme point de départ et affiner vos besoins.

Il y a 3 exemples, tous ont 3 facteurs de processus supplémentaires inclus :

• CD CovariateDays.jmp ... a un ensemble candidat dans une structure similaire à la configuration imbriquée Jour4 (oui/non), Jour5 (oui/non), Temp (37 si les deux sont 0, sinon entre 33 et 35, et non Jour4 et Day5 à 1 en même temps
• CD CovariatesSimple.jmp ... a un candidat défini avec juste DayNr et Temp
• CD NestedFactors.jmp ... Configuration imbriquée utilisant Day4, Day5 et Temp
• ScriptDesigns.jsl ... les trois designs sous forme de scripts
• CovariateDays.jmp et CovariatesSimple.jmp ... Tables de covariables si vous souhaitez configurer la conception à partir de zéro.

 

 

 

Re : DOE, y compris les événements qui se produisent ou non à un certain moment pendant l'exécution expérimentale

Merci pour toutes vos suggestions, je vais en discuter plus en détail avec le client et fournir une mise à jour probablement dans les deux prochaines semaines.@SamGardner Je vais jeter un œil à ce document et je reviendrai si j'ai des questions.

Re : DOE, y compris les événements qui se produisent ou non à un certain moment pendant l'exécution expérimentale

Il existe une approche pour ce faire, décrite dans l'un des articles de Brad Jones : https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/00401706.2018.1562986

Je n'ai pas le temps pour le moment de faire des maquettes et des exemples, mais si vous voulez, je peux vous guider, j'ai déjà utilisé cette approche.

Re : DOE, y compris les événements qui se produisent ou non à un certain moment pendant l'exécution expérimentale

Pourquoi ne pas traiter le facteur régime alimentaire comme catégorique ? Pour l'analyse, vous pouvez toujours ventiler le %O2 par jour, en supposant que les données ont été collectées quotidiennement.

Re : DOE, y compris les événements qui se produisent ou non à un certain moment pendant l'exécution expérimentale

Cela semble inutilement compliqué. Je ne pense pas qu'une contrainte soit nécessaire. Juste une colonne de données pour le niveau d'oxygène. Tant que vous connaissez le montant présent (0 si absent) pour chaque course, ce n'est qu'un autre facteur potentiel. La régression peut le gérer. Ce ne sont peut-être pas des données optimales pour estimer le modèle prévu, mais cela devrait fonctionner.

Je ne connais pas de méthode ou d'outil de principe pour augmenter les colonnes, seulement les lignes.

Re : DOE, y compris les événements qui se produisent ou non à un certain moment pendant l'exécution expérimentale

Cela semble compliqué, @martindemel .

J'ai eu des questions comme celle-ci de la part de gens de la biopharmacie en amont, c'est-à-dire de la fermentation. Ils parlent de différents régimes alimentaires. Je n'ai jamais eu de bonne réponse pour eux.

Il pourrait être traité comme une variable d'entrée fonctionnelle. Mais cela pourrait être trop compliqué.

Je pense que cela dépend du nombre de régimes alimentaires différents qu'ils veulent explorer. Il serait peut-être plus simple de les coder comme différents niveaux d'un seul facteur catégoriel. Mais cela dépend des questions auxquelles ils essaient de répondre.

Pardon. Je ne sais pas si cela aide beaucoup ! Je serai intéressé de savoir ce qu'ils décident de faire.

Phil

 

Re : DOE, y compris les événements qui se produisent ou non à un certain moment pendant l'exécution expérimentale

C'est plus comme si vous commenciez votre expérience qui dure disons 1 semaine, et vous pourriez ajouter quelque chose au processus, comme ajouter de l'oxygène à une culture. Cela pourrait être le jour 4 ou le jour 5 ou jamais.Donc, c'est en quelque sorte contrôlé quand ou si vous l'ajoutez, mais ce n'est pas depuis le début. Restons donc avec l'exemple de l'oxygène. Les 3 premiers jours, l'oxygène serait de 0 %, puis le jour 4, par exemple, 40 % (du niveau potentiel d'oxygène de 100 %) seront ajoutés. Dans un autre passage, il n'y a pas d'oxygène du tout, et dans un autre passage au jour 5, par exemple 60 %, et ainsi de suite.

Je comprends que vous suggérez de dire s'il n'y aura pas d'événement (ajout d'oxygène), puis utilisez une quantité de 0 %. Pour ce faire, il faudrait pour le jour 3 niveaux (0,4,5) et une combinaison non autorisée (si jour == 4 ou 5, alors montant == 0 non autorisé). Et un dicton (si jour == 0, alors montant !=0 non autorisé) ?

 

 

Re : DOE, y compris les événements qui se produisent ou non à un certain moment pendant l'exécution expérimentale

Martin,

Parlez-vous d'utiliser un facteur non contrôlé, qui est rempli après la course ?

Pouvez-vous utiliser 0 % en cas d'absence d'événement ?