En 1854, une crise de santé publique survenait à Soho, à Londres, avec une épidémie de choléra dans le quartier autour de Broad Street. En discutant avec les résidents, le médecin anglais John Snow soupçonnait que la source de contamination était la désormais tristement célèbre pompe à eau de Broad Street. Il a donc fait retirer la poignée de la pompe. Plus tard, il a quantifié l’épidémie à l’aide d’une carte visualisant la source de la contamination, ce qui a confirmé que la pompe à eau de Broad Street était à l’origine du problème. En résolvant ce mystère de santé publique, Snow est désormais célébré comme l’un des fondateurs de l’épidémiologie moderne. Compte tenu des mêmes points de données aujourd'hui, à quoi ressemblerait l'exploration des données dans la perspective du 21 e siècle ?
Carte originale de John Snow, dessinée et lithographiée par Charles Cheffins.
Source : https://en.wikipedia.org/Wiki/John_snow
Emplacement actuel sur Broadwick Street.
Source:https://en.wikipedia.org/wiki/John_Snow
Les points de données de la carte originale de Snow incluent l'emplacement et le nombre de cas de choléra dans chaque résidence, ainsi que l'emplacement des pompes à eau à proximité. Broad Street s'appelle désormais Broadwick Street dans l'actuelle Londres. En traçant la longitude et la latitude des points dans le Graph Builder de JMP, nous obtenons une visualisation des résidences signalant des cas, ainsi que des emplacements des pompes à eau.
Dans différentes itérations de Snow de la carte originale, il a indiqué la densité des cas de choléra, à la fois sous forme de barres et de points sur la carte. À première vue, en faisant en sorte que la taille du marqueur indique le nombre de cas (comme le montre la carte ci-dessous), nous commençons à voir des emplacements d'intérêt, mais il est difficile de déterminer la taille relative des marqueurs circulaires pour indiquer la densité du cas.
L'ensemble de données avec lequel nous travaillons contient les adresses spécifiques des ménages concernés, ce qui facilite l'extraction du nom de la rue. En y regardant de plus près, nous constatons qu’il y a quatre rues qui comptent plus de 5 % du total des cas.
En utilisant la liaison dynamique dans JMP en sélectionnant les quatre barres dans le graphique, les rues sélectionnées sont mises en évidence sur notre carte. Remarquez l'emplacement de la pompe à eau sur Broadwick Street, anciennement Broad Street. Une image plus claire se dessine.
Aujourd’hui, nous disposons d’outils supplémentaires qui peuvent montrer la densité des cas plus efficacement que les points seuls ne le pourraient. Pour afficher les modèles de densité, une densité non paramétrique peut être ajoutée à la carte à l'aide de la plateforme Fit Y by X de JMP. Les courbes de niveau quantiles sont ajoutées à intervalles de 5 %. Les courbes de densité montrent clairement le point chaud des cas de choléra, avec la pompe à eau de Broad Street en plein centre.
Les techniques de visualisation modernes qui révèlent la densité permettent d'explorer ces données du 19 e siècle d'une manière qui n'était pas accessible à Snow. Cependant, l’objectif primordial de la représentation graphique de cet ensemble de données est le même aujourd’hui qu’à l’époque de Snow : communiquer de manière concise que la pompe à eau de Broad Street marquait l’endroit de l’épicentre de l’épidémie.
Les références
Images : https://en.wikipedia.org/wiki/John_Snow
La source de données:http://blog.rtwilson.com/updated-snow-gis-data/
