Comment analyser des comparaisons appariées avec un contrôle interneBonjour,
Je suis relativement nouveau dans JMP (j'utilise actuellement JMP 15) et j'ai du mal à identifier comment analyser des comparaisons appariées où chaque sujet de test dispose d'une mesure de contrôle et d'une mesure d'intervention à chaque instant.
L'analyse en cours examine l'évolution de la variable continue mesurée sur le visage sur une période de temps définie. Nous savons par expérience que cette variable fluctue dans le temps quelle que soit l'intervention. Le visage est donc divisé à gauche et à droite et l'intervention est appliquée à un côté du visage et l’autre côté non traités comme contrôle interne. Par conséquent, chaque sujet dispose de 2 mesures à chaque instant « intervention » et « contrôle », puis est mesuré au départ et à T1 après une durée de traitement prédéfinie.
J'ai inclus un ensemble factice de données en pièce jointe qui montre comment les données brutes sont présentées.
Je souhaite effectuer une analyse qui nous dira s'il existe une différence significative entre les mesures de contrôle et de base au sein des traitements, puis une différence significative de changement au fil du temps entre les traitements.
Lorsque j'utilise la méthode d'analyse des paires appariées, je récupère la comparaison de chaque traitement avec la ligne de base, mais je ne vois pas de moyen d'obtenir également l'analyse intervention/contrôle car les données sur lesquelles nous travaillons sont confidentielles.
Dois-je plutôt utiliser l'analyse du modèle d'ajustement pour cette comparaison. Si oui, comment dois-je configurer mon modèle pour obtenir une comparaison appariée plutôt qu'une analyse non appariée ?
@Emmanuel_Romeu
Mélange et nettoyage des donnéesIngénierie Qualité et ProcédésRe : Comment analyser des comparaisons appariées avec un contrôle interneBonjour Malcolm,
les résultats me semblent similaires pour les deux, c'est-à-dire les modèles mixtes avec structure de covariance résiduelle comme instance par rapport à la méthode REML
comme souligné ci-dessous
Le modèle mixte vous aidera à sélectionner la structure de covariance la plus appropriée basée sur l'AICc.
Re : Comment analyser des comparaisons appariées avec un contrôle interneVoir Tables > Fractionner. Cette commande créera deux nouvelles colonnes de valeurs de réponse basées sur les niveaux de votre colonne indiquant le contrôle ou le traitement.
Re : Comment analyser des comparaisons appariées avec un contrôle interneJe pense avoir trouvé ma solution dès le premier message de Julian en réponse à cette question de 2017 Résolu : Interprétation de la mesure répétée MANOVA - Communauté d'utilisateurs JMP
J'ai exécuté un nouvel ajustement des moindres carrés avec des effets de sujet aléatoires imbriqués dans le traitement, en utilisant un rapport minimal avec REML comme méthode et cela semble me donner ma différence entre les traitements dans les tests à effet fixe et également mon T1vsT0 pour chaque traitement dans le section point de temps*traitement.
J'ai réattaché le fichier Dummy.jmp avec cette deuxième analyse enregistrée. Ai-je tout interprété correctement ?
Re : Comment analyser des comparaisons appariées avec un contrôle interneBonjour Mark,
Désolé de ne pas avoir répondu plus tôt, c'est le premier jour où j'ai accès à JMP depuis votre réponse. J'apprécie que les paires appariées soient basées sur les différences, étant donné que mes données brutes contiennent toutes les réponses dans une seule colonne, puis une colonne définissant à quel moment se situe une ligne et une deuxième colonne définissant si la réponse provient d'un traitement ou d'un contrôle. J'essaie de comprendre combien de pré-traitement des données je devrai effectuer avant d'exécuter les comparaisons statistiques.
J'ai maintenant 3 exemples JMP différents de mes données qui, je l'espère, démontreront un peu mieux le problème que je rencontre.
Factice 1 - Les données de réponse dans une seule colonne et donc les paires appariées ou la manova ne sont pas possibles. J'ai enregistré une comparaison factorielle complète des moindres carrés du point de temps et du traitement qui me donne des valeurs p pour T1Control v T0control et T1invervention v T0Intervention. Cependant, ce sont des comparaisons non appariées et ne conviennent pas à mon ensemble de données.
Factice 2 - Données de réponse divisées en 2 colonnes T0 et T1 avec une 3ème colonne définissant le type de traitement. J'ai enregistré des mesures répétées de manova qui, lorsque je regarde la section intra-sujets, je pense comprendre, démontre un changement significatif par rapport à la ligne de base sur l'ensemble des données (traitées et contrôlées ensemble) et une différence significative entre l'effet temporel pour le traitement et le contrôle. Mais les données ne me donnent pas de valeurs p distinctes pour le contrôle T1vsT0 et le traitement T1vsT0.
Factice 3 - Données de réponse divisées en 4 colonnes T0control, T1control, T0intervention, T1intervention. J'ai enregistré une analyse par paires appariées utilisant les 4 colonnes, ce qui me donne les valeurs p d'analyse appariée distinctes pour le contrôle T1vsT0 et le T1vsT0 traité, mais ne me donne pas l'analyse de savoir si la différence moyenne T1-T0 est significativement différente entre l'intervention et le contrôle.
Je suis sûr qu'il me manque quelque chose d'une évidence aveuglante, mais ce que je recherche, c'est un moyen d'obtenir la différence d'effet temporel entre le traitement et le contrôle de la manova Dummy 2 et la différence entre les points temporels pour chaque traitement de Dummy 3, le tout dans un seul ensemble. d'analyse.
J'espère que cela rend les choses un peu plus claires.
Re : Comment analyser des comparaisons appariées avec un contrôle interneBonjour Emmanuel,
J'ai examiné les données et il me semble que l'analyse que vous avez partagée effectue des comparaisons non appariées entre T0 et T1. Ai-je bien interprété cela ? Pour mes 8 mesures d'intervention, je me suis assuré que chacune représentait une amélioration, mais qu'il y avait une grande variation dans le point de départ de base, car c'est ce que nous constatons souvent dans nos ensembles de données. Mes 8 sujets ont eu des améliorations de -11, -5, -5, -8, -6, -7 et -3 mais le point temporel*intervention de traitement T1 par rapport à l'intervention T0 donne une valeur ap = 0,71. Je m'attendais à ce qu'une comparaison par paires voie la valeur p beaucoup plus proche du seuil de 0,05 avec les données telles qu'elles ont été créées.
Cordialement
Malcolm
Re : Comment analyser des comparaisons appariées avec un contrôle interneLes tests par paires appariées sont généralement basés sur la différence et non sur les réponses individuelles. Sélectionnez la colonne de données de mesure de contrôle et la colonne de données de mesure d'intervention, faites un clic droit en haut de l'une d'elles et sélectionnez Nouvelle colonne de formule > Combiner > Différence ou Différence inversée, en fonction de l'ordre de ces deux colonnes dans votre tableau de données. Vous souhaitez soustraire la mesure de contrôle de la mesure d'intervention. Utilisez maintenant la colonne de données de différence dans le rôle Y.
Cette approche a-t-elle du sens ? Est-ce adapté à vos besoins ?
Re : Comment analyser des comparaisons appariées avec un contrôle interneBonjour Emmanuel, merci pour le complément d'information. Il semble que j'aie davantage de preuves pour mes parties prenantes expliquant pourquoi JMPpro serait un achat précieux, car la plupart de nos données de test sont présentées dans ce type de format.
Re : Comment analyser des comparaisons appariées avec un contrôle interneBonjour Mark,
Désolé, je travaille à domicile aujourd'hui et je n'ai donc pas accès à JMP, c'est pourquoi mes données factices sont au format Excel, je mettrai à jour le tableau de données au format JMP lorsque j'aurai à nouveau accès au logiciel.
Pouvez-vous simplement confirmer que ma compréhension de la note technique est correcte et que pour mon exemple, je devrais essayer d'utiliser une approche multivariée où les mesures T0 et T1 sont dans des colonnes séparées mais alignées par ligne pour chaque sujet et type de traitement et où les mesures répétées sont sélectionnées. ? Par conséquent, je crois comprendre qu'il n'y a aucun moyen d'effectuer l'analyse que je souhaite lorsque tous les points temporels sont dans la même colonne et attribués à un point temporel spécifique par une variable dans une autre colonne, est-ce exact ?
Re : Comment analyser des comparaisons appariées avec un contrôle interneBonjour Malcolm,
pour des mesures répétées, le modèle mixte (JMP Pro) est l'analyse appropriée. J'ai joint 2 analyses, résiduelle et non structurée, qui testent diverses structures de covariance, l'AICc inférieur devrait aider à décider laquelle est la plus appropriée (en tant que variable factice ici, je n'ai pas conclu). Emmanuelle
Re : Comment analyser des comparaisons appariées avec un contrôle interneTout d'abord, il s'agit de la communauté JMP, veuillez donc fournir des exemples dans un tableau de données JMP.
S'il te plait regarde cette note technique sur de telles analyses. Bien sûr, revenez avec d'autres questions si cela ne suffit pas.
