Importando archivo .chTengo un cliente interesado en analizar datos de cromatógrafo de gases; el formato de datos predeterminado es un archivo .ch. Alguien tiene experiencia trayendo este formato de datos. directamente en JMP? El archivo de datos de ejemplo es aquí .
Re: Importar archivo .ch@Bill_Worley , correcto. El cliente está analizando fluidos de fondo de pozo con el fin de comprender la corrosión de los componentes de petróleo y gas. Están tratando de comprender la relación entre la mezcla de fluidos de fractura antes de la inyección, la capacidad del fluido para inducir la producción de hidrocarburos a partir de un yacimiento y, lo más importante, para su tarea, cómo los fluidos in situ alteran la química de la mezcla según se cuantifica. a través del análisis del fluido recuperado en un esfuerzo por predecir la corrosión de los componentes del fondo del pozo con el tiempo. Es un desafío importante en el sector del petróleo y el gas, en parte porque los fluidos in situ varían de un pozo a otro y de una cuenca geológica a otra. Lo que era cierto "aquí" puede no serlo "allá". Este es un problema multimillonario. El desafío para nosotros (JMP) es que son muy reservados porque todo esto es propiedad intelectual muy valiosa.
Mi mejor suposición basada en la información limitada que me están brindando es: Prácticamente, están cocinando el fluido inyectado para cuantificar la presencia y concentración de hidrocarburos que se producirían o se habrían incorporado al fluido previo a la inyección, como agente productor del fluido, además de cuantificar la presencia de algún tipo de señal de corrosión.
Re: Importar archivo .chHola Phil,
Estuve jugando con este conjunto de datos desde el principio y tenía la impresión de que se trataba de una especie de mezcla de "prueba" de hidrocarburos de cadena corta y larga.Esa suposición se basa en @Peter_Polito Mencionando que la empresa se ocupa de petróleo, agua y fluidos de fractura.
Factura
Re: Importar archivo .chEse es un cromatograma muy desordenado. Tan desafiante como parece. Pero depende de lo que el cliente esté tratando de descubrir; sería interesante saberlo.
Re: Importar archivo .chPude descargar e instalar OpenChrom, importar el archivo .ch, exportarlo como un archivo .xy y luego importarlo a JMP.El proceso de descubrir la instalación y cómo importar con OpenChrom no fue tan sencillo como uno quisiera, pero una vez que sabes cómo hacerlo, es fácil.
Como su nombre lo indica, OpenChrom es de código abierto. Podríamos estudiar cómo funciona su importador de archivos .ch. También hubo referencias a archivos .m de Matlab que también existen. El código fuente de estos puede apuntar a una ubicación donde se describe el diseño del archivo y podríamos crear un complemento importador si este formato es común (como creo que es). Algunos otros ejemplos con más de un cromatograma empaquetados juntos de alguna manera serían útiles, ya que para JMP el gramo es solo una observación única.
Hice algunas pruebas básicas con los datos una vez que los cargué en FDE. Los P-Splines con 200 nudos son bastante inadecuados, pero tampoco me entusiasmó el modelo Wavelet encajado en el JMP 17 EA3.
Re: Importar archivo .chMe gusta la línea del enlace Open Babel que @briancorcoran compartido:
" Los químicos son un grupo muy imaginativo. Siguen pensando en nuevos formatos de archivo".
Creo que se trata más de los fabricantes de instrumentos que de los químicos imaginativos. Al tener su propio formato de archivo, ellos también pueden mantener su producto "pegajoso" ante sus clientes.
¿Alguien sabe por qué hay tantos formatos de archivos diferentes que los fabricantes de instrumentos quieren mantener alejados a los clientes y competidores?
No está de más poner esto en la lista de deseos, externos e internos.
Re: Importar archivo .chAprecio tu franqueza @briancorcoran y estoy de acuerdo en que no podemos hacerlo todo.
Re: Importar archivo .chSi observa una herramienta como Open Babel, que admite la importación de 84 formatos químicos, puede ver que resulta poco práctico para JMP hacer todos estos ( http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Overview.html ). Y, por cierto, Open Babel ni siquiera admite archivos .ch.Existe una herramienta que lo hace, https://laplicate.com/platform/openchrom, y eso es realmente experimental.
Por mucho que no me guste sugerir productos y herramientas alternativas, simplemente no hay manera de abordar todos los formatos de herramientas científicas que existen de manera significativa sin contratar a mucha gente para hacerlo.Ahora mismo, esa no es una opción.Entonces, quizás quieras sugerir algo como Lablicate.
Casi todos los foros terminan aconsejando a los usuarios que al final eliminen los archivos .CSV.Sé que a su cliente no le gusta esta opción, pero a menudo es un requisito utilizar los datos en herramientas más convencionales como JMP.
Brian Corcoran
Re: Importar archivo .ch@JeremyAshJMP la única información que el cliente ofrecería era que preferiría cargar archivos .ch directamente. Dado el tipo de trabajo que realizan estas personas (analizando agua, petróleo y fluidos de fractura producidos), probablemente sean una operación de gran volumen y les gustaría no tener que dar el paso iterativo de exportar cada archivo a un .csv.@Phil_Kay y @ian_jmp No sé explícitamente por qué quieren abrir archivos .ch directamente en JMP en lugar de un archivo de datos posprocesado (¿es posible tener un archivo .ch posprocesado? No lo sé), pero siempre he sentido que cuanto más podamos hacer que nuestros clientes trabajen en el entorno JMP, más pegajoso será JMP. De todos modos, no me sorprendería que usaran un método propietario para procesar sus datos sin procesar, por lo que las herramientas de posprocesamiento en ChemStation pueden ser discutibles. De todos modos, seguiré intentando sonsacarles información.
De todos modos, están tratando de resolver un problema que afecta a todas las empresas de producción y la solución que buscan variará según la geografía y la geología, por lo que este problema y el proceso que están utilizando para resolverlo es reproducible en casi todas las empresas de la industria.
¿Algún programador de scripts experto quiere colaborar en un complemento?Tomaré el primer trago/bocado/café la próxima vez que estemos todos juntos.
Re: Importar archivo .chHola Pedro.¿No es posible generar el cromatograma como csv? Esto es posible si utilizan el software OpenLab de Agilent: https://community.agilent.com/technical/software/m/videos/722?CommentId=c1e4cb78-1831-43c9-8cb5-84e28934148b
Re: Importar archivo .chAcerca de " JMP no tiene excelentes herramientas para el tipo de análisis que le gustaría hacer con cromatogramas sin procesar. "Entonces vale la pena decir que ha habido discusiones para tal vez solucionar este problema.Esa es una razón aún más para saber más sobre los casos de uso involucrados.
Re: Importar archivo .chParece que .ch es un formato de datos de Chemstation, el software proporcionado con el hardware de cromatografía HP/Agilent. Chemstation es muy conocida en el mundo de la cromatografía. Me interesaría saber por qué quieren llevar los datos de cromatografía directamente a JMP. Tal como están las cosas, JMP no tiene excelentes herramientas para el tipo de análisis que le gustaría hacer con cromatogramas sin procesar. La gente tiende a utilizar Chemstation para realizar el procesamiento de datos sin procesar (resta de líneas de base, selección de picos, integración de picos), lo que sería difícil en JMP.
Re: Importar archivo .chPuede que valga la pena echarle un vistazo. aquí . También vale la pena señalar esto a la atención de Gestión de Productos, ya que podría estar dentro del alcance de nuestros esfuerzos de "conector de datos". No estoy seguro de cuánto negocio adicional generaríamos si realmente pudiéramos hacer esto, pero parece que un complemento podría ser posible para alguien con el tiempo y las ganas.
Re: Importar archivo .chParece que es binario. Si tiene el diccionario de datos, podría escribirlo. Dicho esto, no sería inusual que se incorporara un poco de flexibilidad al diccionario de datos y que la creación de secuencias de comandos fuera una tarea ardua. Un buen ejemplo de esto es con los archivos LabView y STDF. Sé que se ha hablado de agregar conectores a JMP para poder abrir más archivos binarios de forma nativa. ¿Podría ser este un buen candidato?
