Importazione del file .chHo un cliente interessato ad analizzare i dati del gascromatografo; il formato dati predefinito è un file .ch. Qualcuno ha esperienza nel portare questo formato di dati direttamente in JMP? Il file di dati di esempio è Qui .
Ri: Importazione del file .ch@Bill_Worley , corretto. Il cliente sta analizzando i fluidi del pozzo allo scopo di comprendere la corrosione dei componenti di petrolio e gas. Stanno cercando di comprendere la relazione tra la miscela di fluidi fratturati prima dell'iniezione, la capacità del fluido di indurre la produzione di idrocarburi da un giacimento e, cosa più importante, rispetto al loro compito, in che modo i fluidi in situ alterano la chimica della miscela come quantificato attraverso l'analisi del fluido recuperato, nel tentativo di prevedere la corrosione dei componenti del fondo pozzo nel tempo. Si tratta di una sfida importante nel settore del petrolio e del gas, in parte perché i fluidi in situ variano da pozzo a pozzo e da bacino geologico a bacino: ciò che era vero “qui” potrebbe non essere vero “là”. Questo è un problema multimilionario. La sfida per noi (JMP) è che sono molto riservati perché si tratta di proprietà intellettuale di grande valore.
La mia ipotesi migliore basata sulle informazioni limitate che mi stanno fornendo è: in pratica, stanno cuocendo il fluido iniettato per quantificare la presenza e la concentrazione di idrocarburi che potrebbero essere prodotti o essere stati incorporati nel fluido pre-iniezione, come agente produttore del fluido, oltre a quantificare la presenza di una sorta di segnale di corrosione.
Ri: Importazione del file .chCiao Phil,
Stavo giocando con questo set di dati all'inizio e avevo l'impressione che si trattasse di una sorta di miscela "di prova" di idrocarburi a catena corta e lunga.Questa ipotesi è basata su @Pietro_Polito menzionando che l'azienda si occupa di petrolio, acqua e fluidi fratturati.
Conto
Ri: Importazione del file .chQuesto è un cromatogramma molto confuso. Più impegnativo che mai. Ma dipende da cosa il cliente sta cercando di scoprire: sarebbe interessante saperlo.
Ri: Importazione del file .chSono riuscito a scaricare e installare OpenChrom, importare il file .ch, esportarlo come file .xy e quindi importarlo in JMP.Il processo per capire l'installazione e come importare con OpenChrom non è stato così semplice come si vorrebbe, ma una volta che sai come farlo è facile.
Come dice il nome, OpenChrom è open source. Potremmo studiare come funziona l'importatore di file .ch. C'erano anche riferimenti a file Matlab .m che sono anch'essi disponibili. Il codice sorgente per questi potrebbe puntare a una posizione in cui è descritto il layout del file e potremmo mettere insieme un componente aggiuntivo di importazione se questo formato è comune (come penso che sia). Alcuni altri esempi con più di un cromatogramma assemblati insieme sarebbero in qualche modo utili, poiché per JMP il -grammo è solo una singola osservazione.
Ho eseguito alcuni test di base con i dati una volta caricati in FDE. Le P-Spline con 200 nodi sono piuttosto inadeguate, ma non ero entusiasta nemmeno del modello Wavelet inserito nel JMP 17 EA3.
Ri: Importazione del file .chMi piace la linea del collegamento Open Babel that @briancorcoran condiviso:
" I chimici sono un gruppo molto fantasioso. Continuano a pensare a nuovi formati di file."
Penso che sia più una questione di produttori di strumenti che di chimici che sono fantasiosi. Avendo il proprio formato di file, anche loro possono mantenere il loro prodotto "appiccicoso" ai propri clienti.
Qualcuno sa perché ci sono così tanti formati di file diversi da quelli che i produttori di strumenti vogliono tenere lontani clienti e concorrenti?
Non fa male inserirlo nella lista dei desideri, esterni e interni.
Ri: Importazione del file .chApprezzo il tuo candore @briancorcoran e sono d'accordo che non possiamo fare tutto.
Ri: Importazione del file .chSe si osserva uno strumento come Open Babel, che supporta l'importazione di 84 formati chimici, è possibile notare che diventa poco pratico per JMP eseguire tutte queste operazioni ( http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Overview.html ). E, a proposito, Open Babel non supporta nemmeno i file .ch.C'è uno strumento là fuori che fa, https://laplicate.com/platform/openchrom, e questo è davvero sperimentale.
Per quanto non mi piaccia suggerire prodotti e strumenti alternativi, non c'è modo per noi di affrontare tutti i formati di strumenti scientifici disponibili in modo significativo senza assumere molte persone per farlo.In questo momento, questa non è un'opzione.Quindi, potresti suggerire qualcosa come Lablicate.
Quasi tutti i forum finiscono per consigliare agli utenti di eliminare i file .CSV alla fine.So che al tuo cliente non piace questa opzione, ma spesso è necessario utilizzare i dati in strumenti più tradizionali come JMP.
Brian Corcoran
Ri: Importazione del file .ch@JeremyAshJMP l'unica informazione che il cliente ha offerto è che preferirebbe caricare direttamente i file .ch. Dato il tipo di lavoro svolto da queste persone (analisi dell'acqua prodotta, del petrolio e dei fluidi di fratturazione), si tratta probabilmente di un'operazione ad alto volume e vorrebbero non dover compiere il passo iterativo di esportare ogni file in un formato .csv.@Phil_Kay E @ian_jmp Non so esplicitamente perché vogliono aprire i file .ch direttamente in JMP anziché in un file di dati post-elaborato (è possibile avere un file .ch post-elaborato? Non lo so), ma ho sempre pensato che quanto più riusciamo a far lavorare i nostri clienti nell'ambiente JMP, tanto più JMP sarà appiccicoso. Non sarei sorpreso se utilizzassero comunque un metodo proprietario per elaborare i dati grezzi, quindi gli strumenti di post-elaborazione in ChemStation potrebbero essere discutibili. Indipendentemente da ciò, continuerò a cercare di pomparli per informazioni.
Indipendentemente da ciò, stanno cercando di risolvere un problema che affligge ogni società di produzione e la soluzione che cercano varierà in base all’area geografica e alla geologia, quindi questo problema e il processo che stanno utilizzando per risolverlo sono riproducibili in quasi tutte le aziende del settore.
Qualche scripter esperto vuole collaborare su un componente aggiuntivo?Prenderò il primo drink/boccone/caffè la prossima volta che saremo tutti insieme.
Ri: Importazione del file .chCiao Peter.Non è possibile generare il cromatogramma come CSV? Ciò è possibile se utilizzano il software OpenLab di Agilent: https://community.agilent.com/technical/software/m/videos/722?CommentId=c1e4cb78-1831-43c9-8cb5-84e28934148b
Ri: Importazione del file .chPer quanto riguarda " JMP non dispone di strumenti eccezionali per il tipo di analisi che vorresti eseguire con i cromatogrammi grezzi " allora vale la pena dire che ci sono state discussioni per risolvere questo problema.Quindi questo è un motivo in più per saperne di più sui casi d'uso coinvolti.
Ri: Importazione del file .chSembra che .ch sia un formato dati di Chemstation, il software fornito con l'hardware cromatografico HP/Agilent. Chemstation è molto conosciuta nel mondo della cromatografia. Sarei interessato a sapere perché vogliono importare i dati cromatografici direttamente in JMP. Allo stato attuale, JMP non dispone di ottimi strumenti per il tipo di analisi che si vorrebbe eseguire con i cromatogrammi grezzi. Le persone tendono a utilizzare Chemstation per eseguire l'elaborazione dei dati grezzi (sottrazione della linea di base, selezione dei picchi, integrazione dei picchi), cosa che sarebbe difficile in JMP.
Ri: Importazione del file .chPotrebbe valere la pena dare un'occhiata Qui . Vale anche la pena di portare questo aspetto all'attenzione del Product Management poiché potrebbe rientrare nell'ambito dei nostri sforzi di "connettore dati". Non sono sicuro di quanti affari extra frutteremmo se potessimo effettivamente farlo, ma sembra che un componente aggiuntivo potrebbe essere possibile per qualcuno con il tempo e l'inclinazione.
Ri: Importazione del file .chSembra che sia binario. Se disponi del dizionario dei dati, potrebbe essere creato tramite script. Detto questo, non sarebbe insolito se nel dizionario dei dati fosse incorporata un po' di flessibilità e lo scripting sarebbe un lavoro ingrato. Un buon esempio di ciò è con i file LabView e STDF. So che si è parlato dell'aggiunta di connettori a JMP in modo da poter aprire nativamente più file binari. Potrebbe essere un buon candidato?
