Come fare DOE con variabili dipendentiCiao,
Non sono sicuro che il mio DOE sia buono. Voglio confrontare due diverse piattaforme di coltura cellulare.
Ho due diverse piattaforme di coltura e ciascuna piattaforma ha gamme diverse di giri al minuto e volume di lavoro.
Ad esempio, piattaforme A e B (categoriale)
Per A, 100 giri al minuto - 200 giri al minuto / 100 ml
Per B, 300 giri al minuto - 400 giri al minuto / 25 ml
Inizialmente avevo due fattori come RPM1 (100 - 200 giri al minuto) e RPM2 (300 - 400 giri al minuto). Quindi, nel "modello" avevo RSM e rimuovevo fattori irrilevanti come RPM1*RPM2, RPM1*RPM1 e RPM2*RPM2. Ma non sono riuscito a rimuovere platform*rpm1 o platform*rpm2. Penso che in questo caso JMP eseguirà DOE per entrambe le piattaforme con due giri al minuto diversi, A* giri al minuto (100 giri al minuto - 400 giri al minuto).
Esistono modi in cui posso eseguire correttamente il DOE? Mi chiedo se posso rendere la variabile dipendente rpm1 sulla piattaforma A.
Progettazione di esperimentifinestreRi: Come fare DOE con variabili dipendentiLe varianze non sono zero, sembrano semplicemente zero perché l'asse y è ridimensionato per il confronto della piattaforma (che è gigantesco per Esegui separatamente). Se ridimensioni l'asse y, appariranno così:
La "RS" è un indicatore visivo degli effetti che fanno parte di un modello di superficie di risposta.
Ri: Come fare DOE con variabili dipendentiNon ho seguito l'intera discussione, ma se esegui esperimenti separati per ciascuna piattaforma per ogni raccomandazione, confrontare le piattaforme sarà impegnativo.
I livelli dovrebbero essere impostati distanti, quindi per il tuo numero di giri vorresti 100, 250 e 400. Le restrizioni sui livelli che possono essere eseguiti devono essere prese in considerazione quando si pianifica l'esperimento. Ancora una volta, se gli RPM dipendono dalla piattaforma, questa è una situazione nidificata.
Ri: Come fare DOE con variabili dipendentiMi scuso per il ritardo nel follow-up e grazie mille per gli esempi e la spiegazione!!
Non ho mai fatto il confronto DOE. JMP è fantastico!
Ho una breve domanda su questo fantastico confronto con il DOE. Esiste un profilo di varianza della previsione.
La varianza "Esegui separatamente" mostra un'ovvia differenza a seconda dei fattori, tuttavia, "Esegui come uno" non mostra alcuna varianza.
Ciò significa che una varianza di previsione inferiore o nulla rappresenta un DOE migliore?
Mi dispiace, un'altra cosa sul modello. Sugli effetti del modello di costrutto, qual è la "RS"? Ci sono alcuni fattori "RPM&RS" e "Volume&RS"
Ri: Come fare DOE con variabili dipendentiPuoi eseguire questa operazione come due DOE separati (uno per ciascuna piattaforma) o un DOE (dove RPM e volume vengono lasciati nei loro valori codificati e le impostazioni dei fattori vengono regolate in base alla piattaforma quando è necessario utilizzare i valori effettivi). L’approccio successivo sarà più efficiente ma più difficile da interpretare.
2 RSM (uno per ciascuna piattaforma) richiedono 12 esecuzioni per stimare gli effetti e esecuzioni aggiuntive per stimare il rumore sperimentale (ne hai bisogno per i test statistici)
1 RSM (che combina le piattaforme) con due effetti aggiuntivi per catturare le differenze di curvatura tra le piattaforme per RPM e Volume richiede 11 esecuzioni più esecuzioni per stimare il rumore sperimentale.
Diciamo di confrontare i due approcci in cui vengono utilizzate 20 esecuzioni totali. Ho allegato esempi di ciascun approccio. Per l'approccio Esegui separatamente, ho generato due progetti da 10 esecuzioni, ho concatenato le tabelle e ho aggiunto l'effetto principale della piattaforma nonché le interazioni che coinvolgono la piattaforma (incluso l'ordine quadratico superiore) a Adatta modello in modo che siano stati utilizzati gli stessi modelli nei due approcci. Utilizzando Confronta progetti (DOE > Design Diagnostics) puoi vedere che Run as One ha una potenza considerevolmente più elevata a tutti gli effetti e dove non è così, la differenza è piccola. Lo svantaggio è che, come accennato in precedenza, è necessario mantenere le cose codificate e ripristinare i valori effettivi se si vuole sapere cosa sono. Il compromesso è la facilità di interpretabilità rispetto all’efficienza.
Ri: Come fare DOE con variabili dipendentiGrazie per il tuo commento!
Ho alcune domande di follow-up.
1. nel file di esempio sono presenti 3 progetti RPM: 1,0, 1. Se l'intervallo RPM del mio esperimento è compreso tra 100 RPM e 400 RPM, DOE mi dice di testare 100 RPM(-1), 300 RPM(0) e 400 RPM(1)?
2. Nella mia condizione sperimentale, l'intervallo di giri della piattaforma "A" non può superare i 200 giri al minuto e l'intervallo di giri della piattaforma "B" non può essere inferiore a 250 giri al minuto. Fornire la condizione, Piattaforma*RPM*RPM considererebbe comunque un intervallo diverso di RPM per ciascuna piattaforma?
Ri: Come fare DOE con variabili dipendentiGrazie per il tuo suggerimento e per aver posto domande più dettagliate!
1. Sì. Voglio confrontare due diverse piattaforme culturali
2. Le variabili di risposta sono la densità e il titolo delle cellule vitali
3. Voglio confrontare due diverse piattaforme e analizzarle graficamente e quantitativamente
4. Voglio variare il numero di giri e il volume per ciascuna piattaforma. Ad esempio, non posso avere un volume superiore a 25 ml per la piattaforma B. Ogni piattaforma ha una capacità diversa ma i fattori sono gli stessi come numero di giri e volume
5. Mi aspetto che l'effetto principale sia il numero di giri
Posso fare DOE con fattori dipendenti separati?
Ri: Come fare DOE con variabili dipendenti@joepark un approccio potrebbe essere quello di lasciare RPM nella sua impostazione originale (ortogonale, +1/-1). Interpretare +1 come impostazione alta e -1 come impostazione bassa, indipendentemente dalla piattaforma. Ciò produce un esperimento a due fattori (piattaforma e RPM). Oltre agli effetti completi del modello RSM, potresti prendere in considerazione l'aggiunta di Piattaforma*RPM*RPM. Questo termine è associato alle differenze nella curvatura dovute alla Piattaforma. Lo svantaggio di questo approccio è che dovrai calcolare manualmente le impostazioni RPM effettive dai loro valori codificati. Allego un esempio.
Ri: Come fare DOE con variabili dipendentiPerdona la mia possibile confusione, ma se ho capito bene vuoi semplicemente confrontare le due diverse piattaforme culturali? Quali sono le variabili di risposta? Esistono diversi modi per eseguire questo confronto, graficamente e quantitativamente. Ma sembra che tu voglia qualcos'altro in più? Vuoi valutare l'effetto del numero di giri sulle variabili di risposta? Vuoi variare questo fattore in base alla piattaforma? Ci sono altri fattori di interesse? La tua situazione sembra come se gli RPM fossero nidificati nella piattaforma. In tal caso, a seconda della quantità di dati di cui disponi, potresti eseguire un'analisi nidificata (gerarchica). Puoi farlo considerando Qualità e processo> Grafico della variabilità> inserisci il raggruppamento Y e x (nella gerarchia)> scegli il tipo di modello Nidificato. Quando ottieni il grafico puoi selezionare il triangolo rosso e andare su Componenti della varianza.
