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Terminología de modelos mixtos

Hola a todos,

 

Estoy trabajando en un documento en el que analizo el rendimiento de los peces nadando y estoy controlando por individuos anidados dentro de las especies. Tengo dos tipos diferentes de pruebas que estoy ejecutando usando el modelo mixto de personalidad y necesito ayuda para describir (nombrar, caracterizar) esos modelos cuando redacto mi artículo. En las revistas a las que he enviado, recibo muchas críticas que se quejan de que no entienden lo que estoy haciendo con mis datos porque no están familiarizados con JMP y la plataforma de modelos mixtos.

 

En la primera prueba busco diferencias entre especies en varias variables de entrada / métricas corporales (curvatura de flexión máxima, duración del giro, etc.).

En el modelo, mi efecto fijo es Especie y mi efecto aleatorio es Individual anidado dentro de especie. Si no tuviera individual como efecto aleatorio, esta sería una prueba T simple, pero no estoy seguro de cómo llamarla cuando controlo la variación individual.

 

La segunda prueba es un modelo lineal, en este caso mis efectos fijos son especies, curvatura de flexión y duración del giro (y el factorial completo de interacciones), nuevamente con el efecto aleatorio de individuo anidado en especie. Supongo que puedo llamar a esto un modelo lineal mixto.

 

Gracias,

 

Stephen

AnalíticaOtroRe: terminología de modelos mixtos

La terminología puede ser confusa y, lamentablemente, no es universal. No sé exactamente a qué te refieres con " estoy controlando por individuos anidados dentro de especies ". ¿Controlando un efecto aleatorio?Quizás esto ayude:

 

https://www.jmp.com/support/help/en/16.1/?os=mac&source=application&utm_source=helpmenu&utm_medium=application#page/jmp/mixed-models-and-random-effect-models.shtml

 

Re: terminología de modelos mixtos

Tuve este problema hace algún tiempo mientras intentaba estimar un modelo lineal jerárquico (HLM) para su publicación. Tengo la impresión de que los diferentes programas utilizan diferentes terminologías, así como diferentes métodos de estimación y algoritmos (no estoy seguro de si existen derechos de autor o patentes).

Mi solución en ese momento fue revisar el libro destacado en el campo (educación) y estimar los modelos de ejemplo con sus datos de muestra. Una vez que obtuve los resultados exactos, estaba seguro de que estaba usando los modelos aceptables en el campo y puedo usar con confianza su terminología convencional.

La falta de comunicación entre disciplinas hace que cada una tenga su propia terminología. Para cuestiones comerciales, supongo que sería muy difícil encontrar una traducción explícita de la terminología de un software a otro. Estas razones juntas también hacen que sea casi imposible encontrar un profesional que sea capaz de dar este tipo de respuesta de la mano.

Re: terminología de modelos mixtos

Hola,

 

Los modelos mixtos pueden resultar confusos. Y la terminología también es bastante confusa. Sin embargo, no estoy seguro de que la terminología en JMP sea muy diferente de la terminología en SAS o R, por ejemplo.

 

En cualquier caso, me pregunto si realmente necesita utilizar modelos mixtos para su análisis. ¿Por qué necesita agregar un efecto para individuos? Un ejemplo en el que puede hacer esto es si está midiendo la respuesta en varios puntos de tiempo para el mismo conjunto de personas ( "medidas repetidas" ). Pero la mayoría de las veces no tiene sentido agregar un efecto para los individuos.

 

Podría ayudar si puede adjuntar conjuntos de datos de ejemplo para ilustrar el tipo de análisis que necesita hacer.

 

Espero que eso ayude,

Phil

Re: terminología de modelos mixtos

El modelo principal que estoy haciendo es un modelo lineal que analiza la relación entre las variables de la forma del cuerpo (cuánta curvatura tiene el pez al doblarse y qué tan rápido se dobla) y las variables de rendimiento de natación (cuánto gira un pez y qué tan rápido ) y comparar los resultados entre especies con diferentes formas corporales. Las críticas que he recibido en el pasado se relacionan con no controlar la variación entre los individuos dentro de las especies. A los revisores les preocupa que mis datos sean impulsados por el comportamiento de uno o unos pocos individuos y no por la especie en su conjunto.

 

Incluir el individuo como efecto aleatorio en el modelo lineal mixto tiene sentido. Pensé que aún debería incluir el individuo como un efecto aleatorio cuando comparo las medias de las diferentes especies en las variables dependientes del modelo lineal mixto.

 

Adjunté mis datos con un archivo de secuencia de comandos con los modelos que estoy tratando de ejecutar.

Re: terminología de modelos mixtos

Eso ayuda, gracias.

¿Por qué tiene varias observaciones (filas) para cada individuo?  

Re: terminología de modelos mixtos

Grabé 15 turnos independientes para cada individuo.

Re: terminología de modelos mixtos

Bueno. Ahora tiene mucho más sentido por qué necesita agregar un efecto individual.

 

La regresión estándar supone que todas las observaciones son independientes. Ese sería el caso si cada fila de su tabla fuera un individuo único.

 

Debido a que tiene varias observaciones para cada individuo, las observaciones no son independientes. Se podría esperar que las observaciones dentro de cada individuo fueran más similares.

 

Una forma de asegurarse de que el modelo sea apropiado es agregar un efecto aleatorio para Individual. Esto debe anidarse dentro de las especies porque los individuos son únicos para cada especie (por supuesto). Un efecto fijo para Individual no tendría sentido porque los individuos son representantes extraídos al azar de una distribución de una población más grande en lugar de niveles controlables de una variable.

 

Parece que entiendes todo esto porque eso es lo que has hecho con tus modelos.

 

Así que ahora la pregunta es: ¿qué no entienden sus revisores? ¿Cómo le harían modelar los datos?

 

Como dije antes, estoy bastante seguro de que la terminología utilizada por JMP para modelos mixtos es la misma que se utiliza en otro software. (Hice un módulo sobre modelos mixtos como parte de mi maestría donde usamos R. Repetí todos los ejemplos en JMP y no recuerdo ninguna diferencia en las salidas informadas)

Re: Terminología de modelos mixtos

Entonces necesito hacer dos modelos diferentes. Uno es el modelo mixto lineal donde tengo efectos fijos continuos y categóricos además del efecto anidado aleatorio.

 

El otro modelo incluye solo el efecto fijo categórico (especie) y la respuesta continua (las variables de forma del cuerpo), supongo que necesito incluir nuevamente al individuo como un efecto anidado aleatorio. En este caso, ¿importa si uso mínimos cuadrados estándar con REML o personalidades de modelos mixtos? Me inclino por SLS+REML