混合模型术语大家好，
我正在写一篇论文，其中我研究了鱼类的游泳表现，并控制了物种内嵌套的个体。我使用混合模型个性运行了两种不同类型的测试，在撰写论文时我需要帮助描述（命名、描述）这些模型。在我提交的期刊中，我收到了很多评论，抱怨他们不了解我对数据做了什么，因为他们不熟悉 JMP 和混合模型平台。
在第一个测试中，我正在寻找物种之间在几个输入变量/身体指标（最大弯曲曲率、转弯持续时间等）的差异。
在模型中，我的固定效应是物种，随机效应是嵌套在物种中的个体。如果我没有将个体作为随机效应，这将是一个简单的 T 检验，但当我控制个体差异时，我不确定该如何称呼它。
第二个测试是线性模型，在这种情况下，我的固定效应是物种、弯曲曲率和转弯持续时间（以及相互作用的完整因子），同样具有嵌套在物种中的个体随机效应。我假设我可以将其称为线性混合模型。
谢谢，
史蒂芬
质量与工艺工程回复：混合模型术语我还需要使用 LMM 的交互图创建图表。 我为此创建了一个新的讨论。导出/提取线方程以在 JMP 外部制作图形 - JMP 用户社区
回复：混合模型术语是的，包括个体作为随机效应（嵌套在物种下）适合您的数据。 正如我所说，如果您不包括个人，那将意味着每一行数据都是一个完全独立的测量，但事实并非如此。
SLS + REML 可以很好地用于您的示例。
Fit Mixed 提供了使用更复杂的协方差结构的机会，但我认为您不想陷入这种复杂性。 （如果你这样做，那么@剑草已经完成了Discovery 上的一些精彩演讲对这个）
回复：混合模型术语所以我需要做两个不同的模型。 一种是线性混合模型，其中除了随机嵌套效应外，我还有连续和分类固定效应。
另一个模型仅包括分类固定效应（物种）和连续响应（体型变量），我假设我需要再次将个体作为随机嵌套效应包括在内。 在这种情况下，我使用带有 REML 或混合模型个性的标准最小二乘法是否重要？ 我倾向于 SLS+REML
回复：混合模型术语好的。 现在，为什么需要为个人添加效果就更有意义了。
标准回归假定所有观察值都是独立的。 如果您的表中的每一行都是一个独特的个体，就会出现这种情况。
因为您对每个人都有多个观察，所以观察不是独立的。 每个人的观察结果预计会更加相似。
确保模型合适的一种方法是为个体添加随机效应。 这应该嵌套在物种中，因为每个物种的个体都是独一无二的（当然）。 个体的固定效应没有意义，因为个体是从较大人群的分布中随机抽取的代表，而不是变量的可控水平。
您似乎了解所有这些，因为这就是您对模型所做的。
所以现在的问题是：您的审稿人不理解什么？ 他们会让你如何建模数据？
正如我之前所说，我非常确定 JMP 用于混合模型的术语与其他软件中使用的术语相同。 （我做了一个关于混合模型的模块，作为我的 MSc 的一部分，我们使用了 R。 我在 JMP 中重复了所有示例，我不记得报告的输出有任何差异）
回复：混合模型术语我为每个人记录了 15 个独立的回合。
回复：混合模型术语这有帮助，谢谢。
为什么每个人都有多个观察值（行）？
回复：混合模型术语我正在做的主要模型是一个线性模型，它着眼于体形变量（鱼弯曲时的曲率和弯曲速度）和游泳性能变量（鱼转弯的角度和速度）之间的关系) 并比较具有不同体型的物种之间的结果。 我过去收到的批评与没有控制物种内个体之间的变异有关。 审稿人担心我的数据是由一个或几个人的行为驱动的，而不是整个物种的行为。
在线性混合模型中将个体作为随机效应包括在内是有意义的。 我想当我在线性混合模型的因变量中比较不同物种的均值时，我仍然应该将个体作为随机效应包括在内。
我已将我的数据附加到一个脚本文件中，其中包含我要运行的模型。
回复：混合模型术语你好，
混合模型可能会造成混淆。 而且术语也很混乱。 但是，我不确定 JMP 中的术语是否与 SAS 或 R 中的术语有很大不同，例如。
无论如何，我想知道您是否真的需要使用混合模型进行分析。 为什么需要为个人添加效果？ 您可能会这样做的一个示例是，如果您正在测量同一组个体的多个时间点的响应（ “重复措施” ). 但大多数情况下，为个人添加效果是没有意义的。
如果您可以附加示例数据集来说明您需要执行的分析类型，这可能会有所帮助。
我希望这有帮助，
菲尔
回复：混合模型术语前段时间我在尝试估计要发布的分层线性模型 (HLM) 时遇到了这个问题。我的印象是不同的程序使用不同的术语以及不同的估计方法和算法（不确定是否有任何版权或专利）。
我当时的解决方案是阅读该领域的著名书籍（教育）并使用样本数据估计示例模型。 一旦我获得了准确的结果，我就确信我使用的是该领域可接受的模型，并且可以自信地使用他们的传统术语。
学科之间缺乏交流意味着每个学科都有自己的术语。 对于商业问题，我想很难找到从一种软件到另一种软件的术语的明确翻译。这些原因加在一起也使得几乎不可能找到能够即兴回答这种问题的专业人士。
回复：混合模型术语术语可能会令人困惑，不幸的是，它并不通用。 我不完全明白你的意思是“正在控制嵌套在物种中的个体”。 控制随机效应？也许这有助于：
https://www.jmp.com/support/help/en/16.1/?os=mac&source=application&utm_source=helpmenu&utm_medium=application#page/jmp/mixed-models-and-random-effect-models.shtml
