Terminologia del modello mistoCiao a tutti,
Sto lavorando su un documento in cui sto osservando le prestazioni di nuoto dei pesci e sto controllando gli individui nidificati all'interno delle specie. Ho due diversi tipi di test che sto eseguendo utilizzando la personalità del modello misto e ho bisogno di aiuto per descrivere (dare un nome, caratterizzare) quei modelli quando scrivo il mio articolo. Nelle riviste a cui ho inviato ottengo molte recensioni che si lamentano del fatto che non capiscono cosa sto facendo con i miei dati perché non hanno familiarità con JMP e la piattaforma del modello misto.
Nel primo test cerco differenze tra le specie in diverse variabili di input/metriche del corpo (curvatura massima di flessione, durata del turno, ecc.).
Nel modello il mio effetto fisso è Specie e il mio effetto casuale è Individuo nidificato all'interno di specie. Se non avessi l'individuo come effetto casuale, questo sarebbe un semplice test T, ma non sono sicuro di come chiamarlo quando controllo la variazione individuale.
Il secondo test è un modello lineare, in questo caso i miei effetti fissi sono specie, curvatura di flessione e durata del turno (e il fattoriale completo delle interazioni), sempre con l'effetto casuale dell'individuo annidato nelle specie. Suppongo di poter semplicemente chiamare questo un modello misto lineare.
Grazie,
Stefano
AnalisiAltroRe: Terminologia del modello mistoLa terminologia può creare confusione e sfortunatamente non è universale. Non so esattamente cosa intendi per " sto controllando per individui nidificati all'interno di specie". Controllo per un effetto casuale?Forse questo aiuta:
https://www.jmp.com/support/help/en/16.1/?os=mac&source=application&utm_source=helpmenu&utm_medium=application#page/jmp/modelli-misti-e-modelli-a-effetto-casuale.shtml
Re: Terminologia del modello mistoHo avuto questo problema qualche tempo fa durante il tentativo di stimare un modello lineare gerarchico (HLM) per la pubblicazione. ho l'impressione che programmi diversi utilizzino terminologie diverse, nonché metodi e algoritmi di stima diversi (non sono sicuro se ci siano diritti di copia o brevetti).
La mia soluzione all'epoca stava esaminando il libro di spicco nel campo (istruzione) e stimare i modelli di esempio con i loro dati di esempio. Una volta ottenuti i risultati esatti, ero sicuro di utilizzare i modelli accettabili sul campo e di poter utilizzare con sicurezza la loro terminologia convenzionale.
La mancanza di comunicazione tra le discipline significa che ognuna ha la propria terminologia. Per questioni commerciali direi che sarebbe molto difficile trovare una traduzione esplicita della terminologia da un software all'altro. queste ragioni messe insieme rendono anche quasi impossibile trovare un professionista che sarebbe in grado di tirare fuori a braccio questo tipo di risposta.
Re: Terminologia del modello mistoCiao,
I modelli misti possono creare confusione. E anche la terminologia è piuttosto confusa. Tuttavia, non sono sicuro che la terminologia in JMP sia molto diversa dalla terminologia in SAS o R, ad esempio.
In ogni caso, mi chiedo se hai davvero bisogno di utilizzare modelli misti per la tua analisi. Perché è necessario aggiungere un effetto per i singoli? Un esempio in cui potresti farlo è se stai misurando la risposta in più punti temporali per lo stesso insieme di individui ( "misure ripetute" ). Ma la maggior parte delle volte non ha senso aggiungere un effetto per gli individui.
Potrebbe essere utile allegare serie di dati di esempio per illustrare il tipo di analisi che è necessario eseguire.
Spero che aiuti,
Phil
Re: Terminologia del modello mistoIl modello principale che sto facendo è un modello lineare che osserva la relazione tra le variabili della forma del corpo (quanta curvatura ha il pesce quando si piega e quanto velocemente si piega) e le variabili delle prestazioni di nuoto (quanto gira il pesce un pesce e quanto velocemente ) e confrontando i risultati tra specie con forme corporee diverse. Le critiche che ho ricevuto in passato riguardavano il non controllo della variazione tra gli individui all'interno della specie. I revisori sono preoccupati che i miei dati siano guidati dal comportamento di uno o pochi individui e non dalla specie nel suo insieme.
Includere l'individuo come effetto casuale nel modello misto lineare ha senso. Ho pensato che dovrei ancora includere l'individuo come effetto casuale quando confronto le medie delle diverse specie nelle variabili dipendenti del modello misto lineare.
Ho allegato i miei dati con un file di script con i modelli che sto cercando di eseguire.
Re: Terminologia del modello mistoQuesto aiuta, grazie.
Perché hai più osservazioni (righe) per ogni individuo?
Re: Terminologia del modello mistoHo registrato 15 turni indipendenti per ogni individuo.
Re: Terminologia del modello mistoVa bene. Ora ha molto più senso il motivo per cui è necessario aggiungere un effetto per l'individuo.
La regressione standard presuppone che tutte le osservazioni siano indipendenti. Questo sarebbe il caso se ogni riga della tabella fosse un individuo unico.
Poiché hai più osservazioni per ogni individuo, le osservazioni non sono indipendenti. Le osservazioni all'interno di ogni individuo potrebbero essere più simili.
Un modo per garantire che il modello sia appropriato consiste nell'aggiungere un effetto casuale per Individuo. Questo dovrebbe essere nidificato all'interno delle specie perché gli individui sono unici per ogni specie (ovviamente). Un effetto fisso per Individuo non avrebbe senso perché gli individui sono rappresentati casualmente da una distribuzione di una popolazione più ampia piuttosto che da livelli controllabili di una variabile.
Sembra che tu capisca tutto questo perché è quello che hai fatto con i tuoi modelli.
Quindi ora la domanda è: cosa non capiscono i tuoi revisori? Come ti farebbero modellare i dati?
Come ho detto prima, sono abbastanza sicuro che la terminologia utilizzata da JMP per i modelli misti sia la stessa utilizzata in altri software. (Ho fatto un modulo su modelli misti come parte del mio Master in cui abbiamo usato R. ho ripetuto tutti gli esempi in JMP e non ricordo alcuna differenza negli output riportati)
Re: terminologia del modello mistoQuindi devo fare due modelli diversi. Uno è il modello misto lineare in cui ho effetti fissi continui e categoriali oltre all'effetto annidato casuale.
L'altro modello include solo l'effetto fisso categoriale (specie) e la risposta continua (le variabili della forma del corpo), presumo di dover includere nuovamente l'individuo come effetto nidificato casuale. In questo caso è importante se utilizzo i minimi quadrati standard con personalità del modello REML o miste? Sono favorevole a SLS+REML
