Gemischte ModellterminologieHallo zusammen,
Ich arbeite an einer Arbeit, in der ich die Schwimmleistung von Fischen betrachte und nach einzelnen innerhalb von Arten verschachtelten Individuen kontrolliere. Ich habe zwei verschiedene Arten von Tests, die ich mit der gemischten Modell-Persönlichkeit durchführe, und ich brauche Hilfe bei der Beschreibung (Benennung, Charakterisierung) dieser Modelle, wenn ich meine Arbeit verfasse. In den Zeitschriften, die ich eingereicht habe, bekomme ich viele Rezensionen, die sich darüber beschweren, dass sie nicht verstehen, was ich mit meinen Daten mache, weil sie mit JMP und der Plattform für gemischte Modelle nicht vertraut sind.
Im ersten Test suche ich nach Artenunterschieden bei mehreren Eingabevariablen/Körpermetriken (maximale Biegekrümmung, Drehdauer usw.).
Im Modell ist mein fester Effekt Species und mein zufälliger Effekt ist Individuell in Spezies verschachtelt. Wenn ich keinen individuellen Effekt als Zufallseffekt hätte, wäre dies ein einfacher T-Test, aber ich bin mir nicht sicher, wie ich ihn nennen soll, wenn ich die individuelle Variation kontrolliere.
Der zweite Test ist ein lineares Modell, in diesem Fall sind meine festen Effekte Spezies, Krümmungskrümmung und Rundendauer (und die vollständige Fakultät der Interaktionen), wiederum mit dem zufälligen Effekt von in Spezies verschachtelten Individuen. Ich gehe davon aus, dass ich dies nur ein lineares gemischtes Modell nennen kann.
Vielen Dank,
Stephen
AnalytikSonstigesBetreff: Gemischte ModellterminologieTerminologie kann verwirrend sein und ist leider nicht universell. ich weiß nicht genau was du meinst mit " kontrolliere für Individuen, die innerhalb von Arten verschachtelt sind". Steuerung für einen zufälligen Effekt?Vielleicht hilft das:
https://www.jmp.com/support/help/de/16.1/?os=mac&source=application&utm_source=helpmenu&utm_medium=application#page/jmp/mixed-models-and-random-effect-models.shtml
Betreff: Gemischte ModellterminologieIch hatte dieses Problem vor einiger Zeit, als ich versuchte, ein hierarchisches lineares Modell (HLM) für die Veröffentlichung zu schätzen. Ich habe den Eindruck, dass verschiedene Programme unterschiedliche Terminologien sowie unterschiedliche Schätzmethoden und -algorithmen verwenden (ich bin mir nicht sicher, ob es Urheberrechte oder Patente gibt).
Meine damalige Lösung bestand darin, das prominente Fachbuch (Bildung) durchzugehen und die Beispielmodelle mit ihren Beispieldaten zu schätzen. Nachdem ich die genauen Ergebnisse erhalten hatte, war ich mir sicher, dass ich die im Feld akzeptablen Modelle verwende und ihre konventionelle Terminologie getrost verwenden kann.
Die fehlende Kommunikation zwischen den Disziplinen führt dazu, dass jede ihre eigene Terminologie hat. Aus kommerziellen Gründen würde es sehr schwierig sein, eine explizite Übersetzung der Terminologie von einer Software in eine andere zu finden. Diese Gründe zusammen machen es auch fast unmöglich, einen Fachmann zu finden, der in der Lage wäre, diese Art von Antwort aus der Hand zu nehmen.
Betreff: Gemischte ModellterminologieHi,
Gemischte Modelle können verwirrend sein. Und die Terminologie ist auch ziemlich verwirrend. Ich bin mir jedoch nicht sicher, ob sich die Terminologie in JMP beispielsweise stark von der Terminologie in SAS oder R unterscheidet.
Auf jeden Fall frage ich mich, ob Sie wirklich gemischte Modelle für Ihre Analyse verwenden müssen. Warum müssen Sie einen Effekt für Einzelpersonen hinzufügen? Ein Beispiel, in dem Sie dies tun könnten, ist, wenn Sie die Reaktion über mehrere Zeitpunkte für dieselbe Gruppe von Personen messen ( "wiederholte Maßnahmen" ). Aber meistens ist es nicht sinnvoll, einen Effekt für den Einzelnen hinzuzufügen.
Es kann hilfreich sein, wenn Sie Beispieldatensätze anhängen können, um die Art der Analysen zu veranschaulichen, die Sie durchführen müssen.
Ich hoffe das hilft,
Phil
Betreff: Gemischte ModellterminologieDas Hauptmodell, das ich mache, ist ein lineares Modell, das die Beziehung zwischen Körperformvariablen (wie viel Krümmung hat der Fisch beim Beugen und wie schnell er sich beugt) und den Schwimmleistungsvariablen (wie stark dreht sich der Fisch und wie schnell) untersucht ) und Vergleich der Ergebnisse zwischen Arten mit unterschiedlichen Körperformen. Die Kritik, die ich in der Vergangenheit bekommen habe, bezog sich darauf, die Variation zwischen Individuen innerhalb einer Art nicht zu kontrollieren. Die Gutachter sind besorgt, dass meine Daten durch das Verhalten eines oder weniger Individuen und nicht die Art als Ganzes bestimmt werden.
Individuell als Zufallseffekt in das lineare Mischmodell einzubeziehen ist sinnvoll. Ich dachte mir, ich sollte immer noch das Individuum als zufälligen Effekt einbeziehen, wenn ich die Mittelwerte der verschiedenen Arten in den abhängigen Variablen des linearen gemischten Modells vergleiche.
Ich habe meine Daten mit einer Skriptdatei mit den Modellen angehängt, die ich ausführen möchte.
Betreff: Gemischte ModellterminologieDas hilft, danke.
Warum haben Sie für jede Person mehrere Beobachtungen (Zeilen)?
Betreff: Gemischte ModellterminologieIch habe für jeden Einzelnen 15 unabhängige Runden aufgezeichnet.
Betreff: Gemischte ModellterminologieOkay. Jetzt ist es viel sinnvoller, warum Sie einen Effekt für einzelne Personen hinzufügen müssen.
Die Standardregression geht davon aus, dass alle Beobachtungen unabhängig sind. Dies wäre der Fall, wenn jede Zeile in Ihrer Tabelle eine eindeutige Person wäre.
Da Sie für jede Person mehrere Beobachtungen haben, sind die Beobachtungen nicht unabhängig. Es könnte erwartet werden, dass die Beobachtungen bei jedem Individuum ähnlicher sind.
Eine Möglichkeit, um sicherzustellen, dass das Modell geeignet ist, besteht darin, einen Zufallseffekt für „Individuell“ hinzuzufügen. Dies sollte innerhalb von Arten verschachtelt werden, da die Individuen für jede Art (natürlich) einzigartig sind. Ein fester Effekt für Individual wäre nicht sinnvoll, da Individuen zufällig gezogene Repräsentanten aus einer Verteilung einer größeren Population sind und nicht kontrollierbare Niveaus einer Variablen.
Es scheint, als ob Sie das alles verstehen, denn genau das haben Sie mit Ihren Modellen gemacht.
Nun stellt sich die Frage: Was verstehen Ihre Rezensenten nicht? Wie würden sie die Daten modellieren?
Wie ich bereits sagte, bin ich mir ziemlich sicher, dass die von JMP für gemischte Modelle verwendete Terminologie dieselbe ist wie in anderer Software. (Ich habe im Rahmen meines MSc ein Modul zu gemischten Modellen gemacht, in dem wir R verwendet haben. Ich habe alle Beispiele in JMP wiederholt und erinnere mich an keinen Unterschied in den gemeldeten Ausgaben.)
Betreff: Terminologie für gemischte ModelleAlso brauche ich zwei verschiedene Modelle. Eines ist das lineare gemischte Modell, bei dem ich zusätzlich zum zufällig verschachtelten Effekt kontinuierliche und kategoriale feste Effekte habe.
Das andere Modell enthält nur den kategorialen festen Effekt (Spezies) und die kontinuierliche Reaktion (die Körperformvariablen), ich nehme an, ich muss das Individuum wieder als zufällig verschachtelten Effekt einbeziehen. Spielt es in diesem Fall eine Rolle, ob ich die Standardmethode der kleinsten Quadrate mit REML oder gemischte Modellpersönlichkeiten verwende? Ich tendiere zu SLS+REML
