JMP® 基因组学中的连锁图优化以改善农艺作物 JMP® 基因组学中的连锁图优化以改善农艺作物
Kelci Miclaus 和 Rebekah Oliver，SAS Institute Inc.；和埃里克杰克逊，美国农业部-ARS
构建良好的连锁图，将遗传标记放置在相对位置，在许多植物和动物物种的数量性状基因座 (QTL) 分析中至关重要。通过允许使用标记辅助育种方法来选择具有所需特性（例如提高抗病性和增加产量）的植物，将 DNA 标记与遗传遗传性状相关联，提高了农艺作物研究的效率。连锁图是使用 DNA 标记基因型构建的，用于来自已知谱系的实验群体的样本。标记根据它们链接的紧密程度分配给链接组，以它们的重组率衡量。确定组内标记的最佳顺序以计算最短遗传距离图。JMP Genomics 5.1 中的新功能使用来自 SAS/OR 的 PROC OPTMODEL 中的优化例程计算连锁组并确定最佳排序的标记图。作为合作燕麦研究企业 (CORE) 正在进行的研究的一部分，我们在分析源自重组自交系的燕麦植物的 DNA 标记时强调了这些新特征。
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