레벨: 중급
Thomas Walk, North Dakota State University 대형 식물 육종 파이프라인 DB 관리자
Ana Heilman Morales, 노스다코타 주립대학교 대형 식물 육종 파이프라인 DB 관리자
Didier Murillo, 데이터 분석가, North Dakota State University
Richard Horsley, North Dakota State University 식물 과학부 학과장
종종 수년에 걸쳐 여러 위치에서 자란 수천 개의 실험적 육종 계통과 관련된 수많은 실험을 관리하는 작물 육종가는 귀중한 데이터 관리 및 분석 도구를 개발했습니다.여기에서는 AgQHub라는 JMP 추가 기능에 통합된 도구 모음을 사용하여 보다 효율적인 작물 평가에 대해 보고합니다. 이 추가 기능은 사용자가 먼저 MS SQL Server 데이터베이스를 쿼리한 다음 JMP의 혼합 모델 기능을 통해 작물 성능에 대한 최상의 선형 BLUP(편향되지 않은 예측 변수)를 계산할 수 있는 인터페이스를 제공합니다. 그런 다음 선택 프로세스를 추가로 지원하기 위해 사용자는 대화형 대시보드에서 보고서를 작성하는 데 사용할 수 있는 필터링된 데이터를 사용하여 추가 기능 내에서 데이터를 정렬 및 필터링할 수 있습니다. 대시보드 내에서 사용자는 선택한 작물 유전자형을 테스트 및 확인 범주로 분리합니다. 선택한 검사 품종과의 일대일 비교에서 각 테스트 라인에 대해 별도의 품종 출시 테이블이 자동으로 생성됩니다. 대시보드는 또한 사용자에게 테스트된 라인과 여러 특성 간의 결과를 빠르게 비교할 수 있는 수치를 생성할 수 있는 옵션을 제공합니다. 대시보드에서 생성된 표와 그림은 사용자가 다양한 릴리스 문서에 쉽게 통합할 수 있는 파일로 출력할 수 있습니다. 간단히 말해서, AgQHub는 작물 육종가가 데이터베이스를 쿼리하고, BLUP를 계산하고, 보고서 표와 그림을 생성하는 데 사용할 수 있는 원스톱 추가 기능입니다.