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使用 GraphBuilder 和/或 Analyze（使用脚本）绘制非线性回归图

这个帖子是类似于这个，我在那里发表了评论，但由于该帖子已有 2 年历史，因此可能不会被看到，而且我无法将解决方案应用于我的方程。

 

我正在使用下面的脚本进行非线性回归来准备数据，然后使用分析选项，归一化荧光作为 Y 值，模型（公式）列作为 X 值（反转轴），并通过井位置，但这一次只能做一个。 如果我使用 GraphBuilder，则无法让 Smoother 使用公式。 我想在一个图上或在一个绝对理想的独角兽世界中绘制所有图，一次绘制 3 个井位（例如 B2-B4），但这似乎不现实：p

 

Data Table( "Melt Curve Raw Data" ) << New Column( "Normalized Fluorescence",
formula(
(:Fluorescence - Col Min( :Fluorescence, :Well Position )) / (
Col Max( :Fluorescence, :Well Position )
-Col Min( :Fluorescence, :Well Position ))
)
);

Data Table( "Melt Curve Raw Data" ) << New Column( "Model", Numeric, 
"Continuous", Format( "Best", 12 ), 
Formula(Parameter({m1 = -60, m2 = 0.2, m3 = -50, m4 = -0.3, m5 = 100000, m6 = 320}, 
((m1 + m2 * (:Temperature + 273)) + (m3 + m4 * (:Temperature + 273)) * Exp((-m5 / (1.987 * 
(:Temperature + 273))) * (1 - (:Temperature + 273) / m6))) / 
(1 + Exp((-m5 / (1.987 * (:Temperature + 273))) * (1 - (:Temperature + 273) / m6))))));

分析数据表图形脚本编写回复：使用 GraphBuilder 和/或分析（使用脚本）绘制非线性回归图

我不能确切地说出您在寻找什么，这些图表中的一个偶然显示了您正在寻找的内容，或者您可以发布一次仅显示一个图表的屏幕截图吗？您说您使用了分析，但我不确定您选择了该菜单中的哪个选项。

 

Graph Builder(
 Size( 671, 507 ),
 Show Control Panel( 0 ),
 Variables(
  X( :Model ),
  Y( :Normalized Fluorescence ),
  Overlay( :Well Position )
 ),
 Elements( Smoother( X, Y, Legend( 12 ) ), Points( X, Y, Legend( 13 ) ) ),
 Local Data Filter(
  Add Filter(
   columns( :Well Position ),
   Where( :Well Position == {"B2", "B3", "B4"} ),
   Display( :Well Position, N Items( 15 ), Find( Set Text( "" ) ) )
  )
 )
);

Graph Builder(
 Size( 671, 543 ),
 Show Control Panel( 0 ),
 Variables( X( :Model ), Y( :Normalized Fluorescence ), Wrap( :Well Position ) ),
 Elements( Points( X, Y, Legend( 9 ) ), Smoother( X, Y, Legend( 11 ) ) ),
 Local Data Filter(
  Add Filter(
   columns( :Well Position ),
   Where( :Well Position == {"B2", "B3", "B4"} ),
   Display( :Well Position, N Items( 15 ), Find( Set Text( "" ) ) )
  )
 )
);

Graph Builder(
 Size( 1308, 384 ),
 Show Control Panel( 0 ),
 Variables(
  X( :Model ),
  Y( :Normalized Fluorescence ),
  Group X( :Well Position )
 ),
 Elements( Smoother( X, Y, Legend( 12 ) ) ),
 Local Data Filter(
  Add Filter(
   columns( :Well Position ),
   Where( :Well Position == {"B2", "B3", "B4"} ),
   Display( :Well Position, N Items( 15 ), Find( Set Text( "" ) ) )
  )
 )
);

回复：使用 GraphBuilder 和/或分析（使用脚本）绘制非线性回归图

哇，这些都很棒。 我最初寻找的是右上角的多色散点图，但我绝对被你制作的图表和脚本所震撼。

 

使用分析选项时，我得到了我需要的值，但每个图形都是独立的。 在单击“开始”然后单击“置信限制”后，我附上了我当前使用的设置的屏幕截图以及结果。

 

我还附上了尝试对 Well Position 使用“group”而不是“by”时收到的错误消息。

回复：使用 GraphBuilder 和/或分析（使用脚本）绘制非线性回归图

非线性启动对话框过度简化了情况。 您需要对自定义模型执行更多操作，以指示 Group 变量如何影响参数。 您的模型仅包含常用参数。 唯一参数取决于组变量的级别。

 

请参阅这一页和底部的注释。

 

你有 JMP 专业版吗？ 您是否尝试过 Functional Data Explorer？

回复：使用 GraphBuilder 和/或分析（使用脚本）绘制非线性回归图

嗨马克！

 

非常感谢您的回复。是的，我有 JMP Pro，但我还没有尝试过 Functional Data Explorer。 我今天会试着阅读它。 感谢您的建议。

 

我看到了您链接到的关于使用“扩展到类别”复选框的段落。 我将其添加为第 7 个参数，在分析页面中，它在一个图上绘制了所有内容（太棒了！），但只给了我一行的值。 我是否错误地使用了“扩展到类别”选项？ 我应该将它添加到我原来的 6 个参数之一吗？

 

 

回复：使用 GraphBuilder 和/或分析（使用脚本）绘制非线性回归图

您没有正确使用此功能。 帮助中的段落是正确的，但可能有点模棱两可。 这是正确的方法，一步一步。 我正在使用 Big Class 来拟合 :weight 与 :height 的简单指数模型，其中 :age 作为分组变量 (:weight = A*Exp( B*height ) )。

 

为模型添加一个新的数据列。 将模型的公式添加到数据列。 定义参数。

 

 

单击确定并选择分组变量。

 

 

对并非所有曲线通用的其他参数重复此步骤。 构建模型。 根据需要选择参数。 这是分组指数模型。

 

 

保存公式并启动非线性。

 

 

单击“确定”开始拟合。

 

 

不过，我担心模型中的参数化会导致估计值之间存在高度相关性。 引入分组变量会加剧这种相关性，特别是考虑到组的数量。 所以另一种方法是使用原始模型并在 By 角色中使用曲线 ID。 这种方式将允许您自行拟合每条曲线。

 

另一方面，如果您不依赖于这个模型，那么 FDE 是另一种方式。 它使用基函数的扩展来对数据建模。 这些是通用内插器。