JMP Genomics ANOVA 및 일원 ANOVA안녕하세요, 저는 두 그룹을 비교하는 간단한 RNAseq 분석을 위해 JMP Genomics에서 ANOVA 및 One-way ANOVA를 사용하고 있습니다. p- 값은 두 분석에서 서로 매우 다르며 R 패키지에서 복제 할 수 없었습니다. 예를 들어 어떤 ANOVA 또는 One-way ANOVA 접근법이 사용되는지 아는 것이 크게 도움이됩니다 (예 : Wilcoxon).
1) ANOVA와 일원 ANOVA의 결과가 다른 이유는 무엇입니까?
2) 정확히 어떤 ANOVA 방법이 사용되는지에 대한 자세한 정보는 어디에서 찾을 수 있습니까?
배려 해주셔서 감사합니다. 내 질문이 이해되기를 바랍니다.
해석학Re : JMP Genomics ANOVA 및 One-way ANOVA안녕하세요 @같이 ,
그런데 어떤 버전의 JMP Genomics를 사용하고 있습니까?
JMP Genomics 사용 설명서는 이러한 질문에 답하는 데 도움이 될 수 있습니다. 구경하다 여기 . 일원 분산 분석 및 분산 분석과 비교하는 방법에 대한 설명입니다. 여기에는 사용되는 SAS PROC가 포함됩니다.
p- 값은 일원 분산 분석 및 분산 분석을 다른 방식으로 구현하는 R의 많은 패키지와 다릅니다. 예를 들어 DESeq2를 사용하십시오. DESeq2와 유사한 결과를 얻으려면 일원 분산 분석 대화 상자의 옵션 탭에서 설정 한 경험적 베이를 사용하여 분산 축소 옵션이 켜져 있는지 확인하십시오.이것이 다른 R 패키지와 JMP Genomics의 주요 차이점입니다. 다중 테스트 수정 방법의 적용에도 차이가 있습니다.
도움이 되었기를 바랍니다.
Re : JMP Genomics ANOVA 및 One-way ANOVA안녕하세요 Chris, 빠른 피드백과 고려에 감사드립니다. JMP13.2.1과 함께 JMPGenomics 9를 사용하고 있습니다.
제 동료가 방금 R base function aov를 사용하여 내가 사용한 것과 동일한 표현식 값으로 단방향 anova 결과를 복제하려고 시도했지만 복제 할 수 없었습니다. . JMPGenomics 내에서 ANOVA (고정 효과로 진단 포함) 및 One-way ANOVA를 실행하고 p- 값에 대해 다른 결과를 얻었습니다. 무엇을 사용해야할지 모르겠습니다. 가장 적합한 방법을 선택하는 방법에 대한 조언이 있습니까? 모든 설정에 대한 지식 없이는 말하기 어려울 수 있습니다.
