嗨,SE社区,
我有一个有趣的问题,我想我知道解决方案,但这可能不是最佳解决方案。我有一个客户想要对蓝莓的不同品种进行一致性分析,并希望将母亲与每个品种的克隆进行比较。到目前为止,这不是问题,除了有50个SNP(在示例中)而且测试就像评估者协议(类别>评估者协议)一样。 我附带了一个示例数据表,以使数据看起来更加清晰。 SNP类似于部件ID,希望在母体和克隆之间具有相同的值。 目标是找到每个品种之间来源之间的相似性百分比,并测试来源之间的相似性。
那是容易的部分。 我可以将两个来源(母亲和克隆人)投放到评估者协议对话框中,我将为每个来源的每个等位基因(0、1或2)获得N和%。这给了我每个等位基因在每个来源之间的一致性,也为两个来源之间的一致性提供了测试统计数据。 但是,我必须使用SNP作为ID还是将其保存到数据表中就可以了?
我也可以使用属性规图表(保存到数据表中),但我认为我没有正确设置它,或者也许我已经设置好了。可以看看吗? SNP是零件号,我必须一次选择一个品种,这与Categorical Rater协议不同(或者也许我必须操纵数据表以按组使用)。
我是否缺少任何东西,还是两者都正确?
我将介绍这两种方法,因为它们提供了相似但不相同的信息。
感谢您的健全性检查。