Hola comunidad SE,
Tengo un problema interesante para el que creo que conozco la solución, pero puede que no sea la mejor solución.Tengo un cliente que quiere hacer un análisis de concordancia en diferentes variedades de blue berries y quiere comparar la madre con el clon de cada variedad.Hasta ahora, no es un problema, excepto que hay 50 SNP (en el ejemplo) y la prueba es como un acuerdo de evaluador (categórico> acuerdo de evaluador). He adjuntado una tabla de datos de ejemplo para aclarar cómo se ven los datos. El SNP es como ID de pieza y se desea tener el mismo valor entre la madre y el clon. El objetivo es encontrar el porcentaje de similitud entre las fuentes y probar la similitud entre las fuentes para cada variedad.
Esa es la parte fácil. Puedo lanzar las dos fuentes (madre y clon) en el diálogo para que el evaluador esté de acuerdo y obtendré N y% para cada alelo (0, 1 o 2) para cada fuente.Eso me da la concordancia entre cada fuente para cada alelo y también una estadística de prueba para la concordancia entre las dos fuentes. Pero, ¿tengo que usar SNP como identificación o está bien, ya que lo guardé en la tabla de datos?
También puedo usar el gráfico de indicadores de atributos (guardado en la tabla de datos) pero no creo que lo haya configurado correctamente o tal vez lo haya hecho.¿Alguien puede echar un vistazo? SNP es el número de pieza y tengo que elegir una variedad a la vez, a diferencia del acuerdo del evaluador categórico (o tal vez tengo que manipular la tabla de datos para usar un por grupo).
¿Me estoy perdiendo algo o lo hice correctamente para ambos?
Presentaré ambos métodos, ya que proporcionan información similar pero no idéntica.
Gracias por el control de cordura.
