Come codificare un progetto a trama divisa in JMP Pro 15Ciao,
Ho bisogno di consigli su come modellare correttamente un disegno a trama divisa in jmp pro 15. Penso che debba avere effetti casuali, quindi un modello LME probabilmente funzionerà meglio, credo?
Ho tre effetti principali: Temperatura(Categorico), Cultivar(Categorico), Cultivar*Temperatura.
Variabile di risposta - % di germinazione (continua)
L'esperimento è stato condotto su (1) tabella del gradiente termico. Le cultivar sono state randomizzate in ciascuna sottotrama. (È elencato da 1 a 5 in ordine, ma sono randomizzati a quel livello). L'intera trama è la temperatura. La trama divisa sarebbe le cultivar, credo. (Vedi l'immagine qui sotto per la disposizione della tabella.)
Il mio modello in jmp sarebbe stato simile a questo:
Effetti fissi:
Coltivare
Temperatura
Cultivar*Temp
Effetti casuali:
Ripetizioni[Temperatura]
Questo tiene conto dei termini di errore corretti in jmp?
Modellazione statistica avanzataProgettazione di esperimentiPersonalizzazione di massaRe: Come codificare un progetto di trama divisa in JMP Pro 15Il tipo di modellazione è una scelta su come si immagina l'effetto del fattore. Naturalmente, i livelli di temperatura sono fissati dal design. Stai solo osservando la risposta a pochi livelli, ma l'effetto è continuo. Questa è la considerazione filosofica.
La considerazione pratica riguarda i gradi di libertà disponibili. Ad esempio, se l'effetto della temperatura è lineare, modellarlo come fattore categoriale richiede 4 parametri e 4 gradi di libertà dai dati. D'altra parte, modellarlo come fattore continuo richiede solo 1 parametro e 1 grado di libertà.
Re: Come codificare un progetto di trama divisa in JMP Pro 15Benvenuto nella comunità. mark ha già posto alcuni pensieri per te. Ho alcune domande aggiuntive di natura più pratica:
1. Perché considerare la temperatura come categoriale? Non importa che le temperature siano codificate, possono comunque essere continue e trattate come effetti fissi nel modello. Anche perché 4 livelli? La temperatura è davvero difficile da cambiare? Come mai?
2. Sembra che tu abbia solo due fattori (effetti principali) nell'esperimento: temperatura e cultivar. E sei sospettoso di un effetto di interazione. Perché 3 ripetizioni della sottotrama?
3. Quanto è adeguato il vostro sistema di misurazione (% di germinazione)?
4. Potrebbe sembrare che tu abbia 4 blocchi e stai confondendo la temperatura con il blocco. Questo non lo consiglierei perché confondi il rumore con un fattore di design.
5. Se la temperatura è difficile da modificare, il progetto che descrivi non ha modo di stimare l'intero errore di stampa. Se questo è il caso, potresti voler ridurre le 3 ripetizioni che hai delle sottotrame a 2 e quindi replicare l'intero disegno (quindi hai un termine replica x intero tracciato da usare come termine di errore per confrontare gli effetti della temperatura a).
6. Non so dove sei nella tua indagine? Non sono sicuro se questa indagine abbia lo scopo di capire la struttura causale o di scegliere un vincitore? Perché non iniziare con lo screening di 2 livelli di temperatura (estremo) e 2 livelli di Cultivar (estremo). Ottieni una stima del modello del primo ordine e quindi itera per espandere lo spazio.
Per una carta eccellente su parcelle divise:
Scatola, GEP, Stephen Jones (1992), “ Progettazioni split-plot per una solida sperimentazione del prodotto ”, Giornale di statistica applicata , vol. 19, n. 1
Re: Come codificare un progetto di trama divisa in JMP Pro 15Questo progetto sembra mettere le cultivar in sottotrame omogenee. Credo che le sottotrame contengano tutte e 5 le cultivar (randomizzate). Temp 4 Intera trama 1 Cultivar 5 nella sottotrama 1
Re: Come codificare un progetto di trama divisa in JMP Pro 15Ottimo, lo esaminerò. Questi sono in realtà i dati di qualcun altro. Mi è stato chiesto di analizzarlo. L'esperimento che sto progettando è simile, ma utilizzerà 3 tabelle, non solo una.
Vedo che hai la temperatura come variabile continua. Ogni temperatura è stata fissata, cioè temperatura 1 = 130°c, 2 =°22 ecc... quindi li ho codificati come categoriali.
Molti dei miei colleghi hanno anche progetti a trama divisa, quindi ho cercato di capire come farlo in jmp per tutti i nostri interessi.
-Michael
Re: Come codificare un progetto di trama divisa in JMP Pro 15La documentazione di JMP è un buon punto di partenza. Vedi il Guida DOE .
Come hai realizzato questo design in primo luogo?
Re: Come codificare un progetto di trama divisa in JMP Pro 15Ottimo, grazie per aver dedicato del tempo a rispondere alla mia domanda.
Questa è la mia prima esperienza con JMP, quindi non sono sicuro di cosa significhi tutto ciò. Guarderò attraverso il sito web e vedrò se non riesco a trovare del materiale che mi aiuti ad arrivarci.
Grazie,
Michael
Re: Come codificare un progetto di trama divisa in JMP Pro 15Non dovresti includere Rep nel modello. Viene utilizzato automaticamente per stimare la varianza dell'errore. È necessaria una nuova colonna chiamata Whole Plot, forse per indicare quando è stato ripristinato l'intero fattore di trama. Questa variabile verrà utilizzata per stimare l'intera varianza del grafico mentre la variabile Temperatura verrà utilizzata per stimare gli effetti fissi.
Sembra che il tuo progetto abbia la temperatura molto difficile da cambiare e la cultivar altrettanto difficile da cambiare. Cioè, non hai randomizzato con uno di questi due fattori. Quindi potresti voler selezionare DOE > Custom Design e definire questi due fattori in questo modo. Seleziona l'opzione per i livelli nidificati in modo che corrispondano a ciò che hai fatto. In questo modo sarà più semplice, credo, che iniziare con una nuova tabella di dati JMP e creare tutte le colonne di dati e i metadati per ottenere la migliore analisi.
Il progetto che hai realizzato purtroppo non supporterà la stima e il test dell'effetto di interazione. È necessario utilizzare un design più grande in cui reimpostare la temperatura.
In alternativa, potresti presumere che l'intera varianza della trama sia zero e rimuovere l'effetto casuale della trama intera dal modello, ma probabilmente non è realistico.
