JMP 抗体滴定曲线你好
Hi All, im a very novice jmp user and am trying to analyze an antibody titration curve using JMP. I tried to fit a 4PHill. However i got some very weird values on my estimates with my inflection point (-1.72) and lower asymptote (-26453.17) having negative values while the upper asymptote showed 97.11. In additions the P value was not significant for both the inflection point and lower asymptote (approx 0.98 on both). Am i using the wrong type of curve? How do i approach this? any help is appreciated! Thanks!
高级统计建模回复:JMP 抗体滴定曲线添加到@克里斯_基希伯格的评论中,未能收敛到所选模型的另一个常见原因是模型过度指定。 例如,稀释曲线可能是 4PLC,但如果实验上仅观察到曲线的一部分,则很难估计所有参数,并且更简单的模型会更成功。 否则,如果要拟合更复杂的模型,则必须扩展域以观察更多曲线。
回复:JMP 抗体滴定曲线<@Thierry_S..感谢额外的提示...一位同事还建议使用二元拟合和加权来确定线性区域。 但是一旦确定了应该从线性区域中选择什么浓度的抗体(在我的例子中,我在线性区域中得到 3 个点)。 我仍然很困惑该选择什么>
回复:JMP 抗体滴定曲线你好,
要添加到@克里斯_基希伯格,我想知道您是否真的需要逻辑模型,因为您的数据本质上是指数增长曲线。
请参阅下面的指数 3P、Logistic 3P 和 Logistic 4P Hill 模型的比较:指数 3P 模型在描述数据方面最有效(最低 AICc)。


最好的,
TS
回复:JMP 抗体滴定曲线@克里斯...非常感谢..Logistic 3P 效果很好,解决了负值的问题...现在 P<0.001 看起来更好..但是我仍然不知道如何推断它以获得最佳滴度抗体大量的。
回复:JMP 抗体滴定曲线@马克贝利..我尝试了两种方法,但它仍然给了我负值:-(
回复:JMP 抗体滴定曲线你好@Apssub ,
我认为问题在于为数据选择的模型。三参数模型会更合适,这也是您得到负值的原因。注意曲线的形状。 从 0 到某个数字,然后在某个渐近线处逐渐减小。 这就是三参数模型的形状。
希望有帮助。
回复:JMP 抗体滴定曲线你好,
感谢您的回复
请参阅所附文件。
不确定从 P 值中理解什么,因为较低的渐近线和拐点都有较高的 P 值,表明该曲线没有显着性。我如何使用它来确定滴定中抗体的最佳质量
谢谢!
回复:JMP 抗体滴定曲线你好@Apssub
作为@马克贝利已经发布了,样本会非常有帮助,您也可以将其匿名化以避免泄露机密信息。
您是否看过这些示例,例如在脚本索引中您会找到该脚本(> 帮助 > 脚本索引 > 搜索 4P HILL)。
只需执行并查看结果即可。
Names Default To Here( 1 );
dt = Open( "$SAMPLE_DATA/Nonlinear Examples/Bioassay.jmp" );
obj = dt << Fit Curve(
Y( :Toxicity ),
X( :log Conc ),
Group( :formulation )
);
obj << Fit Logistic 4P Hill;
回复:JMP 抗体滴定曲线如果可能,请发布您的数据(JMP 数据表)。
另外,您是否在与“分析”>“专业建模”>“非线性”平台关联的模型库中使用 Hill 模型? 或者您是否使用“分析”>“专业建模”>“拟合曲线”平台?