항체 적정 곡선용 JMP안녕
Hi All, im a very novice jmp user and am trying to analyze an antibody titration curve using JMP. I tried to fit a 4PHill. However i got some very weird values on my estimates with my inflection point (-1.72) and lower asymptote (-26453.17) having negative values while the upper asymptote showed 97.11. In additions the P value was not significant for both the inflection point and lower asymptote (approx 0.98 on both). Am i using the wrong type of curve? How do i approach this? any help is appreciated! Thanks!
고급 통계 모델링Re: 항체 적정 곡선에 대한 JMP에 추가 @Chris_Kirchberg 님의 의견에 따르면 선택한 모델로 수렴하지 못하는 또 다른 일반적인 원인은 과도하게 지정되었다는 것입니다. 예를 들어, 희석 곡선은 4PLC일 수 있지만 실험적으로 곡선의 일부만 관찰되면 모든 매개변수를 추정하기 어렵고 더 간단한 모델이 더 성공적일 것입니다. 그렇지 않으면 더 복잡한 모델을 적합시키려면 더 많은 곡선을 관찰하도록 도메인을 확장해야 합니다.
Re: 항체 적정 곡선에 대한 JMP<@Thierry_S..추가 팁에 감사드립니다...동료는 선형 영역을 결정하기 위해 이변량 맞춤과 가중치를 권장했습니다. 그러나 일단 그것이 선형 영역에서 선택되어야 하는 항체의 농도가 결정되면(제 경우에는 선형 영역에서 3점을 얻습니다). 무엇을 고를지 아직도 고민중>
Re: 항체 적정 곡선에 대한 JMP안녕,
추가하려면 @Chris_Kirchberg , 데이터가 본질적으로 기하급수적 성장 곡선이기 때문에 실제로 물류 모델이 필요한지 궁금합니다.
아래에서 Exponential 3P, Logistic 3P 및 Logistic 4P Hill 모델의 비교를 참조하십시오. Exponential 3P 모델은 데이터를 설명하는 데 가장 효과적입니다(가장 낮은 AICc).
최상의,
TS
Re: 항체 적정 곡선에 대한 JMP@크리스 ...정말 감사합니다..로지스틱 3P는 훌륭하게 작동하고 음수 값 문제를 해결했습니다...이제 P<0.001로 더 좋아 보입니다.그러나 최적의 역가 항체를 도출하기 위해 이것을 추정하는 방법에 대해서는 여전히 길을 잃습니다. 대량의.
Re: 항체 적정 곡선에 대한 JMP@Mark_Bailey ..나는 두 가지 방법으로 시도했지만 여전히 음수 값을 제공했습니다.:-(
Re: 항체 적정 곡선에 대한 JMP안녕 @Apssub ,
문제는 데이터에 대해 선택된 모델이라고 생각합니다.3개 매개변수 모델이 더 적합하며 음수 값을 얻는 이유입니다.곡선의 모양을 확인하십시오. 0에서 어떤 숫자로 가다가 어떤 점근선에서 점점 가늘어집니다. 이것이 3 매개변수 모델의 모양입니다.
도움이 되길 바랍니다.
Re: 항체 적정 곡선에 대한 JMP안녕,
응답해 주셔서 감사합니다.
첨부파일을 참조하시기 바랍니다.
더 낮은 점근선과 변곡점 모두 이 곡선에서 의미가 없음을 시사하는 더 높은 P 값을 갖기 때문에 P 값에서 무엇을 이해해야 하는지 확실하지 않습니다. 적정에서 항체의 최적 질량을 결정하기 위해 이것을 어떻게 사용할 수 있습니까?
감사해요!
Re: 항체 적정 곡선에 대한 JMP안녕 @Apssub
~처럼 @Mark_Bailey 이미 게시된 샘플은 정말 도움이 될 것입니다. 기밀 정보가 공개되지 않도록 익명화할 수도 있습니다.
예를 들어 스크립팅 색인에서 해당 스크립트를 찾을 수 있습니다( > 도움말 > 스크립팅 색인 > 4P HILL 검색).
간단히 실행하고 결과를 살펴보십시오.
Names Default To Here( 1 );
dt = Open( "$SAMPLE_DATA/Nonlinear Examples/Bioassay.jmp" );
obj = dt << Fit Curve(
Y( :Toxicity ),
X( :log Conc ),
Group( :formulation )
);
obj << Fit Logistic 4P Hill;
Re: 항체 적정 곡선에 대한 JMP가능한 경우 데이터(JMP 데이터 테이블)를 게시하십시오.
또한 분석 > 특수 모델링 > 비선형 플랫폼과 연결된 모델 라이브러리에서 Hill 모델을 사용하고 있습니까? 아니면 Analyze > Specialized Modeling > Fit Curve 플랫폼을 사용하고 있습니까?
