JMP per le curve di titolazione degli anticorpiCIAO
Hi All, im a very novice jmp user and am trying to analyze an antibody titration curve using JMP. I tried to fit a 4PHill. However i got some very weird values on my estimates with my inflection point (-1.72) and lower asymptote (-26453.17) having negative values while the upper asymptote showed 97.11. In additions the P value was not significant for both the inflection point and lower asymptote (approx 0.98 on both). Am i using the wrong type of curve? How do i approach this? any help is appreciated! Thanks!
Modellazione statistica avanzataRe: JMP per le curve di titolazione degli anticorpiAggiunta a @Chris_Kirchberg Secondo il commento di , un'altra causa comune per la mancata convergenza al modello scelto è che è troppo specificato. Ad esempio, la curva di diluizione potrebbe essere un 4PLC, ma se sperimentalmente si osserva solo una parte della curva, è difficile stimare tutti i parametri e un modello più semplice avrà più successo. In caso contrario, è necessario estendere il dominio per osservare una parte maggiore della curva se si desidera adattare il modello più complesso.
Re: JMP per le curve di titolazione degli anticorpi<@Thierry_S..grazie per i suggerimenti aggiuntivi...un collega ha consigliato anche un adattamento bivariato e un peso per determinare la regione lineare. Ma una volta determinato quale concentrazione di anticorpi dovrebbe essere scelta dalla regione lineare (nel mio caso ottengo 3 punti nella regione lineare). Sono ancora confuso su cosa scegliere>
Re: JMP per le curve di titolazione degli anticorpiCIAO,
Da aggiungere a @Chris_Kirchberg , mi chiedo se hai davvero bisogno di un modello logistico perché i tuoi dati sono essenzialmente una curva di crescita esponenziale.
Vedi sotto il confronto dei modelli Exponential 3P, Logistic 3P e Logistic 4P Hill: il modello Exponential 3P è il più efficace nel descrivere i tuoi dati (AICc più basso).
Migliore,
ST
Re: JMP per le curve di titolazione degli anticorpi@Chris ...grazie mille..il Logistic 3P funziona alla grande e ha risolto il problema dei valori negativi...ora sembra migliore con P<0.001..tuttavia sono ancora perso su come estrapolare questo per derivare l'anticorpo con titolo ottimale massa.
Re: JMP per le curve di titolazione degli anticorpi@Mark_Bailey ..l'ho provato in entrambi i modi e mi ha comunque dato i valori negativi 
Re: JMP per le curve di titolazione degli anticorpiCIAO @Apssub ,
Penso che il problema sia il modello scelto per i dati.Un modello a 3 parametri sarebbe più appropriato e perché stai ottenendo valori negativi.Notare la forma della curva. Andare da 0 a un certo numero e poi ridursi a un certo asintoto. Questa è la forma di un modello a 3 parametri.
Spero che aiuti.
Re: JMP per le curve di titolazione degli anticorpiCIAO,
Grazie per aver risposto
Vedere file allegato.
Non sono sicuro di cosa capire dai valori P poiché sia l'asintoto inferiore che il punto di flesso hanno valori P più alti che suggeriscono alcun significato su questa curva ... come posso usarlo per determinare la massa ottimale di anticorpi dalla titolazione
Grazie!
Re: JMP per le curve di titolazione degli anticorpiCIAO @Apssub
COME @Mark_Bailey già pubblicato, un campione sarebbe davvero utile, puoi anche renderlo anonimo per evitare di svelare informazioni riservate.
Hai dato un'occhiata agli esempi, ad esempio nell'indice di scripting troverai quello script ( > Aiuto > Indice di scripting > cerca 4P HILL).
Basta eseguire e dare un'occhiata al risultato.
Names Default To Here( 1 );
dt = Open( "$SAMPLE_DATA/Nonlinear Examples/Bioassay.jmp" );
obj = dt << Fit Curve(
Y( :Toxicity ),
X( :log Conc ),
Group( :formulation )
);
obj << Fit Logistic 4P Hill;
Re: JMP per le curve di titolazione degli anticorpiSi prega di inviare i dati (tabella dati JMP) se possibile.
Inoltre, stai utilizzando il modello Hill nella libreria di modelli associata alla piattaforma Analizza > Modellazione specializzata > Non lineare? Oppure stai utilizzando la piattaforma Analizza > Modellazione specializzata > Adatta curva?
