JMP pour les courbes de titrage des anticorpsSalut
Hi All, im a very novice jmp user and am trying to analyze an antibody titration curve using JMP. I tried to fit a 4PHill. However i got some very weird values on my estimates with my inflection point (-1.72) and lower asymptote (-26453.17) having negative values while the upper asymptote showed 97.11. In additions the P value was not significant for both the inflection point and lower asymptote (approx 0.98 on both). Am i using the wrong type of curve? How do i approach this? any help is appreciated! Thanks!
Modélisation statistique avancéeRe: JMP pour les courbes de titrage des anticorpsAjout à @Chris_Kirchberg Selon le commentaire de, une autre cause fréquente de l'échec de la convergence vers le modèle choisi est qu'il est sur-spécifié. Par exemple, la courbe de dilution peut être celle d’un 4PLC, mais si expérimentalement seule une partie de la courbe est observée, il est alors difficile d’estimer tous les paramètres et un modèle plus simple sera plus efficace. Sinon, vous devez étendre le domaine pour observer une plus grande partie de la courbe si vous souhaitez adapter le modèle plus complexe.
Re: JMP pour les courbes de titrage des anticorps<@Thierry_S..merci pour les conseils supplémentaires...un collègue a également recommandé un ajustement bivarié et une pondération pour déterminer la région linéaire. Mais une fois que cela est déterminé, quelle concentration d'anticorps doit être choisie dans la région linéaire (dans mon cas, j'obtiens 3 points dans la région linéaire). Je ne sais toujours pas quoi choisir>
Re: JMP pour les courbes de titrage des anticorpsSalut,
Ajouter à @Chris_Kirchberg , Je me demande si vous avez réellement besoin d'un modèle logistique, car vos données sont essentiellement une courbe de croissance exponentielle.
Voir ci-dessous la comparaison des modèles Exponential 3P, Logistic 3P et Logistic 4P Hill : le modèle Exponential 3P est le plus efficace pour décrire vos données (AICc le plus bas).
Meilleur,
TS
Re: JMP pour les courbes de titrage des anticorps@Chris ...merci beaucoup...le Logistic 3P fonctionne très bien et a résolu le problème des valeurs négatives...maintenant, il semble mieux avec P<0,001..cependant, je ne sais toujours pas comment extrapoler cela pour dériver l'anticorps titré optimal masse.
Re: JMP pour les courbes de titrage des anticorps@Mark_Bailey ..j'ai essayé dans les deux sens et cela m'a toujours donné des valeurs négatives 
Re: JMP pour les courbes de titrage des anticorpsSalut @Apssub ,
Je pense que le problème vient du modèle choisi pour les données.Un modèle à 3 paramètres serait plus approprié et expliquerait pourquoi vous obtenez des valeurs négatives.Notez la forme de la courbe. Passer de 0 à un certain nombre, puis diminuer à une asymptote. C'est la forme d'un modèle à 3 paramètres.
J'espère que cela pourra aider.
Re: JMP pour les courbes de titrage des anticorpsSalut,
Merci d'avoir répondu
Voir pièce jointe.
Je ne sais pas quoi comprendre des valeurs P, car l'asymptote inférieure et le point d'inflexion ont des valeurs P plus élevées, ce qui suggère aucune signification sur cette courbe. Comment puis-je l'utiliser pour déterminer la masse optimale d'anticorps à partir du titrage.
Merci!
Re: JMP pour les courbes de titrage des anticorpsSalut @Apssub
comme @Mark_Bailey déjà publié, un échantillon serait très utile, vous pouvez également l'anonymiser pour éviter de dévoiler des informations confidentielles.
Avez-vous jeté un œil aux exemples, par exemple dans l'index des scripts, vous trouverez ce script ( > Aide > Index des scripts > recherchez 4P HILL).
Exécutez simplement et regardez le résultat.
Names Default To Here( 1 );
dt = Open( "$SAMPLE_DATA/Nonlinear Examples/Bioassay.jmp" );
obj = dt << Fit Curve(
Y( :Toxicity ),
X( :log Conc ),
Group( :formulation )
);
obj << Fit Logistic 4P Hill;
Re: JMP pour les courbes de titrage des anticorpsVeuillez publier vos données (tableau de données JMP) si possible.
De plus, utilisez-vous le modèle Hill dans la bibliothèque de modèles associée à la plateforme Analyse > Modélisation spécialisée > Non linéaire ? Ou utilisez-vous la plateforme Analyse > Modélisation spécialisée > Ajuster la courbe ?
