抗体滴定曲線用の JMPこんにちは
Hi All, im a very novice jmp user and am trying to analyze an antibody titration curve using JMP. I tried to fit a 4PHill. However i got some very weird values on my estimates with my inflection point (-1.72) and lower asymptote (-26453.17) having negative values while the upper asymptote showed 97.11. In additions the P value was not significant for both the inflection point and lower asymptote (approx 0.98 on both). Am i using the wrong type of curve? How do i approach this? any help is appreciated! Thanks!
高度な統計モデリングRe: 抗体滴定曲線に関する JMP追加する@Chris_Kirchbergさんのコメントによると、選択したモデルに収束しないもう 1 つの一般的な原因は、モデルが過剰に指定されていることです。 たとえば、希釈曲線は 4PLC である可能性がありますが、実験的に曲線の一部のみが観察された場合、すべてのパラメーターを推定することは困難であり、より単純なモデルの方が成功率が高くなります。 それ以外の場合、より複雑なモデルに適合させたい場合は、ドメインを拡張してより多くの曲線を観察する必要があります。
Re: 抗体滴定曲線に関する JMP<@Thierry_S..追加のヒントをありがとう...同僚は、線形領域を決定するために二変量近似と重み付けも推奨しました。 しかし、それが決定されたら、線形領域からどの濃度の抗体を選択する必要があります（私の場合、線形領域で3つの点が得られます）。 どれを選ぶかまだ迷っています>
Re: 抗体滴定曲線に関する JMPこんにちは、
追加するには@Chris_Kirchberg , データは本質的に指数関数的な増加曲線であるため、実際にロジスティック モデルが必要なのかどうかは疑問です。
以下の指数 3P、ロジスティック 3P、およびロジスティック 4P Hill モデルの比較を参照してください。指数 3P モデルは、データを記述するのに最も効果的です (AICc が最も低い)。
最高、
TS
Re: 抗体滴定曲線に関する JMP@クリス...本当にありがとう。ロジスティック 3P はうまく機能し、負の値の問題を解決しました。現在は P<0.001 で改善されています。ただし、これをどのように外挿して最適な力価の抗体を導き出すかについてはまだ迷っています。質量。
Re: 抗体滴定曲線に関する JMP@Mark_Bailey ..両方の方法で試してみましたが、それでも負の値が得られました:-(
Re: 抗体滴定曲線に関する JMPこんにちは@Apssub 、
問題はデータに選択されたモデルだと思います。3 パラメーター モデルの方が適切であり、負の値が得られる理由を説明します。曲線の形状に注目してください。 0 からある数値まで進み、その後、ある漸近線で漸減します。 それが 3 パラメーター モデルの形状です。
それが役立つことを願っています。
Re: 抗体滴定曲線に関する JMPこんにちは、
ご返信いただきありがとうございます
添付ファイルをご覧ください。
より低い漸近線と変曲点の両方がより高い P 値を持ち、この曲線に有意性がないことを示唆しているため、P 値から何を理解すればよいかわかりません。滴定から最適な抗体の質量を決定するためにこれをどのように使用できますか
ありがとう！
Re: 抗体滴定曲線に関する JMPこんにちは@Apssub
として@Mark_Baileyすでに投稿されていますが、サンプルは非常に役立ちます。機密情報の公開を避けるために匿名化することもできます。
例をご覧になりましたか。たとえば、スクリプト インデックスでそのスクリプトが見つかります ( > [ヘルプ] > [スクリプト インデックス] > [4P HILL] を検索)。
単純に実行して結果を見てみましょう。
Names Default To Here( 1 );
dt = Open( "$SAMPLE_DATA/Nonlinear Examples/Bioassay.jmp" );
obj = dt << Fit Curve(
Y( :Toxicity ),
X( :log Conc ),
Group( :formulation )
);
obj << Fit Logistic 4P Hill;
Re: 抗体滴定曲線に関する JMP可能であればデータ（JMPデータテーブル）を投稿してください。
また、[分析] > [特殊モデリング] > [非線形] プラットフォームに関連付けられたモデル ライブラリで Hill モデルを使用していますか? それとも、[分析] > [特殊なモデリング] > [フィット カーブ] プラットフォームを使用していますか?
