GC-FID-Daten: PLS, SVM, FDE?Hallo,
Wir stehen in Kontakt mit einem Unternehmen, das GC-FID (Gaschromatographie-Flammenionisationsdetektor) als Analysewerkzeug verwendet.
Sie vergleichen Rohstoffe und möchten verstehen, welche analytischen Eigenschaften zu besseren Leistungen führen.
Hat jemand diese Art von Daten?
PLS scheint ein geeignetes Werkzeug zu sein, aber ich habe SVM in einigen Veröffentlichungen gesehen, irgendwelche Gedanken?
Ich habe auch über FDE nachgedacht, aber ist es die zusätzlichen Kosten wert, wenn PLS das traditionelle Werkzeug ist?
Danke.
Emmanuel
@phil_kay @ Bill_Worley
Betreff: GC-FID-Daten: PLS, SVM, FDE?Wissen Sie zufällig, ob sich die Daten im Frequenz- oder Zeitbereich befinden?
ETA: sieht aus wie Frequenzbereich. Der Benzin-NIR-Datensatz wäre wahrscheinlich eng. PLS wird hier verwendet.
Angenommen, so etwas: https://www.researchgate.net/figure/Gas-chromatography-flame-ionization-detector-FID-results-of-the-outer-nest-tube_fig1_43285974
Betreff: GC-FID-Daten: PLS, SVM, FDE?@ Emmanuel_Romeu ,
PLS ist seit langem der Industriestandard für diese Art der Analyse.Ich persönlich denke, dass FDE für diese Art von Daten wunderbar funktioniert, insbesondere wenn Sie alle Datenmanipulationsoptionen wie DTW berücksichtigen.Das Analysieren von Chromatographiedaten kann eine Herausforderung sein, da die Läufe unterschiedliche Zeitlängen haben können (zumindest in der F & E-Umgebung) und die Analyse mit PLS sehr schmerzhaft ist.@ HadleyMyers hat ein großartiges Beispiel für die Probleme bei der Verwendung von PLS, wenn die Daten nicht in perfekter Form vorliegen.Hier ist die Folie. Die grundlegende Nachricht, die mit PLS analysiert wurde, dauerte Monate und führte zu einem Forschungsbericht.Dies kann mit FDE in wenigen Minuten erledigt werden.
Betreff: GC-FID-Daten: PLS, SVM, FDE?Emmanuel,
FDE ist eine gute Möglichkeit, Chromatogramme zu vergleichen, aber nicht unbedingt ein Werkzeug, das Sie zur Quantifizierung dieser Art von Daten verwenden würden.Wenn Sie jedoch eine Zielkurve haben, kann dies sehr nützlich sein.
GC-Chromatogramme basieren auf der Elutionszeit einer bestimmten verdampften Verbindung, nachdem sie mit einer stationären Phase in einer Chromatographiesäule in Wechselwirkung getreten ist (oder nicht).Alle Chromatographie basiert im Allgemeinen auf ähnlichen Prinzipien.Der Erkennungsmodus kann stark variieren.
Nachdem eine Probe in den Ofen injiziert wurde, wird sie blitzverdampft und diese Mischung von Gasen wird von einem Trägergas auf die Säule befördert.Normalerweise wird Helium, aber auch Wasserstoff als Trägergas verwendet.GC kann zur Identifizierung oder Quantifizierung verwendet werden.
Die Identifizierung basiert auf der Injektion bekannter Verbindungen in das Chromatographiesystem und der Bestimmung der Retentionszeit, wenn diese durch den Detektor eluieren, in diesem Fall FID.Wenn die Verbindung auf den Detektor trifft, "brennt" sie und erzeugt ein Signal, das in einem "Chromatogramm" aufgezeichnet wird.Dies kann eine sinnvolle Verwendung für FDE mit einer Zielkurve sein.
Die Quantifizierung ist aufwändiger und erfordert die Herstellung von Lösungen, die bekannte Mengen der interessierenden Verbindung (en) enthalten.Sie würden aus dieser Art der Analyse eine Kalibrierungskurve entwickeln.
PLS ist sinnvoll, wenn das gesamte Chromatogramm aufgezeichnet wird und sie Zeitpunkte als Spaltenüberschriften haben, die den spektroskopischen Daten im nahen IR in den Benzindaten ähnlich sind @ Danielvalente empfohlen.Jede Zeile ist eine Probe.
Diese Daten sind sehr breit und deshalb funktioniert PLS so gut.Ich habe festgestellt, dass die generalisierte Regression auch mit einem scannenden elastischen Netz mit Spektraldaten sehr gut funktioniert, und neuronale Netze sind aufgrund ihrer Flexibilität ebenfalls einen Versuch wert.
Ich würde vorschlagen, Kontakt aufzunehmen @JeremyAshJMP Er hat mit chromatographischen Daten und einem Peak-Finding-Algorithmus auf der FDE-Plattform gearbeitet.
Entschuldigen Sie die Lektion über Chromatographie, aber ich hoffe, dass sie Ihnen hilft, besser zu verstehen, was Ihr Kunde erreichen möchte.
Beste,
Rechnung
Betreff: GC-FID-Daten: PLS, SVM, FDE?Möglicherweise können Sie die Ergebnisse quantifizieren, wenn die FPCs kalibriert wurden. Ein einfaches Beispiel: Bereiten Sie Proben mit bekannter Zusammensetzung vor, erhalten Sie die Funktionen und verwenden Sie die Zusammensetzungsvariablen als zusätzliche Informationen. Wie eine FDOE.
Betreff: GC-FID-Daten: PLS, SVM, FDE?Viele gute Antworten hier.
Ich möchte nur hinzufügen, dass Sie zuerst einige Details ihrer Datenanalyse-Herausforderung überprüfen sollten. Welche Datenform haben sie zunächst: Rohchromatogramm oder zusammengefasste Daten in Form einer "Peak-Tabelle"?
Mit Chromatographiemethoden identifiziert die Instrumentensoftware häufig die verschiedenen Peaks im Chromatogramm für jede Probe und erstellt zusammenfassende Statistiken (integrierter Bereich, Breite, Symmetrie, ...) für jeden Peak. Oft ist eine Datentabelle der integrierten Fläche für jeden Peak für jede Probe das, was sie zur Lösung ihres wissenschaftlichen Problems benötigen. Grundsätzlich erzeugt jede unterschiedliche chemische Einheit in einer Probe einen Peak an einem eindeutigen Punkt auf der Zeit- / x-Achse des Chromatogramms. Die Fläche des Peaks ist proportional zur Menge dieser Entität in der Stichprobe.
Lassen Sie mich wissen, ob sie dies tun müssen. Ich habe ein Beispiel, das Sie möglicherweise verwenden können, aber ich möchte es nicht weit verbreiten.
Wenn sie rohe Chromatogramme verwenden müssen, könnte FDE nützlich sein, wie andere erwähnt haben. Es gibt einige Beispiele für Kunden, die dies bereits unter bestimmten Umständen tun. Die FDE-Fähigkeiten müssen jedoch noch erheblich weiterentwickelt werden, um in den meisten Chromatographie-Beispielen wirklich nützlich zu sein.Derzeit ist FDE nur mit sehr einfachen Chromatogrammen nützlich, und es klingt nicht so, als wäre dies in Ihrem Beispiel der Fall. Ich kenne keine Beispieldatensätze, die Sie verwenden könnten.
Ich hoffe das hilft.
Phil
Betreff: GC-FID-Daten: PLS, SVM, FDE?Hallo Dan,
Mein Verständnis ist "Zeitbereich", aber es lohnt sich zu überprüfen, damit ich es tun kann.
Ist der Datensatz der hier erwähnte "Benzin Octane NIR" ( D50 Benzin Octane NIR (Gardner) - JMP-Benutzergemeinschaft )?
Emmanuel
Betreff: GC-FID-Daten: PLS, SVM, FDE?Hallo Peter,
in der Tat hatte ich vor, DTW zu fördern. Zu diesem Zeitpunkt sagte der Kunde jedoch, es sei einfach, die Größe des Datensatzes von 70.000 Zeilen auf 7.000 zu reduzieren und die Chromatogramme auszurichten, sodass keine eindeutigen Schmerzen auftreten. Ich werde während des Folgetreffens sehen. Ich werde kontaktieren @ HadleyMyers für den Datensatz, den Sie erwähnt haben.
Emmanuel
Betreff: GC-FID-Daten: PLS, SVM, FDE?Hallo Emmanuel,
Ich denke, das ist der Datensatz, auf den sich Pete bezieht.Es sind einfach die Fermentationsdaten, die in ein Großformat konvertiert wurden.Jeder, der versucht, es mit PLS zu analysieren, wird feststellen, dass es länger und viel komplizierter ist als der FDE-Workflow und dennoch keine Antworten liefert, die so einfach zu kommunizieren sind.
