Données GC-FID: PLS, SVM, FDE?Bonjour,
nous sommes en contact avec une société utilisant GC-FID (Gas Chromatography-Flame Ionization Detector) comme outil d'analyse.
Ils comparent les matières premières et veulent comprendre quelle propriété analytique conduit à de meilleures performances.
Quelqu'un a-t-il ce genre de données?
PLS semble un outil approprié mais j'ai vu SVM dans certaines publications, des pensées?
Je pensais aussi à FDE mais cela vaut-il le coût supplémentaire si PLS est l'outil traditionnel?
Merci.
Emmanuel
@phil_kay @bill_worley
Re: Données GC-FID: PLS, SVM, FDE?Savez-vous si les données sont dans le domaine fréquentiel ou temporel?
ETA: ressemble au domaine fréquentiel. L'ensemble de données NIR sur l'essence serait probablement proche. PLS est utilisé ici.
En supposant quelque chose comme ça: https://www.researchgate.net/figure/Gas-chromatography-flame-ionization-detector-FID-results-of-the-outer-nest-tube_fig1_43285974
Re: Données GC-FID: PLS, SVM, FDE?@Emmanuel_Romeu ,
PLS est depuis longtemps la norme de l'industrie pour ce type d'analyse.Personnellement, je pense que FDE fonctionne à merveille pour ce type de données, en particulier lorsque vous prenez en compte toutes les options de manipulation de données telles que DTW.L'analyse des données de chromatographie peut être un défi car les analyses peuvent être de différentes durées (au moins dans le cadre de la R&D) et c'est très pénible à analyser avec PLS.@HadleyMyers a un excellent exemple des douleurs liées à l'utilisation de PLS lorsque les données ne sont pas en parfait état.Voici la diapositive le message de base analysé avec PLS a pris des mois et a abouti à un document de recherche.Cela peut être fait en quelques minutes avec FDE.
Re: Données GC-FID: PLS, SVM, FDE?Emmanuel,
FDE est un bon moyen de comparer des chromatogrammes, mais ce n'est pas nécessairement un outil que vous utiliseriez pour quantifier ce type de données.Cependant, si vous avez une courbe cible, cela peut être très utile.
Les chromatogrammes GC sont basés sur le temps d'élution d'un composé vaporisé donné après qu'il interagit (ou non) avec une phase stationnaire dans une colonne chromatographique.Toute chromatographie est basée sur des principes similaires en général.Le mode de détection peut varier considérablement.
Après avoir injecté un échantillon dans le four, il est vaporisé instantanément et ce méli-mélo de gaz est transporté sur la colonne par un gaz porteur.Habituellement, l'hélium, mais l'hydrogène est également utilisé comme gaz vecteur.GC peut être utilisé pour identifier ou quantifier.
L'identification est basée sur l'injection de composés connus dans le système chromatographique et la détermination du temps de rétention lors de leur élution à travers le détecteur, FID dans ce cas.Lorsque le composé atteint le détecteur, il "brûle" et génère un signal qui est enregistré dans un "chromatogramme".Cela peut être une utilisation raisonnable pour FDE avec une courbe cible.
La quantification est plus impliquée et nécessite la préparation de solutions contenant des quantités connues du ou des composés d'intérêt.Vous développeriez une courbe d'étalonnage à partir de ce type d'analyse.
Le PLS est raisonnable si le chromatogramme entier est enregistré et qu'ils ont des points de temps comme en-têtes de colonne similaires aux données spectroscopiques proche-IR dans les données d'essence qui @danielvalente conseillé.Chaque ligne est un échantillon.
Ces données sont très larges et c'est pourquoi PLS fonctionne si bien.J'ai trouvé que la régression généralisée fonctionne également très bien en utilisant un filet élastique à balayage avec des données spectrales et que les réseaux neuronaux valent également la peine d'essayer en raison de leur flexibilité.
Je suggérerais de contacter @JeremyAshJMP car il a travaillé avec des données chromatographiques et un algorithme de recherche de pics dans la plate-forme FDE.
Désolé pour la leçon sur la chromatographie, mais j'espère que cela aidera à mieux comprendre ce que votre client essaie d'accomplir.
Meilleur,
Facture
Re: Données GC-FID: PLS, SVM, FDE?Vous pourrez peut-être quantifier les résultats si les FPC ont été étalonnés. Un exemple simple, préparer des échantillons avec une composition connue, obtenir les fonctions, puis utiliser les variables de composition comme informations supplémentaires. Comme un FDOE.
Re: Données GC-FID: PLS, SVM, FDE?Beaucoup de bonnes réponses ici.
J'ajouterais simplement que vous devriez d'abord vérifier certains des détails de leur défi d'analyse des données. Tout d'abord, quelle forme de données ont-ils: un chromatogramme brut ou des données résumées sous la forme d'un "tableau des pics"?
Avec les méthodes de chromatographie, le logiciel de l'instrument identifiera souvent les différents pics du chromatogramme pour chaque échantillon et produira des statistiques récapitulatives (surface intégrée, largeur, symétrie, ...) pour chaque pic. Souvent, un tableau de données de zone intégrée pour chaque pic pour chaque échantillon est ce dont ils ont besoin pour résoudre leur problème scientifique. Fondamentalement, chaque entité chimique différente dans un échantillon produira un pic à un point unique sur l'axe temps / x du chromatogramme. L'aire du pic est proportionnelle à la quantité de cette entité dans l'échantillon.
Faites-moi savoir si c'est ce qu'ils doivent faire. J'ai un exemple que vous pourrez peut-être utiliser, mais je ne veux pas le partager largement.
S'ils ont besoin d'utiliser des chromatogrammes bruts, le FDE pourrait être utile, comme d'autres l'ont mentionné. Il existe des exemples de clients faisant déjà cela dans certaines circonstances. Mais les capacités FDE nécessitent encore un développement considérable pour être vraiment utiles dans la majorité des exemples de chromatographie.Actuellement, FDE ne sera utile qu'avec des chromatogrammes très simples et il ne semble pas que ce soit le cas dans votre exemple. Je ne connais aucun exemple d'ensembles de données que vous pourriez utiliser.
J'espère que ça aide.
Phil
Re: Données GC-FID: PLS, SVM, FDE?Bonjour Dan,
ma compréhension est «domaine temporel», mais cela vaut la peine de vérifier, donc je vais le faire.
Le jeu de données "Gasoline Octane NIR" est-il mentionné ici ( D50 Gasoline Octane NIR (Gardner) - Communauté d'utilisateurs JMP )?
Emmanuel
Re: Données GC-FID: PLS, SVM, FDE?Bonjour Peter,
en effet, j'avais en tête de promouvoir DTW. Cependant, à ce stade, le client a déclaré qu'il était facile de réduire la taille de l'ensemble de données de 70 000 lignes à 7 000 et d'aligner les chromatogrammes, de sorte qu'il n'y a pas de problème clair. Je verrai lors de la réunion de suivi. je contacterai @HadleyMyers pour l'ensemble de données que vous avez mentionné.
Emmanuel
Re: Données GC-FID: PLS, SVM, FDE?Salut Emmanuel,
Je pense que c'est l'ensemble de données auquel Pete fait référence.Ce sont simplement les données de fermentation converties en grand format.Quiconque essaie de l'analyser à l'aide de PLS constatera que c'est plus long et beaucoup plus compliqué que le flux de travail FDE, et ne fournit toujours pas de réponses aussi facilement communiquées.
