JMP Genomics: colapso de datos de expresión diferencial de nivel de isoformas a nivel de genTengo un conjunto de datos de RNA-Seq donde las lecturas se asignan al nivel de transcripción, lo que da como resultado múltiples identificadores de transcripción únicos que comparten ID de genes comunes. Estoy realizando expresión genética diferencial en JMP Genomics a nivel de identificadores de transcripción, pero me gustaría colapsar esa información a nivel genético de una manera estadísticamente significativa. La mayoría de las herramientas de análisis de datos posteriores (ontología genética, análisis de vías) requerirán información a nivel de genes y datos de expresión. Por el momento, no tengo una solución de software que me permita mapear el nivel de genes antes de JMP Genomics. ¿Existe una solución para esto en JMP Genomics?
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