修复单个单元格中的两个值修复在同一单元格中具有两个值的最佳方法是什么?
每行分配给特定的患者,列是具有可能突变的基因。 问题是一对夫妇的同一基因中有多个突变,请参见所附图像。 我如何最好地告诉JMP这是两个单独的值? 我尝试使用相同的患者ID进行两行操作,但恐怕这会使程序将其他突变计数两次。 谢谢你。

数据表回复:在单个单元格中修复两个值你好@Earendur ,
您可能应该创建两个名为Mutation 1和Mutation 2或Mutation N的列,如果有N个这样的突变,则可以使用列公式
Word(n, s, delim)
其中n是第一个突变的第一个单词,依此类推,而s是现有的突变列。 您要使用的delim是“,”,因为突变用逗号分隔,然后用空格隔开。 那应该给您您想要的。

希望这可以帮助!,
DS
回复:在单个单元格中修复两个值谢谢@DiedrichSchmidt , 那讲得通。
如果我分成两列,如何在分析时告诉JMP我希望它同时考虑Mut1 ... MutN?
回复:在单个单元格中修复两个值你好@Earendur ,
也许在特定领域具有更多相关经验的人可以为您提供更具体的答案。
当我遇到这种情况时,我的想法是这样的:首先,我需要估计情况的规模。 有多少个案例有两个突变?有三个或更多吗?有很多不同的组合吗?还是特定的一对是典型的?
您可以使用突变列上的文本浏览器查看所有个体和组合的分布。
完成此操作后,您需要确保正确定义分析单位,以及观察值是独立的,重复的还是嵌套的?
您可以对任何问题有任何答案,我可以帮助您建立正确的数据结构进行分析。
您会将突变用作自变量还是因变量? 分析单位可以是突变吗?还是必须要有耐心?如果是患者,第二个突变可能是数据中的另一行,可能需要针对非独立观察进行调整。如果突变类别太多,也许您想以一种有意义的方式将其汇总,其中也将包括这些组合。
希望这至少可以有所帮助,
罗恩
回复:在单个单元格中修复两个值你好@Earendur ,
您使用的是标准JMP吗?我无法提供有关JMP Clinical或Genomics的任何建议,仅提供有关分析的JMP和JMP Pro。
但是,您可以进行标准分析,请参阅我创建的组合表和“最小二乘法”脚本。 通常,您会将变异列转换为X因子,无论您的Y响应是什么,然后运行平台。 根据您的操作,您可以进行方差分析,逻辑拟合或偶然性等。甚至可以使用散点图矩阵(“图形”>“散点图”)进行字符和数字列的可视化处理,等等。
希望这可以帮助!,
DS
回复:在单个单元格中修复两个值@DiedrichSchmidt
我正在使用标准JMP。
感谢您提供样品表。 您创建的“ Fit Group”与我要达到的目标非常相似,我只需要将所有突变变体“ AZ”显示在同一图上,而不是在两个单独的图中即可。
当我在“ Mut”列中执行此操作时,它会认为“ A,B”和“ A,D”等是单个突变,因此不会沿x轴。
回复:在单个单元格中修复两个值你好@Earendur ,
如果您使用Mut 1和Mut 2列,则JMP永远不会将它们放在同一图形中进行ANOVA分析。 但是,您可以在Graph Builder中将它们一起绘制。 它将对它们进行分组,但是以一种很好的图形方式嵌套X轴,但是对于您可能需要进行的适当分析并没有真正起作用。

如果对Mut和Y列进行单向操作,则JMP会将“ A,B”,“ A,D”和“ G,I”突变视为单个“因子”。 如果某些突变总是以特定的对(例如DNA对)出现,那么您就不想将突变分成单独的列(我想),因为独特的配对是特殊的,而不是每个个体都那么单独。
JMP在每种情况下都做正确的事。 单向/ ANOVA可能也不适合您进行正确的分析-使用逻辑分析或对数据进行最小二乘拟合可能会更好。 (我通过复制/粘贴表末尾的Mut列添加了更多行。)

很多事情回到了什么@ron_horne谈到要如何构造数据以进行正确的分析。
希望这可以帮助!,
DS