1つのセルの2つの値を修正同じセルに2つの値があることを修正する最良の方法は何ですか?
各行は特定の患者に割り当てられ、列は突然変異の可能性がある遺伝子です。 問題は、2人の患者が同じ遺伝子に複数の突然変異を持っていることです。添付の画像を参照してください。 これらが2つの別々の値であることをJMPに伝えるにはどうすればよいですか? 同じ患者IDで2つの行を作成しようとしましたが、プログラムが他の変異を2回カウントする原因になるのではないかと心配しています。 ありがとうございました。

データ表再:単一のセル内の2つの値を修正こんにちは@Earendur 、
そのようなミューテーションがN個ある場合は、Mutation1とMutation2またはMutationNのような名前の2つの列を作成する必要があります。次に、次の式を使用して列式を使用できます。
Word(n, s, delim)
ここで、nは最初の突然変異の最初の単語などであり、sは既存の突然変異列です。 ミューテーションはコンマとスペースで区切られているため、使用するデリムは「、」です。 それはあなたが望むものを手に入れるはずです。

お役に立てれば!、
DS
再:単一のセル内の2つの値を修正ありがとう@DiedrichSchmidt 、 それは理にかなっている。
2つの列を作成する場合、分析を行うときにMut1 ... MutNを一緒に考慮したいことをJMPに伝えるにはどうすればよいですか?
再:単一のセル内の2つの値を修正こんにちは@Earendur 、
おそらく、特定の分野でより適切な経験を持つ誰かがあなたにもっと具体的な答えを与えることができます。
そのような状況に出くわしたときの私の考え方は、まず状況の規模を見積もる必要があります。 2つの突然変異があるケースはいくつありますか? 3つ以上ありますか?多くの異なる組み合わせがありますか?それとも、特定のものがペアに典型的ですか?
ミューテーション列のテキストエクスプローラーを使用して、すべての個人および組み合わせの分布を確認できます。
それが終わったら、分析の単位を正しく定義し、観測が独立しているか、繰り返されているか、ネストされているかを確認する必要がありますか?
質問に対する答えは、分析のための正しいデータ構造を確立するのに役立ちます。
突然変異を独立変数または従属変数として使用しますか? 分析の単位は突然変異でしょうか?または患者である必要がありますか?それが患者である場合、2番目の突然変異は、非独立した観察のために調整する必要があるかもしれないデータの別の行であるかもしれません。突然変異カテゴリが多すぎる場合は、意味のある方法でそれらを集約する必要があります。これには、組み合わせも含まれます。
これが少なくとも少し役立つことを願っています、
ロン
再:単一のセル内の2つの値を修正こんにちは@Earendur 、
標準のJMPを使用していますか?分析に関しては、JMPクリニカルまたはゲノミクスについてアドバイスすることはできません。JMPとJMPプロだけです。
ただし、標準的な分析を行うことはできます。私が作成した作成済みのテーブルとFit LeastSquaresスクリプトを参照してください。 一般に、突然変異列をXファクターとしてキャストし、Y応答が何であれ、プラットフォームを実行します。 実行している内容に応じて、ANOVA、ロジスティックフィット、または偶発性などを実行できます。視覚化などの目的で、文字列と数値列を使用して散布図マトリックス([グラフ]> [散布図])を実行することもできます。
お役に立てれば!、
DS
再:単一のセル内の2つの値を修正@DiedrichSchmidt
標準のJMPを使用しています。
サンプルテーブルをありがとう。 あなたが作成した「FitGroup」は、私が達成しようとしているものと非常に似ています。2つの別々のグラフではなく、すべてのミューテーションバリアント「AZ」を同じグラフに表示する必要があります。
「Mut」列でこれを行うと、「A、B」や「A、D」などは単一の突然変異であると見なされ、それらを個々の「A」、「B」、「D」のカテゴリに割り当てません。 x軸。
再:単一のセル内の2つの値を修正こんにちは@Earendur 、
Mut1列とMut2列を使用する場合、JMPはANOVA分析のためにそれらを同じグラフに配置することはありません。 ただし、グラフビルダーでそれらを一緒にグラフ化することはできます。 それらをグループ化しますが、X軸を適切なグラフィック方法でネストしますが、後で行う可能性のある適切な分析にはあまり役立ちません。

JMPは、Mut列とY列で一方向を実行する場合、「A、B」、「A、D」、および「G、I」の突然変異を単一の「因子」として扱います。 特定の突然変異が常に特定のペアとして発生する場合(DNAペアの場合のように)、突然変異を別々の列に分割することは望ましくありません(私は思う)。 。
JMPはそれぞれの場合に正しいことをしています。 一元配置/ ANOVAは、どちらの場合も適切な分析ではない可能性があります。ロジスティック分析を使用するか、データに最小二乗法を適用する方がよい場合があります。 (テーブルの最後にあるMut列をコピーして貼り付けることで行を追加しました。)

これの多くは何に戻ってきます@ron_horneあなたが行おうとしている正しい種類の分析のためにデータを構造化する方法について言っていました。
お役に立てれば!、
DS