JSL para crear un diagrama de nadador o diagrama de arañaHola a todos, actualmente estoy usando JMP Pro 14.3, pero no puedo hacer un diagrama de nadador con el generador de gráficos. Vi esta publicación antes, pero parece que la trama se puede generar automáticamente. ¿Hay alguna forma de crear un diagrama de nadador o un diagrama de araña a través del generador de gráficos JMP o JSL? ¡Gracias! JMPPro
Automatización y secuencias de comandosAcceso a los datosLa personalización en masaRe: JSL para crear diagrama de nadador o diagrama de arañaHola @Chris_Kirchberg ,
Gracias por compartir los consejos. Soy del departamento médico de Biotech. Los datos generalmente provienen de CRO mensualmente, ya sea exportados como conjunto de datos Excel o SAS, pero no serán tan Datos formateados SDTM. El departamento de estadística puede crear un nadador a través del conjunto de datos de SAS, pero no puede hacerlo a tiempo para que el departamento médico revise la eficacia o la seguridad durante el ensayo, por lo que intentamos hacerlo a través de JMP Clinical. Tal vez podamos probar DS y, como usted dijo, podamos anotar aún más el gráfico con eventos de disposición para el informe de seguimiento médico interno.
BR,
Abril
Re: JSL para crear diagrama de nadador o diagrama de arañaHola @abrilCCC ,
Cuando la gente dice en tiempo real, normalmente se refiere a una prueba continua cuyos datos se extraen semanalmente y diariamente con mayor frecuencia. ¿Ha probado este complemento para convertir Excel a conjuntos de datos SAS que siguen la estructura SDTM? Asigna columnas en un archivo de Excel a variables SDTM arrastrando y soltando, luego las exporta a conjuntos de datos SAS con el nombre de archivo y los nombres de variable adecuados. También guardó el mapa para poder recuperarlo cada vez que se extraiga un nuevo corte de datos.Aquí hay un enlace
Complemento de conversión de CDISC clínico de JMP - Comunidad de usuarios de JMP
¿Sus datos provienen de una CRO o directamente de una EDC? Encuentro que la mayor parte de esto es simplemente un ejercicio de mapeo (nombre de columna x a nombre de variable y) y que muchos CRO entregarán datos formateados en SDTM a pedido (generalmente por contrato para entregar al final del estudio o cerca de él, pero a veces lo harán con más frecuencia). . Los EDC generalmente tienen una opción para exportar conjuntos de datos SAS y, si utilizan una estructura similar a CDASH para CRF y EDC, está casi listo para SDTM (excepto para apilar DM y datos de hallazgos, así como cambios de formato de fecha).
La gente también ha codificado esto en SAS: Trama del nadador: gráficamente hablando (sas.com) . Quizás puedas adaptar eso a JSL.
Recuerde también que DM y RS son los principales conjuntos de datos de dominio que se utilizan para crear un gráfico de nadador decente. Estos pueden mapearse y usarse fácilmente en JMP Clinical si aún tiene acceso. Si codifica por su cuenta, es posible que también desee incorporar DS, de esa manera podrá anotar aún más el gráfico con eventos de disposición.
Re: JSL para crear diagrama de nadador o diagrama de arañaHola @SDF1 ,
Gracias por la respuesta. voy a probar el Complemento de diagrama de Gantt para crear un gráfico de nadador. Te haré saber si eso funciona.
BR,
Abril
Re: JSL para crear diagrama de nadador o diagrama de arañaHola @Chris_Kirchberg ,
Gracias por la aclaración. Probé JMP Clinical antes. Parece que el Swimmer Plots solo funciona cuando los datos cumplen con STDM, que solo se generará cuando el ensayo clínico esté casi terminado, en lugar de la hoja de datos EXCEL. Por lo tanto, el gráfico del nadador no podrá generarse en tiempo real durante el ensayo clínico. ¿Hay alguna sugerencia que se pueda hacer para generar un gráfico de nadador similar a través de JMP a partir de datos de entrada de Excel?
BR,
Abril
Re: JSL para crear diagrama de nadador o diagrama de arañaHola @abrilCCC ,
Como puede adivinar por las diapositivas de Kelci, esto se hizo en JMP Clinical, no en JMP. Lo mismo para la trama del nadador.El diagrama de araña y el diagrama de cascada en el informe de respuesta tumoral no son difíciles de crear, pero requieren calcular previamente cuál es el mejor porcentaje de cambio desde el valor inicial para el diagrama de cascada.
El gráfico de araña es un gráfico simple de Graph Builder del tiempo en X, el % de cambio desde la línea de base en Y y luego el identificador de sujeto único en Superposición.Las anotaciones de nuevas lesiones eran marcadores de fila específicos (*) de cuándo ese sujeto tuvo una nueva lesión.
Los gráficos de nadador son mucho más difíciles y requieren una estructura muy específica de la tabla JMP y mucho trabajo de Graph Builder (manualmente). Al final se utilizó JSL con algunos scripts gráficos personalizados.
Re: JSL para crear diagrama de nadador o diagrama de arañaHola @abrilCCC ,
Toda la codificación debe ser JSL, ya que este complemento está diseñado para ejecutarse en JMP.
Al observar los gráficos del nadador, en el PDF, se parece mucho a un diagrama de Gantt, o al menos a una versión modificada de uno. Podrías investigar ese complemento. aquí . Es posible que puedas modificar la tabla de datos para que se parezca más a tus diagramas de nadador que a un diagrama de Gantt, pero son fundamentalmente similares, al menos así lo parece.
Podría ser que esos gráficos en particular sean opciones estándar en JMP Clinical, que es un software diferente a JMP. Es posible que no pueda obtener exactamente los mismos gráficos en JMP que en JMP Clinical, aunque en principio, podría escribir uno si tiene tiempo.
DS
Re: JSL para crear diagrama de nadador o diagrama de arañaHola @SDF1 , Gracias por la rápida respuesta.
He visto la publicación antes, es muy útil, pero no se parece tanto al diagrama de araña de respuesta tumoral ni al diagrama de nadador que estoy buscando en el archivo adjunto. Además, soy nuevo en JMP, ¿el lenguaje bajo la trama es JSL o SAS? gracias de nuevo
Re: JSL para crear diagrama de nadador o diagrama de arañaHola @abrilCCC ,
@MikeD_Anderson escribió un complemento para crear diagramas de araña, publicado en 2020. Puedes encontrarlo aquí .
¡Espero que esto ayude!,
DS
