JSL pour créer un tracé de nageur ou un tracé d'araignéeBonjour à tous, j'utilise actuellement JMP Pro 14.3, mais je n'arrive pas à créer un tracé de nageur avec le générateur de graphiques. J'ai déjà vu ce post, mais il semble que l'intrigue puisse être générée automatiquement. Existe-t-il un moyen de créer un tracé de nageur ou un tracé d'araignée via le générateur de graphiques JMP ou JSL ? Merci! JMP Pro
Automatisation et scriptsAccès aux donnéesPersonnalisation de masseRe : JSL pour créer un tracé de nageur ou un tracé d'araignéeSalut @Chris_Kirchberg ,
Merci d'avoir partagé les conseils. Je viens du département médical de Biotech. Les données proviennent généralement mensuellement du CRO, soit exportées sous forme d'ensemble de données Excel ou SAS, mais ne le seront pas aussi Données au format SDTM. Le service de statistiques peut créer un pot de nageur via l'ensemble de données SAS, mais cela ne peut pas être fait à temps pour que le service médical examine l'efficacité ou la sécurité pendant l'essai. Nous essayons donc de le faire via JMP Clinical. Peut-être pouvons-nous essayer DS et, comme vous l'avez dit, annoter davantage le graphique avec les événements de disposition pour le rapport de surveillance médicale interne.
BR,
Avril
Re : JSL pour créer un tracé de nageur ou un tracé d'araignéeSalut @avrilCCC ,
Lorsque les gens parlent en temps réel, ils entendent généralement un essai en cours dont les données sont extraites sur une base hebdomadaire et quotidienne au plus fréquemment. Avez-vous essayé ce complément pour convertir Excel en ensembles de données SAS qui suivent la structure SDTM ? Il mappe les colonnes d'un fichier Excel aux variables SDTM par glisser-déposer, puis les exporte dans des ensembles de données SAS avec le nom de fichier et les noms de variables appropriés. Il a également enregistré la carte afin qu'elle puisse être rappelée à chaque fois qu'une nouvelle coupe de données est extraite.Voici un lien
Complément de conversion CDISC clinique JMP - Communauté d'utilisateurs JMP
Vos données proviennent-elles d’un CRO ou directement d’un EDC ? Je trouve qu'il s'agit en grande partie d'un simple exercice de cartographie (du nom de la colonne x au nom de la variable y) et que de nombreux CRO fourniront des données au format SDTM sur demande (généralement contractuelles pour les livrer à la fin ou vers la fin de l'étude, mais parfois les livreront plus fréquemment). . Les EDC ont généralement la possibilité d'exporter des ensembles de données SAS et si vous utilisez une structure de type CDASH pour les CRF et EDC, elle est presque prête pour SDTM (sauf pour l'empilement de DM, les données de résultats ainsi que les changements de format de date)
Les gens ont également codé ceci dans SAS : Intrigue du nageur - Graphiquement parlant (sas.com) . Peut-être que vous pouvez l'adapter en JSL.
N'oubliez pas non plus que DM et RS sont les principaux ensembles de données de domaine utilisés pour créer un graphique de nageur décent. Ceux-ci peuvent facilement être cartographiés et utilisés dans JMP Clinical si vous y avez toujours accès. Si vous codez vous-même, vous souhaiterez peut-être également intégrer DS afin de pouvoir annoter davantage le graphique avec des événements de disposition.
Re : JSL pour créer un tracé de nageur ou un tracé d'araignéeSalut @SDF1 ,
Merci pour la réponse. je vais essayer le Complément de diagramme de Gantt pour scripter un tracé de nageur. Je vous ferai savoir si cela fonctionne.
BR,
Avril
Re : JSL pour créer un tracé de nageur ou un tracé d'araignéeSalut @Chris_Kirchberg ,
Merci pour la clarification. J'ai déjà essayé JMP Clinical. Il semble que le Les Swimmer Plots ne fonctionnent que lorsque les données répondent au STDM, qui ne seront générées que lorsque l'essai clinique est presque terminé, au lieu de la fiche de données EXCEL. Le tracé du nageur ne pourra donc pas être généré en temps réel pendant l'essai clinique. Existe-t-il une suggestion pour générer un tracé de nageur similaire via JMP à partir de données d'entrée Excel ?
BR,
Avril
Re : JSL pour créer un tracé de nageur ou un tracé d'araignéeSalut @avrilCCC ,
Comme vous pouvez le deviner d'après les diapositives de Kelci, cela a été réalisé dans JMP Clinical et non dans JMP. Idem pour Swimmer Plot.Le tracé en araignée et le tracé en cascade dans le rapport de réponse tumorale ne sont pas difficiles à créer, mais nécessitent un précalcul du meilleur pourcentage de changement par rapport à la ligne de base pour le tracé en cascade.
Le tracé Spider est un simple tracé Graph Builder du temps sur X, du pourcentage de changement par rapport à la ligne de base sur Y, puis de l'identifiant unique du sujet dans la superposition.Les annotations des nouvelles lésions étaient des marqueurs spécifiques à une ligne (*) indiquant le moment où ce sujet avait une nouvelle lésion.
Les tracés de nageurs sont beaucoup plus difficiles et nécessitent une structure très spécifique de la table JMP et beaucoup de travail avec Graph Builder (manuellement). En fin de compte, JSL a été utilisé avec des scripts graphiques personnalisés.
Re : JSL pour créer un tracé de nageur ou un tracé d'araignéeSalut @avrilCCC ,
Le codage doit être entièrement en JSL puisque ce complément est destiné à s'exécuter dans JMP.
En regardant les diagrammes des nageurs, dans le PDF, cela ressemble beaucoup à un diagramme de Gantt, ou du moins à une version modifiée de celui-ci. Vous pourriez examiner ce complément ici . Vous pourrez peut-être modifier le tableau de données pour qu'il ressemble davantage à vos tracés de nageur qu'à un diagramme de Gantt, mais ils sont fondamentalement similaires, du moins cela ressemble à cela.
Il se peut que ces tracés particuliers soient des options standard dans JMP Clinical, qui est un logiciel différent de JMP. Vous ne pourrez peut-être pas obtenir exactement les mêmes tracés dans JMP que dans JMP Clinical, même si en principe, vous pouvez en créer un si vous en avez le temps.
DS
Re : JSL pour créer un tracé de nageur ou un tracé d'araignéeSalut @SDF1 , Merci pour la réponse rapide.
J'ai déjà vu le message, très utile, mais il ne ressemble pas tout à fait au tracé de l'araignée de réponse tumorale et au tracé du nageur que je recherche, comme dans la pièce jointe. De plus, je suis nouveau sur JMP, le langage sous l'intrigue est-il JSL ou SAS ? Merci encore
Re : JSL pour créer un tracé de nageur ou un tracé d'araignéeSalut @avrilCCC ,
@MikeD_Anderson a écrit un complément pour créer des spider plots, publié en 2020. Tu peux le trouver ici .
J'espère que cela t'aides!,
DS
