免疫學 JMP？你好，
我們正在與一家細胞治療公司合作開發 T 細胞免疫治療產品和疫苗。 DOE 在工藝、配方和分析開發方面具有明確的價值。
我們在那裡的聯繫人也認為他們正在組建的免疫學小組可能有價值。 他們將從臨床試驗中生成大量數據，並且除了 Excel 之外沒有任何分析工具。
他們希望我們可以展示一個與免疫學人員相關的案例研究演示。 在描述他們將擁有的數據類型時，他們使用的術語包括：“藥代動力學”、“抗體反應”、“臨床分析讀數”和“測量作用而非效果”。 “ 我想我知道這些詞的意思，但我不知道我會展示什麼來證明 JMP 的價值。 我感覺到他們有隨著時間的推移跟踪的臨床試驗反應。
有人知道相關的演示數據集嗎？
或者，如果這不是 JMP 的地方，請告訴我，這樣我就不會浪費時間了。
如果有幫助，我已經在下面發布了這家公司的免疫學科學家的部分招聘信息。
謝謝，
菲爾
科學家，免疫學
該團隊負責進行臨床前和臨床
免疫學研究。 我們測量抗體和 T 細胞對
用於預防或治療的候選免疫治療產品
傳染病和癌症。 免疫學科學家將開發，
實施和解釋免疫學檢測並監督實驗室運作
和行政。 具體職責包括：
• 確保建立並適當地進行抗體和細胞檢測
有資格支持我們候選人或競爭者的人類和動物研究
候選產品
• 確保所有必需的技術 SOP 均已編寫、落實並維護
進行的化驗
• 確保受監管人員接受過培訓，並且培訓記錄是最新的。
• 監督實驗以測量動物實驗的免疫反應
使用 ELISpot、流式細胞術、ELISA 和其他檢測方法進行人體臨床試驗
在內部或外部執行，例如 RNA-seq、TCR 測序、親和力
測量，表面等離子體共振，免疫組織化學
• 確保臨床試驗按照 GCP 原則進行
• 支持將所需化驗的技術轉讓給承包商，例如那些
進行毒理學實驗
回复：JMP 免疫學？根據他們正在做的事情，“切點分析”可能會出現。 JMP 具有許多用於此類分析的離群值篩选和檢測的優秀功能。
如果他們正在進行 ELISA 工作，DOE 會非常有用，而 FDOE 可能是查看響應數據的不錯選擇。 通常，這些實驗著眼於吸光度與稀釋，數據看起來可能適合 4p 或 5p 擬合，但漸近線通常有鉤子或不一致。
表面等離子體共振，就像 Biacore 一樣，可能正在發揮作用。 數據看起來像動力學反應速率。 FDOE 在這裡也很棒，因為大多數情況下曲線只是參數化，參數錯誤是第二個想法。
回复：JMP 免疫學？謝謝， @卡倫科普蘭.
這真的很有用。 這讓我想起，我曾與從事動物營養試驗的科學家合作過很多次，這些試驗也是規模較小的試驗，採用一些連續的措施以及不同的終點。 這些正是最有用的工具。 再次感謝，
菲爾
回复：JMP 免疫學？我經常將 JMP 用於診斷（即某種分析）和臨床試驗。 JMP 中需要什麼“取決於”試驗以及該試驗的終點是什麼。 與 Pharma 試驗相比，我參與的試驗往往規模較小，收集的數據不一定適用於 JMP Clinical（想想 100 個而不是 1000 個具有相當基本數據的受試者）。
JMP 擅長的項目包括：
1. 數據導入（臨床數據將來自某個地方，通常是 excel，但更經常移動到某種在線 EDC（電子數據捕獲）系統，因此導出可以是 sas transport、cvs、xml 等。
2. 數據探索（重新編碼，數據文件頂部的分佈等）以查找混亂的臨床數據（不要使用這些詞 - 可能需要進一步監控的臨床數據如何）。
3. VIRTUAL JOIN（和常規連接）。 通常臨床數據來自多個數據文件，例如人口統計文件、治療文件、實驗室結果文件，以及也可能位於單獨文件中的化驗數據。
4. 他們可能正在尋找的所有基礎知識。
回复：JMP 免疫學？我認為“Cholesterol Stacked”可能是有用的例子。
回复：JMP 免疫學？謝謝@Chris_Kirchberg , @Byron_JMP , @ian_jmp , @本弗朗西斯, @Jeff_Perkinson和@MikeD_Anderson .
這一切都非常有幫助。
我需要和客戶核實一下。我們有很多關於開發和監測分析的例子，我希望如此。 但我認為他們真正想要的是一個例子，展示他們在試驗中運行檢測時如何查看臨床數據。 我想我們沒有那種數據也就不足為奇了。
再次感謝，
菲爾
回复：JMP 免疫學？這是一篇有趣的論文，我一直想製作一個演示。 它是關於免疫原性測定中的切點分析。 它非常好，因為它顯示了一堆不同的方法（所有這些方法似乎都可以在 JMP 中實現）。 更重要的是，它包含 PDF 中示例的數據……這也讓您演示了 PDF 導入。
回复：JMP 免疫學？你說得對， @ian_jmp ， 有很多點擊.
回复：JMP 免疫學？FWIW，我使用帶有“assay”的 Discovery Paper 搜索工具，得到了 8 個結果。 值得一看，如果你還沒有的話。
回复：JMP 免疫學？嗨，菲爾，
我只能真正談論藥代動力學，但儘管 JMP 可以擬合該領域的方程式，但它無法處理（據我所知）：
- 不同給藥方案的患者
- 採樣時間不同的患者
- 非線性混合效應回歸建模，通常需要區分固定效應和隨機效應。
如果您聽到這三者中的任何一個，最好推薦與 SAS 結合使用。
https://community.jmp.com/t5/JMP-Scripts/Nonlinear-Degradation-Mixed-Model/ta-p/21367不是 PK，而是將 SAS PROCNLMIXED 和 JMP 放在一起的示例。
希望有所幫助。
親切的問候，
本
回复：JMP 免疫學？再想想這個。 由於數據來自臨床試驗……醫學評論員使用的是什麼:)如果他們還沒有，也許 JMP Clinical 可以提供幫助。
回复：JMP 免疫學？你好@Phil_凱,
從數據的角度來看，這很難。 您可以使用流式細胞術數據集進行流式細胞術分析。 我有一些 JMP 也可以導入的 .fcs 文件。 我還沒有完成一個工作流程來獲取所有 .fcs 文件，加入，操作然後準備好進行分析。
生物測定可用於非線性/擬合曲線。如果有幫助，可以使用藥代動力學模型擬合曲線選項。
Snee 的 DOE 臨床試驗示例試驗應與 DOE 和分析相關。
其中大部分將是擬合曲線/非線性建模。
劑量反應類型分析也類似。
@Byron_JMP會有一些額外的想法。
