JMP para inmunología?Hola,
Estamos trabajando con una empresa de terapia celular que desarrolla vacunas y productos inmunoterapéuticos de células T. El DOE tiene un valor claro en el proceso, la formulación y el desarrollo de ensayos.
Nuestro contacto allí también cree que podría ser valioso para el grupo de Inmunología que están formando. Generarán una gran cantidad de datos y no tendrán herramientas de análisis más allá de Excel.
Esperan que podamos mostrar una demostración de estudio de caso que sea relevante para la gente de Inmunología. Al describir el tipo de datos que tendrán, utilizaron términos que incluyen: " farmacocinética "," respuestas de anticuerpos "," lecturas de ensayos clínicos "y" la acción de medición no tiene efecto. " Creo que sé lo que significan estas palabras, pero no sé qué mostraría para demostrar el valor de JMP.
¿Alguien sabe de un conjunto de datos de demostración relevante?
Alternativamente, avíseme si este no es un lugar para JMP para no perder el tiempo.
He publicado parte de una publicación de trabajo, a continuación, para un científico de inmunología de esta empresa en caso de que eso ayude.
Gracias,
Phil
Científico, Inmunología
El equipo es responsable de realizar estudios clínicos y preclínicos
investigación en inmunología. Medimos las respuestas de anticuerpos y células T a
productos inmunoterapéuticos candidatos para la prevención o el tratamiento de
enfermedades infecciosas y cáncer. El científico de inmunología desarrollará,
Implementar e interpretar ensayos de inmunología y supervisar el funcionamiento del laboratorio.
y administración. Los deberes específicos incluyen:
• Asegúrese de que los análisis de anticuerpos y celulares estén establecidos y de forma adecuada
calificado para apoyar los estudios de Vaccitech en humanos y animales o competir
candidatos de producto
• Asegúrese de que todos los procedimientos operativos estándar técnicos requeridos estén escritos, en su lugar y mantenidos para
ensayos realizados en Vaccitech
• Asegúrese de que el personal supervisado esté capacitado y los registros de capacitación estén actualizados.
• Supervisar experimentos para medir las respuestas inmunitarias de experimentos con animales.
y ensayos clínicos en humanos utilizando ELISpot, citometría de flujo, ELISA y otros ensayos
realizado interna o externamente como RNA-seq, secuenciación de TCR, avidez
mediciones, resonancia de plasmón superficial, inmunohistoquímica
• Asegúrese de que los ensayos clínicos se realicen de acuerdo con los principios de GCP
• Apoyar la transferencia de tecnología de los ensayos necesarios a los contratistas, como los
la realización de experimentos de toxicología
Re: JMP para inmunologia?Hola @phil_kay ,
Este es difícil desde el punto de vista de los datos. Puede utilizar el conjunto de datos de citometría para el análisis de citometría de flujo. Tengo algunos archivos .fcs que JMP también puede importar. Todavía no he terminado un flujo de trabajo para obtener todos los archivos .fcs, unirlos, manipularlos y luego estar listos para el análisis.
El bioensayo se puede utilizar para curvas de ajuste no lineales.Hay una opción de curva de ajuste de modelos farmacocinéticos si eso ayuda.
El ensayo de ejemplo del ensayo clínico DOE de Snee debe ser relevante para el DOE y el análisis.
Gran parte de esto será modelado no lineal / de curvas ajustadas.
El análisis del tipo de dosis-respuesta también sería similar.
@Byron_JMP tendrá algunas ideas adicionales.
Re: JMP para inmunologia?Y un pensamiento más sobre esto. Dado que los datos provienen de un ensayo clínico ... ¿qué están usando los revisores médicos?:)Tal vez JMP Clinical pueda ayudar con eso si aún no lo tiene.
Re: JMP para inmunologia?Hola Phil,
Realmente solo puedo hablar sobre farmacocinética, pero aunque JMP puede ajustar ecuaciones en esta área, no maneja (según mi leal saber y entender):
- pacientes con diferentes esquemas de dosificación
- pacientes con diferentes horarios de muestreo
- Modelado de regresión de efectos mixtos no lineales, que a menudo se requiere para discernir entre efectos fijos y aleatorios.
Si escucha alguno de esos tres, es mejor recomendarlo en combinación con SAS.
https://community.jmp.com/t5/JMP-Scripts/Nonlinear-Degradation-Mixed-Model/ta-p/21367 No es PK, sino un ejemplo de cómo combinar SAS PROCNLMIXED y JMP.
Espero que ayude.
Saludos cordiales,
Ben
Re: JMP para inmunologia?FWIW, utilicé la herramienta de búsqueda Discovery Paper con 'ensayo' y obtuve ocho resultados. Vale la pena mirar, si aún no lo ha hecho.
Re: JMP para inmunologia?Tienes razón, @ian_jmp , existen muchos hits .
Re: JMP para inmunologia?Aquí hay un artículo divertido que he querido trabajar en una demostración. Está en análisis de punto de corte en ensayos de inmunogenicidad. Es bastante bueno porque muestra un montón de métodos diferentes (todos los cuales parecían ser posibles en JMP). Más importante aún, incluye los datos para los ejemplos en el PDF ... lo que también le permite hacer una demostración de la importación de PDF.
Re: JMP para inmunologia?Gracias @chris_kirchberg , @Byron_JMP , @ian_jmp , @benfrancis , @Jeff_Perkinson y @MikeD_Anderson .
Todo esto es realmente útil.
Necesito volver a consultar con el cliente.Tenemos muchos ejemplos sobre el desarrollo y seguimiento de ensayos, lo cual sería de esperar. Pero creo que lo que realmente quieren es un ejemplo que muestre cómo podrían mirar los datos clínicos cuando ejecutan los ensayos en sus ensayos. Supongo que no es una sorpresa que no tengamos ese tipo de datos.
Gracias de nuevo,
Phil
Re: JMP para inmunologia?Creo que "Colesterol apilado" podría ser un ejemplo útil.
