免疫学 JMP？你好，
我们正在与一家细胞治疗公司合作开发 T 细胞免疫治疗产品和疫苗。 DOE 在工艺、配方和分析开发方面具有明确的价值。
我们在那里的联系人也认为他们正在组建的免疫学小组可能有价值。 他们将从临床试验中生成大量数据，并且除了 Excel 之外没有任何分析工具。
他们希望我们可以展示一个与免疫学人员相关的案例研究演示。 在描述他们将拥有的数据类型时，他们使用的术语包括：“药代动力学”、“抗体反应”、“临床分析读数”和“测量作用而非效果”。 “ 我想我知道这些词的意思，但我不知道我会展示什么来证明 JMP 的价值。 我感觉到他们有随着时间的推移跟踪的临床试验反应。
有人知道相关的演示数据集吗？
或者，如果这不是 JMP 的地方，请告诉我，这样我就不会浪费时间了。
如果有帮助，我已经在下面发布了这家公司的免疫学科学家的部分招聘信息。
谢谢，
菲尔
科学家，免疫学
该团队负责进行临床前和临床
免疫学研究。 我们测量抗体和 T 细胞对
用于预防或治疗的候选免疫治疗产品
传染病和癌症。 免疫学科学家将开发，
实施和解释免疫学检测并监督实验室运作
和行政。 具体职责包括：
• 确保建立并适当地进行抗体和细胞检测
有资格支持我们候选人或竞争者的人类和动物研究
候选产品
• 确保所有必需的技术 SOP 均已编写、落实并维护
进行的化验
• 确保受监管人员接受过培训，并且培训记录是最新的。
• 监督实验以测量动物实验的免疫反应
使用 ELISpot、流式细胞术、ELISA 和其他检测方法进行人体临床试验
在内部或外部执行，例如 RNA-seq、TCR 测序、亲和力
测量，表面等离子体共振，免疫组织化学
• 确保临床试验按照 GCP 原则进行
• 支持将所需化验的技术转让给承包商，例如那些
进行毒理学实验
回复：JMP 免疫学？根据他们正在做的事情，“切点分析”可能会出现。 JMP 具有许多用于此类分析的离群值筛选和检测的优秀功能。
如果他们正在进行 ELISA 工作，DOE 会非常有用，而 FDOE 可能是查看响应数据的不错选择。 通常，这些实验着眼于吸光度与稀释，数据看起来可能适合 4p 或 5p 拟合，但渐近线通常有钩子或不一致。
表面等离子体共振，就像 Biacore 一样，可能正在发挥作用。 数据看起来像动力学反应速率。 FDOE 在这里也很棒，因为大多数情况下曲线只是参数化，参数错误是第二个想法。
回复：JMP 免疫学？谢谢， @卡伦科普兰.
这真的很有用。 这让我想起，我曾与从事动物营养试验的科学家合作过很多次，这些试验也是规模较小的试验，采用一些连续的措施以及不同的终点。 这些正是最有用的工具。 再次感谢，
菲尔
回复：JMP 免疫学？我经常将 JMP 用于诊断（即某种分析）和临床试验。 JMP 中需要什么“取决于”试验以及该试验的终点是什么。 与 Pharma 试验相比，我参与的试验往往规模较小，收集的数据不一定适用于 JMP Clinical（想想 100 个而不是 1000 个具有相当基本数据的受试者）。
JMP 擅长的项目包括：
1. 数据导入（临床数据将来自某个地方，通常是 excel，但更经常移动到某种在线 EDC（电子数据捕获）系统，因此导出可以是 sas transport、cvs、xml 等。
2. 数据探索（重新编码，数据文件顶部的分布等）以查找混乱的临床数据（不要使用这些词 - 可能需要进一步监控的临床数据如何）。
3. VIRTUAL JOIN（和常规连接）。 通常临床数据来自多个数据文件，例如人口统计文件、治疗文件、实验室结果文件，以及也可能位于单独文件中的化验数据。
4. 他们可能正在寻找的所有基础知识。
回复：JMP 免疫学？我认为“Cholesterol Stacked”可能是有用的例子。
回复：JMP 免疫学？谢谢@Chris_Kirchberg , @Byron_JMP , @ian_jmp , @本弗朗西斯, @Jeff_Perkinson和@MikeD_Anderson .
这一切都非常有帮助。
我需要和客户核实一下。我们有很多关于开发和监测分析的例子，我希望如此。 但我认为他们真正想要的是一个例子，展示他们在试验中运行检测时如何查看临床数据。 我想我们没有那种数据也就不足为奇了。
再次感谢，
菲尔
回复：JMP 免疫学？这是一篇有趣的论文，我一直想制作一个演示。 它是关于免疫原性测定中的切点分析。 它非常好，因为它显示了一堆不同的方法（所有这些方法似乎都可以在 JMP 中实现）。 更重要的是，它包含 PDF 中示例的数据……这也让您演示了 PDF 导入。
回复：JMP 免疫学？你说得对， @ian_jmp ， 有很多点击.
回复：JMP 免疫学？FWIW，我使用带有“assay”的 Discovery Paper 搜索工具，得到了 8 个结果。 值得一看，如果你还没有的话。
回复：JMP 免疫学？嗨，菲尔，
我只能真正谈论药代动力学，但尽管 JMP 可以拟合该领域的方程式，但它无法处理（据我所知）：
- 不同给药方案的患者
- 采样时间不同的患者
- 非线性混合效应回归建模，通常需要区分固定效应和随机效应。
如果您听到这三者中的任何一个，最好推荐与 SAS 结合使用。
https://community.jmp.com/t5/JMP-Scripts/Nonlinear-Degradation-Mixed-Model/ta-p/21367不是 PK，而是将 SAS PROCNLMIXED 和 JMP 放在一起的示例。
希望有所帮助。
亲切的问候，
本
回复：JMP 免疫学？再想想这个。 由于数据来自临床试验……医学评论员使用的是什么:)如果他们还没有，也许 JMP Clinical 可以提供帮助。
回复：JMP 免疫学？你好@Phil_凯,
从数据的角度来看，这很难。 您可以使用流式细胞术数据集进行流式细胞术分析。 我有一些 JMP 也可以导入的 .fcs 文件。 我还没有完成一个工作流程来获取所有 .fcs 文件，加入，操作然后准备好进行分析。
生物测定可用于非线性/拟合曲线。如果有帮助，可以使用药代动力学模型拟合曲线选项。
Snee 的 DOE 临床试验示例试验应与 DOE 和分析相关。
其中大部分将是拟合曲线/非线性建模。
剂量反应类型分析也类似。
@Byron_JMP会有一些额外的想法。
