JMP per l'immunologia?Ciao,
Stiamo lavorando con una società di terapia cellulare che sviluppa prodotti e vaccini immunoterapici a cellule T. Esiste un chiaro valore per DOE nel processo, nella formulazione e nello sviluppo del test.
Il nostro contatto lì pensa anche che potrebbe esserci valore per il gruppo di immunologia che stanno formando. Genereranno molti dati e non avranno strumenti di analisi oltre a Excel.
Sperano che possiamo mostrare una demo di case study che sarà rilevante per le persone di immunologia. Nel descrivere il tipo di dati che avranno, hanno usato termini tra cui: " farmacocinetica "," risposte anticorpali "," letture di analisi cliniche "e" azione di misurazione non ha effetto. " Penso di sapere cosa significano queste parole, ma non so cosa mostrerei per dimostrare il valore di JMP.
Qualcuno conosce un set di dati demo rilevante?
In alternativa, fammi sapere se questo non è un posto per JMP in modo da non sprecare il mio tempo.
Ho pubblicato parte di un annuncio di lavoro, di seguito, per uno scienziato immunologico per questa azienda nel caso in cui ciò sia d'aiuto.
Grazie,
Phil
Scienziato, Immunologia
Il team è responsabile della conduzione pre-clinica e clinica
ricerca immunologica. Misuriamo le risposte anticorpali e delle cellule T a
prodotti immunoterapeutici candidati per la prevenzione o il trattamento di
malattie infettive e cancro. The Immunology Scientist svilupperà,
implementare e interpretare i test immunologici e supervisionare le operazioni di laboratorio
e amministrazione. I compiti specifici includono:
• Assicurarsi che i test anticorpali e cellulari siano stabiliti e in modo appropriato
qualificato per sostenere studi su Vaccitech o concorrenti sia sull'uomo che sugli animali
candidati al prodotto
• Assicurarsi che tutte le SOP tecniche richieste siano scritte, installate e mantenute per
analisi condotte presso Vaccitech
• Assicurarsi che il personale supervisionato sia formato e che i registri della formazione siano aggiornati.
• Supervisionare gli esperimenti per misurare le risposte immunitarie dagli esperimenti sugli animali
e sperimentazioni cliniche sull'uomo utilizzando ELISpot, citometria a flusso, ELISA e altri saggi
eseguito internamente o esternamente come RNA-seq, sequenziamento TCR, avidità
misure, risonanza plasmonica di superficie, immunoistochimica
• Assicurarsi che le analisi cliniche siano condotte secondo i principi GCP
• Supportare il trasferimento tecnologico dei test richiesti agli appaltatori, come quelli
condurre esperimenti tossicologici
Ri: JMP per immunologia?Ciao @phil_kay ,
Questo è difficile dal punto di vista dei dati. È possibile utilizzare il set di dati della citometria per l'analisi della citometria a flusso. Ho alcuni file .fcs che possono essere importati anche da JMP. Non ho ancora terminato un flusso di lavoro per inserire tutti i file .fcs, uniti, manipolati e quindi pronti per l'analisi.
Il dosaggio biologico può essere utilizzato per curva non lineare / adatta.C'è un'opzione curva di adattamento dei modelli farmacocinetici se questo aiuta.
Il test di esempio del dosaggio clinico DOE di Snee dovrebbe essere pertinente per DOE e analisi.
Gran parte di questo sarà curva di adattamento / modellazione non lineare.
L'analisi del tipo dose-risposta sarebbe altrettanto simile.
@Byron_JMP avrà alcune idee aggiuntive.
Ri: JMP per immunologia?E un altro pensiero su questo. Dato che i dati provengono da una sperimentazione clinica ... cosa stanno usando i revisori medici:)Forse JMP Clinical può aiutare in questo se non ce l'hanno ancora.
Ri: JMP per immunologia?Ciao Phil,
Posso parlare solo di farmacocinetica, ma sebbene JMP possa adattare equazioni in quest'area, non gestisce (per quanto ne so):
- pazienti con differenti schemi di dosaggio
- pazienti con differenti programmi di campionamento
- modelli di regressione a effetti misti non lineari, che spesso richiedono di distinguere tra effetti fissi e casuali.
Se senti qualcuno di questi tre, probabilmente è meglio consigliarlo in combinazione con SAS.
https://community.jmp.com/t5/JMP-Scripts/Nonlinear-Degradation-Mixed-Model/ta-p/21367 Non PK ma un esempio di come mettere insieme SAS PROCNLMIXED e JMP.
Spero che sia d'aiuto.
Cordiali saluti,
Ben
Ri: JMP per immunologia?FWIW, ho utilizzato lo strumento di ricerca Discovery Paper con "saggio" e ho ottenuto otto risultati. Vale la pena guardare, se non l'hai già fatto.
Ri: JMP per immunologia?Hai ragione, @ian_jmp , ci sono molti successi .
Ri: JMP per immunologia?Ecco un documento divertente che avevo intenzione di lavorare in una demo. È sull'analisi del punto di riferimento nei test di immunogenicità. È piuttosto carino in quanto ha mostrato un sacco di metodi diversi (che sembravano tutti possibili in JMP). Ancora più importante, include i dati per gli esempi nel PDF ... che ti consente anche di importare PDF demo.
Ri: JMP per immunologia?Grazie @chris_kirchberg , @Byron_JMP , @ian_jmp , @benfrancis , @Jeff_Perkinson e @MikeD_Anderson .
Tutto questo è davvero utile.
Devo ricontrollare con il cliente.Abbiamo molti esempi sullo sviluppo e il monitoraggio dei test, cosa che mi aspetto. Ma penso che quello che vogliono veramente sia un esempio che mostri come potrebbero guardare i dati clinici quando eseguono i test nelle loro sperimentazioni. Immagino non sia una sorpresa che non abbiamo quel tipo di dati.
Grazie ancora,
Phil
Ri: JMP per immunologia?Penso che "Cholesterol Stacked" potrebbe essere un esempio utile.
