JMP für Immunologie?Hallo,
Wir arbeiten mit einem Zelltherapieunternehmen zusammen, das immuntherapeutische Produkte und Impfstoffe für T-Zellen entwickelt. Es gibt einen klaren Wert für DOE in der Prozess-, Formulierungs- und Assayentwicklung.
Unser Kontakt dort glaubt auch, dass es einen Wert für die Immunologiegruppe geben könnte, die sie bilden. Sie werden viele Daten generieren und haben keine Analysewerkzeuge außerhalb von Excel.
Sie hoffen, dass wir eine Fallstudien-Demo zeigen können, die für die Immunologen relevant ist. Bei der Beschreibung der Art der Daten, die sie haben werden, verwendeten sie Begriffe wie: " Pharmakokinetik "," Antikörperantworten "," Auslesungen des klinischen Assays "und" Messwirkung ohne Wirkung ". "" Ich glaube, ich weiß, was diese Worte bedeuten, aber ich weiß nicht, was ich zeigen würde, um den Wert von JMP zu beweisen.
Kennt jemand einen relevanten Demo-Datensatz?
Lassen Sie mich alternativ wissen, ob dies kein Ort für JMP ist, damit ich meine Zeit nicht verschwende.
Ich habe unten einen Teil einer Stellenanzeige für einen Immunologen für dieses Unternehmen veröffentlicht, falls dies hilfreich ist.
Vielen Dank,
Phil
Wissenschaftler, Immunologie
Das Team ist für die Durchführung vorklinischer und klinischer Maßnahmen verantwortlich
immunologische Forschung. Wir messen Antikörper- und T-Zell-Reaktionen auf
Kandidaten für immuntherapeutische Produkte zur Vorbeugung oder Behandlung von
Infektionskrankheiten und Krebs. Der Immunologie-Wissenschaftler wird entwickeln,
Implementierung und Interpretation von Immunologietests und Überwachung des Laborbetriebs
und Verwaltung. Spezifische Aufgaben umfassen:
• Stellen Sie sicher, dass Antikörper- und Zelltests etabliert und angemessen sind
qualifiziert, um sowohl Human- als auch Tierstudien von Vaccitech oder im Wettbewerb zu unterstützen
Produktkandidaten
• Stellen Sie sicher, dass alle erforderlichen technischen SOPs geschrieben, vorhanden und gewartet sind
Assays bei Vaccitech durchgeführt
• Stellen Sie sicher, dass das beaufsichtigte Personal geschult ist und die Schulungsunterlagen auf dem neuesten Stand sind.
• • Überwachung von Experimenten zur Messung von Immunantworten aus Tierversuchen
und klinische Studien am Menschen unter Verwendung von ELISpot, Durchflusszytometrie, ELISA und anderen Assays
intern oder extern durchgeführt wie RNA-Sequenz, TCR-Sequenzierung, Avidität
Messungen, Oberflächenplasmonresonanz, Immunhistochemie
• Stellen Sie sicher, dass klinische Tests gemäß den GCP-Prinzipien durchgeführt werden
• Unterstützung des Technologietransfers der erforderlichen Assays an Auftragnehmer wie diese
Durchführung toxikologischer Experimente
Re: JMP für Immunologie?Hallo @phil_kay ,
Dieser ist aus datengesichtlicher Sicht schwierig. Sie können den Zytometriedatensatz für die Durchflusszytometrieanalyse verwenden. Ich habe ein paar .fcs-Dateien, die JMP ebenfalls importieren kann. Ich habe noch keinen Workflow abgeschlossen, um alle .fcs-Dateien aufzunehmen, zu verbinden, zu bearbeiten und dann noch für die Analyse bereit zu sein.
Der Bioassay kann für nichtlineare / Fit-Kurven verwendet werden.Wenn dies hilft, gibt es eine Option für die Anpassung von Kurven für pharmakokinetische Modelle.
Der Beispieltest für den DOE Clinical Assay von Snee sollte für DOE und Analyse relevant sein.
Ein Großteil davon wird Fit-Kurve / nichtlineare Modellierung sein.
Die Analyse des Dosis-Wirkungs-Typs wäre ebenfalls ähnlich.
@ Byron_JMP wird einige zusätzliche Ideen haben.
Re: JMP für Immunologie?Und noch ein Gedanke dazu. Da die Daten aus einer klinischen Studie stammen ... was verwenden die medizinischen Gutachter?:)Vielleicht kann JMP Clinical dabei helfen, wenn sie es noch nicht haben.
Re: JMP für Immunologie?Hallo Phil,
Ich kann nur wirklich über Pharmakokinetik sprechen, aber JMP kann zwar Gleichungen in diesem Bereich anpassen, es funktioniert jedoch nicht (nach meinem besten Wissen):
- Patienten mit unterschiedlichen Dosierungsplänen
- Patienten mit unterschiedlichen Probenahmeplänen
- Nichtlineare Regressionsmodellierung mit gemischten Effekten, bei der häufig zwischen festen und zufälligen Effekten unterschieden werden muss.
Wenn Sie einen dieser drei hören, ist es wahrscheinlich am besten, ihn in Kombination mit SAS zu empfehlen.
https://community.jmp.com/t5/JMP-Scripts/Nonlinear-Degradation-Mixed-Model/ta-p/21367 Nicht PK, sondern ein Beispiel für die Zusammenführung von SAS PROCNLMIXED und JMP.
Hoffentlich hilft das.
Mit freundlichen Grüßen,
Ben
Re: JMP für Immunologie?FWIW, ich habe das Discovery Paper-Suchwerkzeug mit 'Assay' verwendet und acht Treffer erhalten. Sehenswert, wenn Sie es noch nicht getan haben.
Re: JMP für Immunologie?Du hast recht, @ian_jmp , es gibt viele Treffer .
Re: JMP für Immunologie?Hier ist ein lustiges Papier, das ich in eine Demo einarbeiten wollte. Es handelt sich um eine Cut-Point-Analyse in Immunogenitätstests. Es ist ziemlich schön, dass hier eine Reihe verschiedener Methoden gezeigt werden (die alle in JMP möglich zu sein schienen). Noch wichtiger ist, dass die Daten für die Beispiele im PDF enthalten sind. Damit können Sie auch den PDF-Import vorführen.
Re: JMP für Immunologie?Vielen Dank @chris_kirchberg , @ Byron_JMP , @ian_jmp , @benfrancis , @ Jeff_Perkinson und @ MikeD_Anderson .
Das ist alles sehr hilfreich.
Ich muss mich beim Kunden melden.Wir haben viele Beispiele für die Entwicklung und Überwachung von Assays, die ich erwarten würde. Aber ich denke, was sie wirklich wollen, ist ein Beispiel, das zeigt, wie sie die klinischen Daten betrachten können, wenn sie die Assays in ihren Studien durchführen. Ich denke, es ist keine Überraschung, dass wir diese Art von Daten nicht haben.
Danke noch einmal,
Phil
Re: JMP für Immunologie?Ich denke, "Cholesterin gestapelt" könnte ein nützliches Beispiel sein.
