JMP pour l'immunologie?Salut,
Nous travaillons avec une société de thérapie cellulaire développant des produits d'immunothérapie et des vaccins contre les lymphocytes T. Il y a une valeur claire pour le DOE dans le processus, la formulation et le développement des tests.
Notre contact là-bas pense également qu'il pourrait y avoir de la valeur pour le groupe d'immunologie qu'ils forment. Ils généreront beaucoup de données et ne disposeront d'aucun outil d'analyse au-delà d'Excel.
Ils espèrent que nous pourrons montrer une démo d'étude de cas qui sera pertinente pour les gens de l'immunologie. En décrivant le type de données dont ils disposeront, ils ont utilisé des termes tels que: " pharmacocinétique "," réponses anticorps "," lectures de tests cliniques "et" mesure de l'action pas d'effet. " Je pense que je sais ce que signifient ces mots mais je ne sais pas ce que je montrerais pour prouver la valeur de JMP.
Quelqu'un connaît-il un ensemble de données de démonstration pertinent?
Sinon, faites-moi savoir si ce n'est pas un endroit pour JMP afin de ne pas perdre mon temps.
J'ai publié une partie d'une offre d'emploi, ci-dessous, pour un scientifique en immunologie pour cette entreprise au cas où cela aiderait.
Merci,
Phil
Scientifique, Immunologie
L'équipe est responsable de la conduite pré-clinique et clinique
recherche en immunologie. Nous mesurons les réponses des anticorps et des lymphocytes T à
candidats produits immunothérapeutiques pour la prévention ou le traitement
maladies infectieuses et cancer. Le scientifique en immunologie développera,
mettre en œuvre et interpréter les tests d'immunologie et superviser le fonctionnement du laboratoire
et administration. Les tâches spécifiques comprennent:
• S'assurer que les dosages d'anticorps et cellulaires sont établis et correctement
qualifié pour soutenir les études humaines et animales de Vaccitech ou
candidats produits
• S'assurer que toutes les SOP techniques requises sont écrites et en place et maintenues pour
tests réalisés chez Vaccitech
• S'assurer que le personnel supervisé est formé et que les registres de formation sont à jour.
• Superviser les expériences pour mesurer les réponses immunitaires des expériences animales
et des essais cliniques humains utilisant ELISpot, cytométrie en flux, ELISA et autres tests
réalisée en interne ou en externe comme RNA-seq, séquençage TCR, avidité
mesures, résonance plasmonique de surface, immunohistochimie
• S'assurer que les tests cliniques sont effectués selon les principes GCP
• Soutenir le transfert technologique des analyses requises aux entrepreneurs, tels que ceux
mener des expériences de toxicologie
Re: JMP pour l'immunologie?salut @phil_kay ,
Celui-ci est difficile du point de vue des données. Vous pouvez utiliser l'ensemble de données de cytométrie pour l'analyse de cytométrie en flux. J'ai quelques fichiers .fcs que JMP peut également importer. Je n'ai pas encore terminé un flux de travail pour obtenir tous les fichiers .fcs, les joindre, les manipuler, puis les préparer pour l'analyse.
Le test biologique peut être utilisé pour les courbes non linéaires / d'ajustement.Il existe une option de courbe d'ajustement des modèles pharmacocinétiques si cela aide.
Le test d'exemple de test clinique DOE de Snee doit être pertinent pour le DOE et l'analyse.
Une grande partie de cela sera une modélisation de courbe d'ajustement / non linéaire.
L'analyse de type dose-réponse serait similaire à wel.
@Byron_JMP aura quelques idées supplémentaires.
Re: JMP pour l'immunologie?Et encore une réflexion à ce sujet. Étant donné que les données proviennent d'un essai clinique ... que les évaluateurs médicaux utilisent-ils:)Peut-être que JMP Clinical peut vous aider s'ils ne l'ont pas encore.
Re: JMP pour l'immunologie?Salut Phil,
Je ne peux vraiment parler que de la pharmacocinétique, mais bien que JMP puisse adapter des équations dans ce domaine, il ne gère pas (à ma connaissance):
- patients avec différents schémas posologiques
- patients avec différents calendriers d'échantillonnage
- la modélisation de régression non linéaire à effets mixtes, qui nécessite souvent de discerner les effets fixes et aléatoires.
Si vous entendez l'un de ces trois, il est probablement préférable de le recommander en combinaison avec SAS.
https://community.jmp.com/t5/JMP-Scripts/Nonlinear-Degradation-Mixed-Model/ta-p/21367 Pas PK mais un exemple de combinaison de SAS PROCNLMIXED et JMP.
J'espère que cela pourra aider.
Sincères amitiés,
Ben
Re: JMP pour l'immunologie?FWIW, j'ai utilisé l'outil de recherche Discovery Paper avec «test» et j'ai obtenu huit résultats. Ça vaut le coup de regarder, si vous ne l'avez pas déjà fait.
Re: JMP pour l'immunologie?Tu as raison, @ian_jmp , il y a beaucoup de succès .
Re: JMP pour l'immunologie?Voici un article amusant que je voulais intégrer à une démo. Il s'agit d'une analyse des seuils dans les tests d'immunogénicité. C'est assez sympa en ce sens qu'il a un tas de méthodes différentes montrées (qui semblaient toutes possibles dans JMP). Plus important encore, il comprend les données pour les exemples dans le PDF ... qui vous permettent également de faire une démonstration de l'importation de PDF.
Re: JMP pour l'immunologie?Merci @chris_kirchberg , @Byron_JMP , @ian_jmp , @benfrancis , @Jeff_Perkinson et @MikeD_Anderson .
Tout cela est vraiment utile.
Je dois vérifier auprès du client.Nous avons beaucoup d'exemples sur le développement et la surveillance des tests, ce à quoi je m'attendais. Mais je pense que ce qu'ils veulent vraiment, c'est un exemple qui montre comment ils pourraient examiner les données cliniques lorsqu'ils effectuent les tests dans leurs essais. Je suppose que ce n'est pas une surprise que nous n'ayons pas ce genre de données.
Merci encore,
Phil
Re: JMP pour l'immunologie?Je pense que "Cholesterol Stacked" pourrait être un exemple utile.
