JMP Genomics - ANOVA vs deseq2Hola. Soy nuevo en el análisis de datos de JMP Genomics y RNA-Seq. Parece que JMP Genomics 10 implementa ANOVA como un medio para determinar datos diferenciales de expresión génica. Sin embargo, la gran mayoría de los estudios de expresión del gen RNA-Seq utilizan deseq2 o paquetes R similares. ¿Alguien ha hecho una comparación (o conoce un informe publicado) que compare los dos métodos? ¿Cuáles son los pros y los contras?
Seguimiento... ¿Hay alguna forma de implementar deseq2 en JMP Genomics?
La personalización en masa