Insegno statistica nel mio programma di laurea in psicologia e il mio approccio consiste nell'usare contrasti ortogonali per analizzare i progetti ANOVA. (Vedere questo libro tra gli altri.)
L'opzione "LSMeans Contrasts" nella sezione più a destra dell'output è un modo fantastico per analizzare i dati in questo modo senza dover creare codici di contrasto nelle colonne JMP. Comincio con i contrasti dell'effetto principale e poi capisco come costruire le interazioni assumendo che sto moltiplicando gli effetti principali, ottenendo così i segni giusti.
Funziona quasi perfettamente. Tutte le statistiche inferenziali sono giuste. L'unica cosa che è disattivata, solo per le interazioni, sono le stime effettive degli effetti dell'interazione. Allego un pdf di una mia diapositiva che mostra, a sinistra, la via diretta con codici di contrasti analizzati tramite regressione multipla. A destra, mostra l'output utilizzando "LSMeans Contrasts". L'effetto stimato a destra è la metà di quello che dovrebbe essere.

In un altro esempio che ho appena fatto (con un design 2x3), si verifica lo stesso errore.
Nell'improbabile caso che qualcuno lo stia seguendo con comprensione e preoccupazione, qualche idea?