JMP Pro中的火山圖參數我們沒有JMP Clinical或Genomic，因此根據本文，我們正在使用JMP Pro創建火山圖：
如何在JMP中建立火山圖！
大多數火山圖差異都將x軸稱為倍數變化或log2（倍數變化）。 本文中的術語使用“差異”。 它還表明僅使用差異而不是相對實際差異。
在Wiki文章中倍數變化，也有提及相對變化。
在JMP上下文中，所有這些術語如何與倍數變化或log2（倍數變化）相關？
其他回复：JMP Pro中的火山圖參數你好@mjmg ，
歡迎來到社區！
倍數變化和Log2（倍數變化）都是差異度量（相當於博客文章中的差異），範圍從負到正，中心為零。 因此，在創建火山圖時，它將在x軸上顯示。
儘管“火山圖”是通常用於基因組數據分析可視化的統計圖，但它可能更廣泛地應用於其他數據和行業。 我們想要概括其應用程序，並從像響應篩選之類的JMP平台開始，以獲得那些差異並記錄大量數據的記錄（p值），以便繪製火山圖。
如果沒有倍數更改或log2（倍數更改），則可以使用響應篩選平台生成它們。 在使用響應篩選之前，我將從數據的log2開始。 然後，當您選擇比較均值時，它們將是log2（倍數變化）值。
有幫助嗎？
最終，無論您從何處獲得都可以。生成倍數變化或p值。 您可以使用圖形生成器在JMP中繪製圖。
回复：JMP Pro中的火山圖參數@chris_kirchberg感謝您為使火山地帶成為主流而付出的努力，但我對術語還是有些困惑。 希望您的團隊可以使生成的火山圖更加簡化或得到更好的解釋。
主要是我需要查找JMP火山圖生成的數據的方向（無論是ControlGroup-NotControlGroup還是NotControlGroup-ControlGroup；是左側還是右側的ControlGroup，等等...），設置倍數變化或差異x軸上的閾值可與已發表的參考文獻相比較（x1或x2倍數變化或log2（倍數變化）= +/- 1）。 使用術語“差異”時，從教程中得到的解釋不是很清楚，它等同於折疊更改或log2（折疊更改）？
我的數據沒有經過log2轉換，但是我正在處理標準化（相對於參考），居中和自動縮放的數據。 因此，最好對我的數據進行log2轉換，即使它已經進行了標準化，居中和自動縮放，也將log2轉換包括在預處理過程中，因此Difference參數直接等於log2的倍數變化？
