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question très difficile

Salut,

J'utilise ImageJ qui donne l'image du bas.

 

Avec le résultat du ROI d'ImageJ, je peux créer un graphique à bulles qui est l'image du haut.

J'aimerais que les formes des points noirs soient aussi proches que possible de l'image du bas.

 

Quelqu'un peut-il donner une solution ?

 

Je continuerai à le chercher avec les 25 réglages d'imageJ.

 

cordialement

Personnalisation de masseRe : question très difficile

Dessiner l'ellipse ne semble pas trop difficile, mais je ne sais pas comment vous obtiendrez la variété de formes affichées dans votre graphique d'origine à partir des autres paramètres. ( Ellipse n'a aucun rapport mais dessine une ellipse avec des axes majeurs et mineurs inclinés par rapport aux axes XY.)

Re : question très difficile

cher Craige,

 

quelques informations.

 

Superficie, Fraction de Surface et Périmètre : superficie, proportion de la superficie du roi (Region Of Interest) par rapport à l'image et au périmètre de la région. L'information est donnée en pixels/pixels2 sauf si l'image a été préalablement calibrée en distance avec la fonction Image/propriétés.

Valeur de gris moyenne/modale/min et maximale, écart type, densité intégrée et médiane : rapports sur les intensités de pixels dans la zone d'intérêt.

Centroïde et Centre de Masse : renvoie les coordonnées respectives du centre géométrique et du centre d'intensité de la ROI.

Rectangle englobant : caractéristiques du plus petit rectangle pouvant englober le retour sur investissement. Cette option renvoie les coordonnées du coin supérieur gauche du rectangle ainsi que sa largeur et sa hauteur.

Ajuster l'ellipse : ajuste une ellipse sur la région d'intérêt et renvoie la longueur des deux axes de l'ellipse (majeur et mineur), ainsi que l'angle du grand axe avec l'horizontale.

Descripteurs de forme : calculer :

 

• Circularité : (4 x surface)/(périmètre)2.
• Rapport d'aspect : après réglage de l'ellipse, grand axe/petit axe.
• Rondeur : après ajustement de l'ellipse, (4 x surface)/ (π x grand axe2).
• Solidité : aire/aire de l'enveloppe convexe.

Diamètre du féret : plus grande distance entre 2 points situés sur le périmètre de la région.

Kurtosis : caractérise la forme de la distribution des intensités du ROI. Un kurtosis positif indique une distribution relativement nette, un kurtosis négatif signale une distribution relativement aplatie.

Position pile : renvoie le numéro de la coupe sur laquelle la mesure est effectuée.

 

 

 

 

Re : question très difficile

Cela fait beaucoup de colonnes ! Décrivent-ils la forme des régions ? Si tel est le cas, vous pouvez écrire un script graphique qui les dessine.

I'm not familiar with the meaning of the column names.Je ne connais pas la signification des noms de colonnes.

Re : question très difficile

pas exactement.

 

Je joins le fichier jmp avec le script du graphique.

le but est de avoir les formes proches de la photo d'ImageJ.

Re : question très difficile

Quelque chose comme ce tracé à partir des données de l'iris ?

Re : question très difficile

Je suis désolé, mais je ne comprends pas très bien ce que vous demandez. Mais si cela peut aider (et grâce à @danschikore . . . ) le formes utilisées par le tracé à bulles il ne faut pas nécessairement que ce soit simplement des cercles.

Re : question très difficile

avec les images.