SVDと複数のカテゴリ予測子を使用した「ワイド」PLS92,000列(遺伝子)x 12行(サンプル)のテーブルがあり、PLSを使用して治療効果をモデル化したいと考えています。 ただし、私の治療法(原産地と温度)はカテゴリカルです。 判別分析を使用する場合、一度に1つしかテストできません。 Fit ModelプラットフォームでPLSを使用すると、完全な階乗予測モデルを実行できますが、SVDがないため(おそらく)、分析がクラッシュします。 判別分析ではないPLSのようなプラットフォームにSVDに似たものはありますか? あるいは、判別分析に複数の予測子(X)を含めることは可能ですか? テーブルを取り付けました。 理想的には、92,960個の遺伝子すべてをYとし、起源、温度、およびそれらの相互作用を予測因子(3項)として持つことになります。 たぶん私のコンピュータは古すぎます(1.7Ghzプロセッサを搭載した8GBのRAM)! 私がやりたいことは、JMPゲノミクスでしか達成できないのではないかと思います(これは、うっとうしいことに、マイアミ大学が私のしつこい後でも購入を拒否します!)。
分析Re:SVDと複数のカテゴリ予測子を使用した「ワイド」PLSあなたの選択肢の1つは、ペナルティ付き回帰法の1つである可能性がありますか? それらはSVDを使用しませんが、異なる分析の観点から変数削減の問題に直面します... PLSに組み込まれている次元削減ではありません。 バックグラウンドに「適合する」モデルの数が原因で、コンピューターがまだハングする可能性があります...しかし、試してみる価値はありますか?