3DPCAヘルプたぶんばかげたPCAの質問：安全のために、異なるプログラム間でPCAグラフィック出力を比較したいと思います。以前は、各ランドマークのx、y、z空間ポイントをRにアップロードし、PCAを実行して、プロットやスコアなどを表示していました。しかし、同じデータセットを再実行すると、Rで奇妙な結果が得られ始めました（比較したいヘンチ）。x、y、z値をJMPにアップロードし、[分析]> [多変量メソッド]> [主成分]を選択すると、ポイントが通常の値として扱われているように見えます。これらのランドマークは高度に3Dのオブジェクトからのものですが、JMP PCAでは、3Dグラフィック出力にすべての標本がほぼ1つの平面上にあります。（これはRで行われた出力とは100％異なって見えます）では、PCスコアをJMPにアップロードして、そこから分析を実行できますか？（または、それはどういうわけか、すでにスコアから派生した新しいスコアを生成しているのでしょうか？）何か足りないもの、またはより良い代替案がある場合は、あらゆるアドバイス/支援をいただければ幸いです。
Re：3DPCAヘルプわかりましたが、Excelテーブルで意味をなさないのは、各標本の36個の3Dランドマーク（X1、Y1、Z1、X2、Y2、Z2など）のそれぞれに主成分スコアがあるように見える理由です。それはPCAがどのように機能するかではありません。
PCAは、主に変数削減手法として使用されます。したがって、通常、多数の変数を少数のPCに減らします。次に、各PCのスコアを、観測（または標本）のより簡単な説明として使用できます。
または、PCAを使用して、変数間の相関を理解します。
PCAを使用する目的がここにあるのかわかりません。
ごめんなさい！Re：3DPCAヘルプうまくいけば、私は物事を明確にすることができます。標本ごとに、36の3Dランドマーク（X1、Y1、Z1、X2、Y2、Z2など）があります。私が最初に空間座標を取得するために使用したプログラム（ランドマークと呼ばれるプログラム）では、出力は、データセット全体をX、Y、およびZ列で配置し、行がランドマークを構成することでした。私が最初にその形式のデータセットをアップロードしようとしたとき、JMPは各行（つまり各ランドマーク）を個別の標本として読み取っていました。以前のJMPコミュニティの投稿で助けを求めたとき、各標本を変換するようにアドバイスされ、そのすべてのX、Y、Zポイントが1行になりました（108行の下位エントリをヘンチします）。次に、出力3Dグラフが空間ポイントの散布図を作成しているだけであることがわかりました。たとえば、これらの空間次元では、3D座標が1,2,3のランドマークと、3,4,5のランドマークが文字通りプロットされていました。PCの値。
そこで、そこから、Rで取得したデータセットからPC値を取得し、それらを「JMP変換」しました（標本を構成する行とそのすべてのPCスコア）。物理的な標本は手元にありますが、PCAを介してそれらの空間的な関係を比較したいと思います。そのため、前のコメントで述べたJMPで3D PCAを表示する手順を実行しても問題ないと思いましたが、先に進む前に再確認したいと思いました。
Re：3DPCAヘルプ申し訳ありませんが、データがわかりません。このデータセットには109個の変数があるようです（標本を含む）。各標本に36の異なるXYZ値があるのはなぜですか。また、PCAでこれらの変数を使用してPCAスコアタブに109の変数を作成する方法を教えてください。実際、基本に戻って、分析の目的とPCAの使用目的を尋ねた方がよい場合があります。Re：3DPCAヘルプフィルに感謝します。3Dプロットの場合、主成分スコアからx、y、z座標を視覚化します。わかりやすくするために、Excelスプレッドシートを添付しました。各標本の各ランドマークの空間x、y、z座標である1つのタブが表示されます。2番目のタブは、各ランドマークのPCスコアです。PCスコアから導き出された3D空間関係を視覚化したいのですが、グラフを作成するために実行する手順が適切な順序であることを確認したいと思います。
Re：3DPCAヘルプこんにちは、
何かを明確にできますか-3Dプロットで、x、y、z、座標、または主成分スコアを視覚化しようとしていますか？
主成分スコアは平面上にあると思います。PCAについての1つの考え方は、それが次元削減手法であるということです。これは、JMPのPCAの3Dスコアプロットに表示されているものです。「高度に3D」のバリエーションは、最初の2つの主成分で2Dのバリエーションに削減されました。
それは理にかなっていますか？
あなたがそれを共有することができればあなたのデータを見て幸せです。
乾杯、
フィル
