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Comparaison du taux de mortalité / survie entre les traitements

Quelle est la meilleure méthode pour analyser les données en pourcentage de mortalité ou en pourcentage de survie (100-mortalité)? Je fournis un ensemble de données simulé. Je place 20 animaux dans une cage et à la fin de l'étude je compte le nombre d'animaux vivants et la différence par rapport à 20 correspond aux animaux morts. La conception expérimentale est une conception de bloc aléatoire complète et je souhaite utiliser le bloc comme un effet aléatoire, une covariable ou une autre suggestion. L'heure de la mort n'a pas d'importance et j'ai donc du mal à utiliser les outils de survie JMP. Je veux savoir s'il existe une différence statistique de mortalité ou de taux de survie (en pourcentage) entre les 3 traitements. Si je calcule à la main le taux de survie_% est: Contrôle = 97%, Médicament = 88%, Placebo = 79,5%; et donc mortalité_% est: Contrôle = 3%, Médicament = 12%, Placebo = 20,5%.

Veuillez fournir des instructions étape par étape (par exemple, Analyser> Ajuster le modèle> etc.) ou des images.

Merci,

 

Traitement du bloc de cage Initial_count Final_count Survival_% Deaths Mortality_%
1 1 Médicament 20 20100 0 0
2 1 Contrôle 20 19 95 1 5
3 1 Placebo 20 16 80 4 20
4 2 Placebo 20 17 85 3 15
5 2 Médicament 20 16 80 4 20
6 2 Contrôle 20 20100 0 0
7 3 Contrôle 20 19 95 1 5
8 3 Placebo 20 15 75 5 25
9 3 Médicament 20 18 90 2 10
10 4 Placebo 20 14 70 6 30
11 4 Contrôle 20 20100 0 0
12 4 Médicament 20 19 95 1 5
13 5 Placebo 20 15 75 5 25
14 5 Contrôle 20 20100 0 0
15 5 Médicament 20 17 85 3 15
16 6 Médicament 20 18 90 2 10
17 6 Placebo 20 17 85 3 15
18 6 Contrôle 20 20100 0 0
19 7 Placebo 20 16 80 4 20
20 7 Médicament 20 18 90 2 10
21 7 Contrôle 20 20100 0 0
22 8 Médicament 20 17 85 3 15
23 8 Placebo 20 16 80 4 20
24 8 Contrôle 20 19 95 1 5
25 9 Contrôle 20 18 90 2 10
26 9 Drogue 20 17 85 3 15
27 9 Placebo 20 16 80 4 20
28 10 Placebo 20 17 85 3 15
29 10 Médicament 20 16 80 4 20
30 10 Contrôle 20 19 95 1 5

AnalytiqueRe: Comparaison du taux de mortalité / survie entre les traitements

Ce cas est une application classique de «l'analyse probit».

 

1. Sélectionnez Analyser> Ajuster le modèle.
2. Sélectionnez Nombre initial et Nombre final (dans cet ordre), puis cliquez sur O.
3. Sélectionnez les autres colonnes de données que vous souhaitez utiliser comme facteurs et cliquez sur Ajouter.
4. Cliquez sur Personnalité et sélectionnez Modèle linéaire généralisé.
5. Cliquez sur Distribution et sélectionnez Binomial.
6. Cliquez sur Lier et sélectionnez Probit.
7. Cliquez sur Exécuter.

 

Ça devrait le faire.

 

Je dois dire que ce processus est en arrière: collecter les données et ensuite décider de l'analyse. Le choix de l'analyse doit dicter la collecte des données.

 

J'espère que ces instructions vous aideront!

Re: Comparaison du taux de mortalité / survie entre les traitements

@markbailey Merci pour la suggestion. Malheureusement cela ne fonctionne pas, j'ai essayé la distribution binomiale sans résultats positifs; il n'accepte pas de variable aléatoire ou de covariable. Veuillez essayer d'utiliser le jeu de données simulé que j'ai fourni pour voir si vous pouvez trouver une suggestion. À votre santé,

Re: Comparaison du taux de mortalité / survie entre les traitements

Vous avez raison. La plateforme GLM n'accepte pas les conditions pour les effets aléatoires. La plateforme JMP Pro Mixed Model n'accepte pas les distributions d'erreurs anormales.