如何設定檔案並在 jmp 中執行重複測量變異數分析?
我做了一個實驗,追蹤動物在三種治療中隨時間推移的移動距離(NCS n=25;CS1 n=24;CS6 n=25)。 我計算了每組每 1 分鐘的平均距離,並將其繪製為三個治療組的圖表。 我想做重複測量變異數分析,但不確定如何在 jmp 中設定並運行它。 我想我會使用原始數據而不是平均值,並每 1 分鐘間隔進行一次新測試。 但有件事告訴我,我需要同時取得 jmp 檔案中整個圖形的所有資料。
我想知道我的兩個治療組(CS1h 和 CS6h)是否與我的對照組 (NCS) 不同。 我想知道總的線路是否不同,以及每個單獨的時間點是否不同。 我查看了文獻,似乎重複測量變異數分析是要做的統計。
我也不確定,因為我的一些動物在某一分鐘內移動了 0 毫米,這是否會成為統計數據的問題。
我對 jmp 比較陌生,找不到重複測量變異數分析的教程,所以我不確定要按什麼按鈕。任何幫助,將不勝感激。 我已附上文件和圖片。
感謝您解釋所有這些並幫助我處理數據。 來回答你的問題..
每個處理都會「運行」多次。這些是多種動物嗎? 還是同一種動物在不同的時間段「奔跑」?
我將一隻動物放入競技場 10 分鐘並追蹤它的運動。 例如,animal1 在第一分鐘內移動了 196mm,在 min1 和 min2 之間,animal1 移動了 1595mm,等等。 因此,每個數據點都是 1 分鐘時間範圍內行駛的毫米數的總和。 對於 NCS 治療組,我有 24 隻不同的動物接受了相同的治療。 對於 CS1 治療組,我有 24 隻不同的動物接受了這種治療。 對於 CS6 治療組,我有 25 隻不同的動物。 因此,治療組合是相同的,並且有多個數據點,因此這些是重複的,正如您所說。
看起來你平均了這些?為什麼?
我對個人沒那麼感興趣。 我最感興趣的是治療如何影響運動。 這就是為什麼我會對它們進行平均,以便我可以在治療組之間進行比較。 這些似乎是該領域其他人在文獻中發表的內容。 (例如:Lind 等人 2005 年記錄豬隻運動行為的數位視訊追蹤系統驗證中的圖 4)
在對它們進行平均之前,您是否查看了治療內的變化?
我知道治療組內有相當大的差異,這就是為什麼我有相當大的誤差線。 我還知道我的數據不是正態分佈的,這就是為什麼我考慮進行弗里德曼等級測試。 然而,文獻中的其他人做了重複測量變異數分析,或至少是他們沒有指定的某種變異數分析(例如:Martin 2004 中的圖 2B A Portrait of locomotor behavior in果蠅由視訊追蹤範例確定)我認為,由於我的樣本量超過 20,因此可以進行參數測試而不是非參數測試(弗里德曼等級)。 你同意?
在總結之前始終尋找不尋常的數據點。
我知道在幾分鐘內,給定的動物可能根本不會移動(行進 0 毫米)。 這會導致較大的最大/分鐘和較大的誤差線,但由於它發生在所有治療組中,我認為可以對每個治療組每分鐘的數據進行平均。
10分鐘內的數據平均:我有一個不同的圖表來體現這個想法(附有方框圖和須狀圖)
標準差:我沒有報告這個數字,但我確實在錯誤欄中顯示了 SEM
最小和最大:我在我的方框圖和晶須圖中顯示了這一點,它與我現在正在處理的折線圖是分開的
線的斜率:我認為研究這一點很有趣,因為隨著時間的推移,所有群體的動物似乎都傾向於減少移動。 我可能必須找到最適合的線。
感謝您向我展示如何在發送給我的堆疊文件中設定資料。 這非常有幫助。
“JMP 提供了多種分析重複測量的方法:多變量重複測量方法、單變量裂區方法,以及透過 JMP® Pro 的附加功能,可以在擬合模型平台中使用混合模型個性執行此類分析。”我不確定使用這些方法中的哪一個。 如果您知道自己在做什麼,那麼新增全因子重複測量變異數分析可能會有所幫助。 我計劃學習如何使用它,因為我還有 35 個與此圖表非常相似的圖表,我需要對其進行統計。
非常感謝您的幫忙。 對此,我真的非常感激。
這個問題很常見。 請閱讀本 JMP 技術說明,了解重複措施。
凱特,一些問題/評論...每個治療都“運行”多次。 這些是多種動物嗎? 還是同一種動物在不同的時間段「奔跑」? 這些可能是獨立事件,因此可以在模型中使用。 看起來你平均了這些? 為什麼? 在對它們進行平均之前,您是否查看了治療內的變化? 在總結之前始終尋找不尋常的數據點。
關於重複數據點,我的想法如下:
1. 重複的問題始終與治療的效果有關。 如果治療組合相同且您有多個數據點,那麼通常這些都是重複的。 這些不應被視為獨立事件。 如果處理在資料點之間發生變化,我們將這些實驗單位稱為實驗單位,並且可以將其視為獨立事件。
2. 如何處理多個數據點的問題沒有明確的答案。 這取決於您希望這些數據點定量描述什麼。 以下是一些可能性:
- 取數據的平均值(10 分鐘內)。 這描述了10分鐘資料的集中趨勢。
- 取資料的標準差。 這描述了與 10 分鐘相關的變化。
- 取最小值或最大值。 可能要看看治療的極端情況。
- 取穿過資料的線的斜率。 這可能描述了變化率。
3. 為了獲得總計統計數據,您可以堆疊 10 分鐘的列,然後透過處理總計堆疊的列。
我附上了堆積和匯總的數據表。