如何设置文件并在 jmp 中运行重复测量方差分析?
我做了一个实验,跟踪动物在三种治疗中随时间推移的移动距离(NCS n=25;CS1 n=24;CS6 n=25)。 我计算了每组每 1 分钟的平均距离,并将其绘制为三个治疗组的图表。 我想做重复测量方差分析,但不确定如何在 jmp 中设置并运行它。 我想我会使用原始数据而不是平均值,并每 1 分钟间隔进行一次新测试。 但有件事告诉我,我需要同时获取 jmp 文件中整个图形的所有数据。
我想知道我的两个治疗组(CS1h 和 CS6h)是否与我的对照组 (NCS) 不同。 我想知道总的线路是否不同,以及每个单独的时间点是否不同。 我查看了文献,似乎重复测量方差分析是要做的统计。
我也不确定,因为我的一些动物在某一分钟内移动了 0 毫米,这是否会成为统计数据的问题。
我对 jmp 比较陌生,找不到重复测量方差分析的教程,所以我不确定要按什么按钮。任何帮助,将不胜感激。 我已附上文件和图片。
感谢您解释所有这些并帮助我处理数据。 来回答你的问题..
每个处理都会“运行”多次。这些是多种动物吗? 或者同一种动物在不同的时间段“奔跑”?
我将一只动物放入竞技场 10 分钟并跟踪它的运动。 例如,animal1 在第一分钟内移动了 196mm,在 min1 和 min2 之间,animal1 移动了 1595mm,等等。 因此,每个数据点都是 1 分钟时间范围内行驶的毫米数的总和。 对于 NCS 治疗组,我有 24 只不同的动物接受了相同的治疗。 对于 CS1 治疗组,我有 24 只不同的动物接受了这种治疗。 对于 CS6 治疗组,我有 25 只不同的动物。 因此,治疗组合是相同的,并且有多个数据点,因此这些是重复的,正如您所说。
看起来你平均了这些?为什么?
我对个人没那么感兴趣。 我最感兴趣的是治疗如何影响运动。 这就是为什么我对它们进行平均,以便我可以在治疗组之间进行比较。 这些似乎是该领域其他人在文献中发表的内容。 (例如:Lind 等人 2005 年记录猪运动行为的数字视频跟踪系统验证中的图 4)
在对它们进行平均之前,您是否查看了治疗内的变化?
我知道治疗组内存在相当大的差异,这就是为什么我有相当大的误差线。 我还知道我的数据不是正态分布的,这就是为什么我考虑进行弗里德曼等级测试。 然而,文献中的其他人做了重复测量方差分析,或者至少是他们没有指定的某种方差分析(例如:Martin 2004 中的图 2B A Portrait of locomotor behavior in果蝇由视频跟踪范例确定)我认为,由于我的样本量超过 20,因此可以进行参数测试而不是非参数测试(弗里德曼等级)。 你同意?
在总结之前始终寻找不寻常的数据点。
我知道在几分钟内,给定的动物可能根本不会移动(行进 0 毫米)。 这会导致较大的最大/分钟和较大的误差线,但由于它发生在所有治疗组中,我认为可以对每个治疗组每分钟的数据进行平均。
10分钟内的数据平均:我有一个不同的图表来体现这个想法(附有方框图和须状图)
标准差:我没有报告这个数字,但我确实在错误栏中显示了 SEM
最小和最大:我在我的方框图和晶须图中显示了这一点,它与我现在正在处理的折线图是分开的
线的斜率:我认为研究这一点很有趣,因为随着时间的推移,所有群体的动物似乎都倾向于减少移动。 我可能必须找到最适合的线。
感谢您向我展示如何在发送给我的堆叠文档中设置数据。 这非常有帮助。
“JMP 提供了多种分析重复测量的方法:多变量重复测量方法、单变量裂区方法,以及通过 JMP® Pro 的附加功能,可以在拟合模型平台中使用混合模型个性执行此类分析。”我不确定使用这些方法中的哪一个。 如果您知道自己在做什么,那么添加全因子重复测量方差分析可能会有所帮助。 我计划学习如何使用它,因为我还有 35 个与此图表非常相似的图表,我需要对其进行统计。
非常感谢您的帮助。 对此,我真的非常感激。
这个问题很常见。 请阅读本 JMP 技术说明,了解重复措施。
凯特,一些问题/评论...每个治疗都“运行”多次。 这些是多种动物吗? 或者同一种动物在不同的时间段“奔跑”? 这些可能是独立事件,因此可以在模型中使用。 看起来你平均了这些? 为什么? 在对它们进行平均之前,您是否查看了治疗内的变化? 在总结之前始终寻找不寻常的数据点。
关于重复数据点,我的想法如下:
1. 重复的问题始终与治疗的效果有关。 如果治疗组合相同并且您有多个数据点,那么通常这些都是重复的。 这些不应被视为独立事件。 如果处理在数据点之间发生变化,我们将这些实验单位称为实验单位,并且可以将其视为独立事件。
2. 如何处理多个数据点的问题没有明确的答案。 这取决于您希望这些数据点定量描述什么。 以下是一些可能性:
- 取数据的平均值(10 分钟内)。 这描述了10分钟数据的集中趋势。
- 取数据的标准差。 这描述了与 10 分钟相关的变化。
- 取最小值或最大值。 可能要看看治疗的极端情况。
- 取穿过数据的线的斜率。 这可能描述了变化率。
3. 为了获得汇总统计数据,您可以堆叠 10 分钟的列,然后通过处理汇总堆叠的列。
我附上了堆积和汇总的数据表。