Wie richte ich die Datei ein und führe eine ANOVA mit wiederholten Messungen in jmp aus?
Ich habe ein Experiment durchgeführt, bei dem ich die zurückgelegte Distanz der Tiere im Laufe der Zeit für drei Behandlungen verfolgt habe (NCS n=25; CS1 n=24; CS6 n=25). Ich habe die durchschnittliche Distanz für jede Gruppe für jeden 1-Minuten-Zeitraum ermittelt und sie für meine drei Behandlungsgruppen grafisch dargestellt. Ich würde gerne eine ANOVA mit wiederholten Messungen durchführen, bin mir aber nicht sicher, wie ich diese in jmp einrichten und ausführen soll. Ich denke, ich würde die Rohdaten anstelle des Durchschnitts verwenden und für jedes 1-Minuten-Intervall einen neuen Test durchführen. Aber irgendetwas sagt mir, dass ich alle Daten für das gesamte Diagramm gleichzeitig in der JMP-Datei haben muss.
Ich möchte wissen, ob sich meine beiden Behandlungsgruppen (CS1h und CS6h) von meiner Kontrollgruppe (NCS) unterscheiden. Ich würde gerne wissen, ob die Linie insgesamt unterschiedlich ist und auch, ob jeder einzelne Zeitpunkt unterschiedlich ist. Ich habe in der Literatur nachgeschaut und es scheint, dass die ANOVA mit wiederholten Messungen die richtige Statistik ist.
Ich bin mir auch nicht sicher, ob das ein Problem mit den Statistiken sein wird, da einige meiner Tiere in einer bestimmten Minute 0 Millimeter zurückgelegt haben.
Ich bin relativ neu bei jmp und konnte kein Tutorial für eine ANOVA mit wiederholten Messungen finden, daher bin ich mir nicht sicher, welche Tasten ich drücken soll.Jede Hilfe wäre dankbar. Ich habe Dateien und Bilder angehängt.
Vielen Dank, dass Sie mir das alles erklärt und mir mit meinen Daten geholfen haben. Um Ihre Fragen zu beantworten..
Sie lassen jede Behandlung mehrmals „durchlaufen“.Sind das mehrere Tiere? Oder „läuft“ dasselbe Tier über verschiedene Zeiträume?
Ich habe ein Tier für 10 Minuten in eine Arena gesetzt und seine Fortbewegung verfolgt. Beispielsweise legte Tier1 in der ersten Minute 196 mm zurück, und zwischen Min.1 und Min.2 legte Tier1 1.595 mm zurück, usw. Jeder Datenpunkt ist also eine Summe der während dieses 1-minütigen Zeitrahmens zurückgelegten Millimeter. Für die NCS-Behandlungsgruppe hatte ich 24 verschiedene Tiere, die die gleiche Behandlung erhielten. In der CS1-Behandlungsgruppe hatte ich 24 verschiedene Tiere, die diese Behandlung erhielten. Für die CS6-Behandlungsgruppe hatte ich 25 verschiedene Tiere. Die Behandlungskombination war also dieselbe und hatte mehrere Datenpunkte, es handelt sich also, wie Sie sagten, um Wiederholungen.
Es sieht so aus, als hätten Sie diese gemittelt?Warum?
Die einzelnen Personen interessieren mich nicht so sehr. Am meisten interessiert mich, wie sich die Behandlung auf die Fortbewegung auswirkt. Aus diesem Grund habe ich sie gemittelt, um einen Vergleich zwischen den Behandlungsgruppen durchführen zu können. Dies scheint das zu sein, was andere auf diesem Gebiet in der Literatur veröffentlichen. (Zum Beispiel: Abbildung 4 in Lind et al. 2005 „Validierung eines digitalen Video-Tracking-Systems zur Aufzeichnung des Bewegungsverhaltens von Schweinen“)
Haben Sie sich die Schwankungen innerhalb der Behandlung angesehen, bevor Sie sie gemittelt haben?
Ich weiß, dass es innerhalb einer Behandlungsgruppe ziemlich viele Unterschiede gibt, weshalb ich ziemlich große Fehlerbalken habe. Ich weiß auch, dass meine Daten nicht normalverteilt sind, weshalb ich darüber nachgedacht habe, einen Freedman's Rank-Test durchzuführen. Andere in der Literatur führten jedoch eine ANOVA mit wiederholten Messungen oder zumindest eine Art von ANOVA durch, die sie nicht spezifizierten (zum Beispiel: Abbildung 2B in Martin 2004 A Portrait of Locomotor Behaviour in Drosophila bestimmt durch ein Video-Tracking-Paradigma) Ich dachte, dass es in Ordnung wäre, einen parametrischen Test anstelle eines nichtparametrischen Tests (Freedman's Rank) durchzuführen, da meine Stichprobengröße über 20 lag. Sind Sie einverstanden?
Und achten Sie immer auf ungewöhnliche Datenpunkte, bevor Sie eine Zusammenfassung erstellen.
Ich weiß, dass sich ein bestimmtes Tier während einiger Minuten möglicherweise überhaupt nicht bewegt (0 mm zurückgelegt). Dies führt zu großen Max/Min-Werten und großen Fehlerbalken, aber da es in allen Behandlungsgruppen auftrat, hielt ich es für in Ordnung, die Daten für jede Behandlungsgruppe für jede Minute zu mitteln.
Mitteln Sie die Daten über einen Zeitraum von 10 Minuten : Ich habe ein anderes Diagramm, das diese Idee erfasst (angehängtes Box- und Whisker-Diagramm)
Standardabweichung : Ich melde diese Nummer nicht, aber ich habe den SEM in meinen Fehlerbalken angezeigt
Minimal Maximal : Ich zeige dies in meinem Box-and-Whisker-Diagramm, das von dem Liniendiagramm, an dem ich gerade arbeite, getrennt ist
Steigung der Linie: Ich denke, es wäre interessant, dies zu untersuchen, da es den Anschein hat, dass Tiere in allen Gruppen mit der Zeit dazu neigen, sich weniger zu bewegen. Ich müsste wahrscheinlich die am besten passende Linie finden.
Vielen Dank, dass Sie mir gezeigt haben, wie ich meine Daten in dem gestapelten Dokument, das Sie mir gesendet haben, einrichten kann. Das war sehr hilfreich.
„JMP bietet mehrere Methoden zur Analyse wiederholter Messungen: einen multivariaten Ansatz mit wiederholten Messungen, einen univariaten Split-Plot-Ansatz und über JMP® Pro eine zusätzliche Möglichkeit, eine solche Analyse mit der Mixed-Model-Persönlichkeit innerhalb der Fit-Model-Plattform durchzuführen.“ Ich bin mir nicht sicher, welche dieser Methoden ich verwenden soll. Es sieht so aus, als ob das Add-in „Full-Factorial-Repeated Measures ANOVA“ hilfreich sein könnte, wenn Sie wissen, was Sie tun. Ich habe vor, zu lernen, wie man es benutzt, da ich 35 weitere Diagramme habe, die diesem sehr ähnlich sind und für die ich Statistiken erstellen muss.
Vielen Dank für all Ihre Hilfe. Ich schätze es wirklich.
Kat, einige Fragen/Kommentare ... Sie lassen jede Behandlung mehrmals „durchlaufen“. Sind das mehrere Tiere? Oder „läuft“ dasselbe Tier über verschiedene Zeiträume? Dies sind möglicherweise unabhängige Ereignisse und können daher im Modell verwendet werden. Es sieht so aus, als hätten Sie diese gemittelt? Warum? Haben Sie sich die Schwankungen innerhalb der Behandlung angesehen, bevor Sie sie gemittelt haben? Und achten Sie immer auf ungewöhnliche Datenpunkte, bevor Sie eine Zusammenfassung erstellen.
Bezüglich der Wiederholungsdatenpunkte sind hier meine Gedanken:
1. Die Frage der Wiederholungen hat immer damit zu tun, was die Behandlungen bewirkt haben. Wenn die Behandlungskombination dieselbe war und Sie über mehrere Datenpunkte verfügen, handelt es sich in der Regel um Wiederholungen. Diese sollten nicht als unabhängige Ereignisse betrachtet werden. Wenn sich die Behandlungen zwischen Datenpunkten ändern, nennen wir diese experimentellen Einheiten und können als unabhängige Ereignisse behandelt werden.
2. Auf die Frage, was mit den mehreren Datenpunkten geschehen soll, gibt es keine endgültige Antwort. Es hängt davon ab, was diese Datenpunkte quantitativ beschreiben sollen. Hier sind einige Möglichkeiten:
- Nehmen Sie den Durchschnitt der Daten (über die 10 Minuten). Dies beschreibt die zentrale Tendenz der 10-Minuten-Daten.
- Nehmen Sie die Standardabweichung der Daten. Dies beschreibt die Variabilität bezogen auf die 10 Minuten.
- Nehmen Sie die Min- oder Max-Werte. Möglicherweise, um die Extreme der Behandlung zu betrachten.
- Nehmen Sie die Steigung der Geraden durch die Daten. Dies könnte die Änderungsrate beschreiben.
3. Um zusammenfassende Statistiken zu erhalten, können Sie die 10-Minuten-Spalten stapeln und dann die gestapelten Spalten nach Behandlung zusammenfassen.
Ich habe die gestapelten und zusammengefassten Datentabellen angehängt.
