Come posso impostare il file ed eseguire un'ANOVA a misure ripetute in jmp?
Ho fatto un esperimento in cui ho monitorato la distanza percorsa dagli animali nel tempo per tre trattamenti (NCS n=25; CS1 n=24; CS6 n=25). Ho preso la distanza media per ciascun gruppo per ogni periodo di 1 minuto e l'ho rappresentata graficamente per i miei tre gruppi di trattamento. Vorrei eseguire un'ANOVA a misure ripetute ma non sono sicuro di come impostarlo in jmp ed eseguirlo. Penso che utilizzerei i dati grezzi invece della media e farei un nuovo test per ogni intervallo di 1 minuto. Ma qualcosa mi dice che ho bisogno di tutti i dati dell'intero grafico nel file jmp contemporaneamente.
Voglio sapere se i miei due gruppi di trattamento (CS1h e CS6h) sono diversi dal mio controllo (NCS). Vorrei sapere se la linea in totale è diversa e anche se ogni singolo punto temporale è diverso. Ho cercato in letteratura e sembra che le misure ripetute ANOVA siano la statistica da fare.
Inoltre, non sono sicuro, poiché alcuni dei miei animali hanno viaggiato di 0 millimetri durante un certo minuto, se questo sarà un problema con le statistiche.
Sono relativamente nuovo in jmp e non sono riuscito a trovare un tutorial per un'ANOVA a misure ripetute, quindi non sono sicuro di quali pulsanti premere.Qualsiasi aiuto sarebbe apprezzato. Ho allegato file e immagini.
Grazie per avermi spiegato tutto e avermi aiutato con i miei dati. Per rispondere alle tue domande..
Ogni trattamento viene "eseguito" più volte.Si tratta di più animali? Oppure lo stesso animale "corre" in periodi di tempo diversi?
Ho posizionato un animale in un'arena per 10 minuti e ne ho seguito i movimenti. Ad esempio, animale1 ha percorso 196 mm durante il primo minuto e tra min1 e min2 animale1 ha percorso 1595 mm, ecc. Quindi ogni punto dati è la somma dei millimetri percorsi durante l'intervallo di tempo di 1 minuto. Per il gruppo di trattamento NCS avevo 24 animali diversi che hanno ricevuto lo stesso trattamento. Per il gruppo di trattamento CS1 avevo 24 animali diversi che hanno ricevuto quel trattamento. Per il gruppo di trattamento CS6 avevo 25 animali diversi. Quindi la combinazione di trattamenti era la stessa e aveva più punti dati, quindi queste sono ripetizioni, come hai detto.
Sembra che tu abbia fatto la media di questi?Perché?
Non sono così interessato ai singoli individui. Sono molto interessato a come il trattamento influisce sulla locomozione. Ecco perché ho calcolato la media in modo da poter confrontare i gruppi di trattamento. Questi sembrano essere ciò che altri operatori del settore pubblicano in letteratura. (Ad esempio: Figura 4 in Lind et al 2005 Validazione di un sistema di tracciamento video digitale per registrare il comportamento locomotore dei suini)
Hai osservato la variazione all'interno del trattamento prima di calcolarne la media?
So che ci sono parecchie variazioni all'interno di un gruppo di trattamento, motivo per cui ho barre di errore piuttosto grandi. So anche che i miei dati non sono distribuiti normalmente, motivo per cui ho considerato di eseguire un test di Freedman's Rank. Tuttavia, altri in letteratura hanno eseguito un'ANOVA a misure ripetute o almeno una sorta di ANOVA che non hanno specificato (ad esempio: Figura 2B in Martin 2004 A Portrait of locomotor behavior in Drosophila determinato da un paradigma di tracciamento video) ho pensato che, poiché la dimensione del mio campione era superiore a 20, sarebbe stato corretto eseguire un test parametrico anziché un test non parametrico (Rank di Freedman). Sei d'accordo?
E cerca sempre punti dati insoliti prima di riassumere.
So che per alcuni minuti un dato animale potrebbe non muoversi affatto (0mm percorsi). Ciò comporta valori massimi/minuti elevati e barre di errore di grandi dimensioni, ma poiché si è verificato in tutti i gruppi di trattamento, ho pensato che fosse corretto calcolare la media dei dati per ciascun gruppo di trattamento per ogni minuto.
Media dei dati in 10 minuti : Ho un grafico diverso che cattura questa idea (riquadro allegato e grafico dei baffi)
Deviazione standard : Non riporto questo numero ma ho mostrato il SEM nelle mie barre di errore
Minimo Massimo : Lo mostro nel grafico a scatola e baffi che è separato dal grafico a linee su cui sto lavorando adesso
Pendenza della linea: Penso che sarebbe interessante esaminarlo poiché sembra che in tutti i gruppi gli animali tendano a muoversi meno col passare del tempo. Probabilmente dovrei trovare la linea più adatta.
Grazie per avermi mostrato come impostare i miei dati nel documento impilato che mi hai inviato. È stato molto utile.
"JMP offre diversi metodi per analizzare misure ripetute: un approccio multivariato a misure ripetute, un approccio univariato a diagramma diviso e una capacità aggiuntiva tramite JMP® Pro di eseguire tale analisi con la personalità del modello misto all'interno della piattaforma Stima modello." Non sono sicuro di quale di questi metodi utilizzare. Sembra che il componente aggiuntivo ANOVA Full-Factorial-Repeated Measures potrebbe essere utile se sai cosa stai facendo. Ho intenzione di imparare come usarlo poiché ho altri 35 grafici molto simili a questo per i quali devo fare le statistiche.
Grazie mille per tutto il tuo aiuto. Lo apprezzo molto.
Questa domanda è comune. Si prega di leggere questa nota tecnica JMP su misure ripetute .
Kat, alcune domande/commenti... Ogni trattamento viene "eseguito" più volte. Si tratta di più animali? Oppure lo stesso animale "corre" in periodi di tempo diversi? Questi sono possibilmente eventi indipendenti e quindi possono essere utilizzati nel modello. Sembra che tu abbia fatto la media di questi? Perché? Hai osservato la variazione all'interno del trattamento prima di calcolarne la media? E cerca sempre punti dati insoliti prima di riassumere.
Per quanto riguarda i dati ripetuti, ecco i miei pensieri:
1. La questione delle ripetizioni ha sempre a che fare con ciò che i trattamenti stavano facendo. Se la combinazione di trattamenti era la stessa e si dispone di più punti dati, in genere si tratta di ripetizioni. Questi non devono essere considerati eventi indipendenti. Se i trattamenti cambiano tra i punti dati, chiamiamo quelle unità sperimentali e possono essere trattati come eventi indipendenti.
2. La domanda su cosa fare con i molteplici punti dati non ha una risposta definitiva. Dipende da cosa vuoi che questi punti dati descrivano, quantitativamente. Ecco alcune possibilità:
- Prendi la media dei dati (nell'arco di 10 minuti). Questo descrive la tendenza centrale dei 10 minuti di dati.
- Prendi la deviazione standard dei dati. Questo descrive la variabilità relativa ai 10 minuti.
- Prendi i valori Min o Max. Forse per esaminare gli estremi del trattamento.
- Prendi la pendenza della linea che passa attraverso i dati. Questo potrebbe descrivere il tasso di cambiamento.
3. Per ottenere statistiche di riepilogo, è possibile impilare le colonne di 10 minuti e quindi riepilogare la colonna in pila per trattamento.
Ho allegato le tabelle dei dati impilate e riepilogate.
