Abbiamo un modello generico che utilizziamo per gli studi in serra che utilizza ripetizioni e sottocampioni come fattori casuali e nidificati. Alcuni dei tuoi fattori hanno sottocampioni e altri no. È dannoso includere il sottocampione casuale, fattore nidificato nel modello quando non esiste un sottocampione per quella particolare variabile?
No, non dannoso. Sarà solo stimato che abbia una componente di varianza pari a 0 e quindi non influirà sulla modellazione dei parametri fissi. Ovviamente è più corretto rimuoverlo dal modello, ma nella mia esperienza c'è pochissima differenza.
Quando si lavora con fattori casuali che SAPPIAMO avere componenti di varianza positiva "significativa" (quando sono stimabili), normalmente consiglio di rimuovere il segno di spunta in Componenti di varianza illimitata (nella finestra di dialogo Modello), poiché saranno quindi stimati a 0 e non (da possibilità) a qualcosa di negativo. I test sui parametri fissi saranno più corretti con i componenti di varianza illimitata, ma ancora una volta, nella mia esperienza, la differenza è molto piccola.
