Nous avons un modèle générique que nous utilisons pour les études de serre qui utilise des répétitions et des sous-échantillons comme facteurs aléatoires et imbriqués. Certains de vos facteurs ont des sous-échantillons et certains n'en ont pas. Est-il préjudiciable d'inclure le facteur aléatoire et imbriqué du sous-échantillon dans le modèle lorsqu'il n'y a pas de sous-échantillon pour cette variable particulière?
Non, pas préjudiciable. Il sera simplement estimé avoir une composante de variance de 0 et n'affectera donc pas la modélisation des paramètres fixes. Il est bien sûr plus correct de le supprimer du modèle, mais d'après mon expérience, il y a très peu de différence.
Lorsque nous travaillons avec des facteurs aléatoires, nous SAVONS qu'ils ont des composantes de variance positives «significatives» (lorsqu'elles sont estimables), je recommande normalement de supprimer la coche dans les composantes de variance non bornées (dans la boîte de dialogue du modèle), car elles seront alors estimées à 0 et non (par chance) à quelque chose de négatif. Les tests sur les paramètres fixes seront plus corrects avec les composants de variance illimités, mais encore une fois dans mon expérience, la différence est très faible.
